一、棉蚜地理種群重復(fù)序列引物擴(kuò)增DNA多態(tài)性分析(英文)（論文文獻(xiàn)綜述）
朱可心[1]（2021）在《遼寧省二化螟種群遺傳變異及腸道細(xì)菌多樣性研究》文中研究表明二化螟（Chilo suppressalis Walker）屬鱗翅目Lepidoptera,螟蛾科Pyralidae,是我國重要的水稻害蟲之一。種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)是害蟲綜合治理的重要研究內(nèi)容,利用微衛(wèi)星（SSR）分子遺傳標(biāo)記,通過對(duì)不同地理種群目標(biāo)害蟲遺傳變異及遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,從分子水平探討種群間遺傳進(jìn)化關(guān)系,對(duì)揭示其起源、擴(kuò)散路線與擴(kuò)散具有重要意義。鑒于目前遼寧省二化螟種群遺傳學(xué)研究尚屬空白,各地區(qū)蟲源關(guān)系不明確之實(shí)際問題,本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)解析該地區(qū)不同地理種群二化螟遺傳變異及譜系遺傳結(jié)構(gòu)。與此同時(shí),采用16S r DNA高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)不同地理種群的二化螟腸道細(xì)菌多樣性及群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行深入研究。上述研究有助于在分子水平上探討二化螟不同地理種群間的遺傳進(jìn)化關(guān)系與成災(zāi)機(jī)理,對(duì)因地制宜地指導(dǎo)該種害蟲的區(qū)域治理,具有重要理論和實(shí)踐意義。主要研究結(jié)果如下:1.利用12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),對(duì)我國北方典型二化螟發(fā)生區(qū),即遼寧省16個(gè)二化螟地理種群遺傳變異、遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行系統(tǒng)研究?？傮w上,12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)具有較高多態(tài)性;每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)平均等位基因數(shù)（Na）和有效等位基因數(shù)（Ne）分別為6.646和5.693。二化螟不同地理種群具有中度水平遺傳變異。所有種群中平均觀測(cè)雜合度（Ho=0.468）與平均期望雜合度（He=0.595）相似。清原（QY）種群遺傳多樣性水平最高（He=0.611）。與之相比較,北鎮(zhèn)（BZ）與興隆（XL）種群遺傳多樣性水平最低（He=0.532）。2.遼寧省二化螟不同地理種群間存在中度遺傳分化(0.004<FST<0.193)。種群中存在一定基因流（1.048<Nm<64.017）?；卩徑訕洌∟J）、貝葉斯聚類分析和主坐標(biāo)（PCo A）分析,發(fā)現(xiàn)遼寧省二化螟種群可分為3個(gè)遺傳分支,即遼西、遼東、北部和中部種群。距離隔離（Isolation-by-distance,IBD）和空間自相關(guān)分析（Spatial autocorrelation analysis）的研究結(jié)果表明,遺傳距離與地理距離不存在相關(guān)性。此外,瓶頸效應(yīng)（Bottleneck effect）結(jié)果表明,遼寧省二化螟種群并未經(jīng)歷嚴(yán)重的瓶頸效應(yīng)。3.利用16S r DNA高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)采自遼東、遼南、遼西、遼北及遼中5個(gè)具有代表性水稻產(chǎn)區(qū)的二化螟種群腸道細(xì)菌多樣性及群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究。結(jié)果表明,共獲得高質(zhì)量16S r DNA基因片段1,084,644條,平均長度418.44bp。按照97%的相似性閾值,共獲得1650個(gè)OTUs。鑒定出30個(gè)門,61個(gè)綱,159個(gè)目,296個(gè)科,697個(gè)屬。在門水平上,所有種群最優(yōu)勢(shì)菌皆為變形菌門Proteobacteria。此外,厚壁菌門Firmicutes、放線菌門Actinobacteria以及擬桿菌門Bacteroidetes相對(duì)豐度相對(duì)較高?；溉剩℉R）種群次優(yōu)勢(shì)菌為放線菌門,其余4個(gè)二化螟種群次優(yōu)勢(shì)菌為厚壁菌門。在屬水平上,鞘氨醇單胞菌屬Sphingomonas、鹽單胞菌屬Halomonas、Curvibacter、沙雷氏菌屬Serratia為優(yōu)勢(shì)菌屬。其中,鹽單胞菌屬Halomonas為東港（DG）種群最主要的優(yōu)勢(shì)菌屬,桓仁（HR）種群優(yōu)勢(shì)菌屬為沙雷氏菌屬Serratia,其它3個(gè)二化螟種群在屬水平上的最優(yōu)勢(shì)菌相同,為鞘氨醇單胞菌屬Sphingomonas。4.不同地理種群的二化螟腸道細(xì)菌多樣性與群落組成不同。北鎮(zhèn)（BZ）、遼陽（LY）及昌圖（CT）種群二化螟腸道細(xì)菌群落多樣性明顯高于遼東地區(qū)的東港（DG）和桓仁（HR）種群。PCA、PCo A及多樣本相似度樹狀圖結(jié)果一致,遼陽（LY）、昌圖（CT）和北鎮(zhèn)（BZ）種群的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似性較高,與東港（DG）和桓仁（HR）種群存在顯著差異。組間群落差異分析（LDA Effect Size,LEf Se）鑒定出北鎮(zhèn)（BZ）、昌圖（CT）和遼陽（LY）種群中有顯著作用的微生物類群。并且,腸道細(xì)菌群落組成與溫度、濕度等環(huán)境因子有關(guān)。根據(jù)與KEGG數(shù)據(jù)庫的對(duì)比結(jié)果顯示,不同地理種群的二化螟腸道細(xì)菌功能注釋結(jié)果基本一致,其中與膜轉(zhuǎn)運(yùn)、氨基酸代謝、碳水化合物代謝、DNA復(fù)制與修復(fù)相關(guān)的功能基因豐度較高。
李昕洋[2]（2020）在《遼寧省稻曲病菌生物學(xué)特性及遺傳多樣性研究》文中認(rèn)為稻曲病是一種水稻穗部真菌性病害,在我國南北方稻區(qū)均有發(fā)生,現(xiàn)已成為限制水稻高產(chǎn)和穩(wěn)產(chǎn)的主要障礙之一。本試驗(yàn)采用形態(tài)學(xué)觀察結(jié)合rDNA-ITS序列分析確定病原菌的種類、同源性及種內(nèi)群體分化狀況;利用菌絲生長速率法、孢子萌發(fā)法和相關(guān)性分析研究不同地區(qū)稻曲病菌的生物學(xué)特性;運(yùn)用重復(fù)序列PCR（repetitive element-based PCR,rep-PCR）技術(shù)和田間接種方法探索稻曲病菌的遺傳多樣性及致病力差異;使用單因素和正交設(shè)計(jì)建立稻曲病菌的最佳基于序列擴(kuò)增多態(tài)性（Sequence-Related Amplified Polymorphism,SRAP）的反應(yīng)體系和篩選SRAP多態(tài)性引物,應(yīng)用最佳SRAP反應(yīng)體系進(jìn)一步明確稻曲病菌種群多樣性遺傳水平,以上研究旨為稻曲病的綜合防控和抗病育種提供理論依據(jù),研究結(jié)果如下:遼寧省稻曲病菌分離及rDNA-ITS鑒定:2017年自遼寧省8個(gè)市區(qū)（沈陽市、鞍山市、盤錦市、大連市、丹東市、遼陽市、鐵嶺市、撫順市）采集273株稻曲病粒樣品,經(jīng)組織分離法或農(nóng)用鏈霉素洗滌法和單孢純化后共獲得159株供試菌株;選取63株代表菌株以通用引物ITS1和ITS4進(jìn)行PCR擴(kuò)增均能出現(xiàn)大小在500 bp750 bp內(nèi)的單一條帶;在NCBI上進(jìn)行BLAST比對(duì)發(fā)現(xiàn)與稻曲病菌同源性相似度達(dá)99%100%;經(jīng)MEGA 7構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹發(fā)現(xiàn)均處于同一分支。因此,結(jié)合形態(tài)學(xué)觀察和rDNA-ITS技術(shù)可明確所有供試菌株均為稻曲病菌Ustilaginoidea virens。供試菌株間遺傳距離變化范圍為0.0002.000,即不同的稻曲病菌rDNA-ITS序列在進(jìn)化過程中存在差異。遼寧省不同地區(qū)稻曲病菌的生物學(xué)特性比較:選取18株代表菌株的最適菌絲生長條件不同,在相同培養(yǎng)條件下,不同菌株的菌絲生長速率存在顯著差異。供試菌株的菌絲生長最適培養(yǎng)基為PDA（1株）、PSA（1株）、XBZ（1株）、Rice（2株）和OA（13株）;最適碳源為淀粉（14株）和蔗糖（4株）;最適氮源為酵母浸粉（17株）和蛋白胨（1株）;最適溫度為25℃（4株）、28℃（11株）和30℃（3株）;最適pH為4（8株）、5（1株）、6（5株）和7（4株）;最適光照條件為光照（3株）、黑暗（12株）和12 h光照/12 h黑暗（3株）。所有供試菌株的最適薄壁分生孢子萌發(fā)條件不同,在相同條件下,不同菌株的薄壁分生孢子萌發(fā)速率存在顯著差異。供試菌株的薄壁分生孢子萌發(fā)最適溫度為25℃（12株）和28℃（6株）;最適pH為6（3株）、7（13株）和8（2株）;最適光照條件為光照（4株）、黑暗（8株）和12 h光照/12 h黑暗（6株）。所有供試菌株的菌絲及薄壁分生孢子致死溫度分別為55℃和78℃。稻曲病菌的菌絲生長速率與不同碳源和溫度分別呈中度和低度相關(guān);稻曲病菌的菌落背面顏色與不同培養(yǎng)基、碳源、氮源、溫度和pH分別呈中度、低度、無、高度和低度相關(guān);其余均無統(tǒng)計(jì)意義。遼寧省稻曲病菌rep-PCR遺傳多樣性及致病力分析:根據(jù)BOX1/BOX2、ERIC1/ERIC2和REP1/REP2的3對(duì)引物遺傳多樣性值,故選取均大于0.7的BOX1/BOX2（0.764）和ERIC1/ERIC2（0.707）擴(kuò)增的DNA指紋圖譜進(jìn)行遺傳多樣性分析;當(dāng)DNA指紋相似系數(shù)為0.78時(shí),以BOX1/BOX2和ERIC1/ERIC2為引物擴(kuò)增的DNA指紋圖譜分別將供試菌株劃分為12個(gè)和10個(gè)遺傳類群;于2018年8月進(jìn)行稻曲病菌接種遼寧省主栽水稻品種鹽豐47試驗(yàn),根據(jù)平均每穗病粒數(shù)將供試菌株致病力可劃分為弱致病型、中等致病型和強(qiáng)致病型3個(gè)致病型,所占比例分別為33.33%、58.82%和7.85%,強(qiáng)致病型菌株僅在沈陽市、鞍山市和大連市出現(xiàn),所有優(yōu)勢(shì)類群均包含3種致病型菌株;表明遼寧省稻曲病菌遺傳結(jié)構(gòu)復(fù)雜,不同地理來源的稻曲病菌致病力存在一定差異,相同致病型的稻曲病菌分屬于不同的遺傳類群,同一遺傳類群中包含不同的致病型菌株。遼寧省稻曲病菌SRAP體系建立及遺傳多樣性分析:選取不同地理位置的3株代表菌株（SY-19、AS-3和DD-8）,從100對(duì)SRAP引物中篩選出多態(tài)性高的8對(duì)引物（Me1/Em6、Me2/Em2、Me2/Em4、Me2/Em6、Me3/Em7、Me4/Em3、Me5/Em6、Me6/Em5）;建立適用于稻曲病菌的最佳SRAP反應(yīng)體系(3.5 mmol/L Mg2+、3.5 U/μL TaqTM、200ng/μLDNA模板、0.4μmol/L引物和0.4 mmol/L dNTPs);根據(jù)方差分析中p值均小于0.05表明各因素對(duì)反應(yīng)體系均有顯著影響,根據(jù)方差分析中F值由高到低的順序表明Mg2+對(duì)反應(yīng)體系影響最大,DNA模板影響最小。利用最佳SRAP反應(yīng)體系對(duì)選取的78株代表菌株進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果如下:8對(duì)引物對(duì)供試菌株共擴(kuò)增出179個(gè)清晰的條帶,其中93個(gè)為多態(tài)性條帶,每對(duì)引物的擴(kuò)增條帶數(shù)在1827之間,平均為22;供試菌株等位基因觀測(cè)數(shù)、有效等位基因數(shù)、Nei’s基因多樣性指數(shù)和Shannon信息指數(shù)分別為2.000、1.4886、0.3248和0.5047;其中沈陽種群多樣性最高,鞍山種群多樣性最低;當(dāng)DNA指紋相似系數(shù)為0.88時(shí),以8對(duì)引物擴(kuò)增的DNA指紋圖譜將供試菌株劃分為14個(gè)類群。遼寧省稻曲病菌種群具有豐富的遺傳多樣性且SRAP遺傳類群劃分與地理來源不存在明顯的相關(guān)性。
任永麗[3]（2020）在《基于SSR標(biāo)記及mt DNA序列的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析》文中研究說明塔里木裂腹魚（Schizothorax biddulphi）是僅存在于新疆塔里木河水系的特有魚類,由于種群數(shù)目急劇下降,目前已處于瀕危狀態(tài)。鑒于此,掌握塔里木裂腹魚的群體遺傳結(jié)構(gòu)、親緣關(guān)系、歷史動(dòng)態(tài)和遺傳多樣性等方面的特征就很有必要。本實(shí)驗(yàn)選用車爾臣河、克孜勒河和阿克蘇河3個(gè)塔里木裂腹魚群體作為研究對(duì)象,運(yùn)用SSR標(biāo)記以及線粒體DNA的COII和ND4基因序列對(duì)塔里木裂腹魚進(jìn)行遺傳多樣性分析,為合理開發(fā)和利用塔里木裂腹魚遺傳資源以及建立和保護(hù)其種質(zhì)資源提供一定的科學(xué)依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1塔里木裂腹魚基因組微衛(wèi)星特征及SSR標(biāo)記的開發(fā)通過MISA軟件對(duì)塔里木裂腹魚基因組中的微衛(wèi)星重復(fù)序列進(jìn)行搜索,在558,993個(gè)Unigene中共檢測(cè)到743,118條微衛(wèi)星序列,主要有單、二、三、四、五和六核苷酸重復(fù)的微衛(wèi)星類型。在微衛(wèi)星的序列中,序列數(shù)目最多的是二核苷酸重復(fù)單元,達(dá)到總數(shù)的42.74%,其次為單核苷酸重復(fù)單元（39.07%）,五、六核苷酸重復(fù)類型的SSR含量較少,僅占0.92%和0.24%。在二核苷酸重復(fù)中,以AC/TG含量最多,占30.02%,此外,塔里木裂腹魚微衛(wèi)星核苷酸重復(fù)類型的重復(fù)次數(shù)以單核苷酸為主,平均達(dá)55.16次,其次為五核苷酸重復(fù),而重復(fù)次數(shù)最少是三核苷酸。同時(shí)發(fā)現(xiàn),隨著重復(fù)次數(shù)的增加,該類型SSR的豐度呈現(xiàn)出逐漸遞減的趨勢(shì)。本研究利用基因組信息的方法開發(fā)塔里木裂腹魚微衛(wèi)星標(biāo)記,共設(shè)計(jì)了288對(duì)引物,最終成功篩選出20對(duì)具有較高多態(tài)性的引物。在8個(gè)塔里木裂腹魚樣品中共檢測(cè)出204個(gè)等位基因,平均每對(duì)引物檢測(cè)到10.2個(gè)等位基因。各位點(diǎn)有效等位基因數(shù)分布在1.0121.365之間,平均有效等位基因數(shù)為1.150;期望雜合度主要分布在0.0120.223,平均期望雜合度為0.104;平均每個(gè)位點(diǎn)的香農(nóng)指數(shù)為0.179,表明所篩選的20對(duì)微衛(wèi)星位點(diǎn)具有一定的多態(tài)性,符合群體遺傳學(xué)方面的研究要求。2基于SSR標(biāo)記的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析利用SSR分子標(biāo)記研究了塔里木裂腹魚3個(gè)群體的遺傳多樣性。結(jié)果表明,3個(gè)群體共擴(kuò)增得到380個(gè)等位基因,且車爾臣河群體具有最高的Nei’s基因多樣性和香農(nóng)指數(shù),分別為0.1136和0.1936,而在克孜勒河群體中具有最高的有效等位基因數(shù)。3個(gè)群體之間的遺傳分化系數(shù)和遺傳距離均顯示,車爾臣河群體與阿克蘇河以及克孜勒河2個(gè)群體之間產(chǎn)生了較大的遺傳分化,且基因交流和遺傳相似性均較小,而阿克蘇河群體和克孜勒河群體間的基因交流和遺傳相似度都比較大。運(yùn)用UPGMA法對(duì)塔里木裂腹魚個(gè)體和群體分別進(jìn)行聚類分析,結(jié)果顯示,3個(gè)群體形成了2個(gè)主要的分支,阿克蘇河群體與克孜勒河群體聚為一支,車爾臣河群體單獨(dú)聚為一支。Structure分析結(jié)果也進(jìn)一步證實(shí)了3個(gè)群體中存在2個(gè)基因庫,即車爾臣河群體的基因組成以及其它兩個(gè)群體的基因組成。3基于線粒體DNA的COII、ND4基因序列的塔里木裂腹魚群體的遺傳多樣性分析采用mtDNA COII和ND4基因序列分析了塔里木裂腹魚3個(gè)群體的遺傳多樣性。結(jié)果顯示,塔里木裂腹魚線粒體DNA的COII和ND4基因序列均表現(xiàn)出明顯的堿基偏向性,且表明A+T含量較高或許也是魚類mtDNA COII基因和ND4基因堿基組成中普遍出現(xiàn)的情況。且基于兩種線粒體分子標(biāo)記的遺傳多樣性結(jié)果顯示,塔里木裂腹魚均屬于高單倍型多態(tài)性和高核苷酸多態(tài)性（Hd>0.5,π>0.005）,推測(cè)塔里木裂腹魚不同分化的譜系間出現(xiàn)了二次交流。車爾臣河群體與阿克蘇河以及克孜勒河群體之間產(chǎn)生了較大的遺傳分化,且群體間的遺傳距離達(dá)到了亞種分化水平（0.02<D<0.2）,AMOVA分析結(jié)果均顯示塔里木裂腹魚種群間的遺傳變異遠(yuǎn)大于種群內(nèi)的遺傳變異,且遺傳距離NJ聚類樹顯示車爾臣河群體獨(dú)立于其它兩個(gè)群體,單獨(dú)聚為一支。同時(shí),貝葉斯（BI）樹、最大似然（ML）樹和最大簡約（MP）樹也均顯示3個(gè)塔里木裂腹魚群體形成了2個(gè)明顯的類群,一類主要由車爾臣河群體組成,另一類主要由克孜勒河和阿克蘇河群體組成。以上均表明了塔里木裂腹魚已經(jīng)形成了2個(gè)明顯分化的地理種群,故建議將車爾臣河群體視為塔里木裂腹魚的亞種。
張宗瑜[4]（2020）在《老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及落粒相關(guān)基因QTL定位》文中指出老芒麥（Elymus sibiricus L.）是禾本科披堿草屬多年生優(yōu)良牧草,具有草產(chǎn)量高、品質(zhì)好、耐寒、耐旱等優(yōu)良特性,廣泛應(yīng)用于我國高山草原的放牧、人工草地建植、生態(tài)環(huán)境恢復(fù)等。但老芒麥較高的落粒性大大降低了牧草種子產(chǎn)量,對(duì)新品種選育、推廣利用帶來不利影響。有關(guān)牧草落粒的遺傳學(xué)基礎(chǔ),是國內(nèi)外研究不多且亟待加強(qiáng)的研究領(lǐng)域。為此,本研究在開發(fā)老芒麥特異性EST-SSR標(biāo)記、分析不同落粒種質(zhì)材料的遺傳多樣性基礎(chǔ)上,構(gòu)建了老芒麥的遺傳作圖群體,并利用SLAF（specific length amplified fragment）技術(shù)構(gòu)建了老芒麥?zhǔn)讖堖z傳連鎖圖譜,相繼結(jié)合QTL和GWAS（genome-wide association study）分析方法定位了落粒候選基因。旨在為解析老芒麥落粒遺傳機(jī)制、加快老芒麥落粒分子遺傳改良和培育低落粒老芒麥新品種提供基礎(chǔ)科學(xué)依據(jù)。獲得主要研究結(jié)果如下。1、進(jìn)行了老芒麥特異性EST-SSR分子標(biāo)記開發(fā)及通用性研究。從老芒麥轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的6,685個(gè)unigene中,分析識(shí)別了8,871個(gè)潛在EST-SSR位點(diǎn),進(jìn)一步開發(fā)了200對(duì)EST-SSR分子標(biāo)記。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序驗(yàn)證顯示,等位基因的測(cè)序結(jié)果與原始引物SSR位點(diǎn)同源,有43.5%的標(biāo)記在17個(gè)披堿草屬物種間通用性良好。利用30對(duì)多態(tài)性標(biāo)記對(duì)17個(gè)披堿草屬95份種質(zhì)的480個(gè)單株進(jìn)行的遺傳多樣性和進(jìn)化分析顯示,基于基因組構(gòu)成和地理起源將參試披堿草屬種質(zhì)聚為三大類。本研究結(jié)果為披堿草屬物種遺傳多樣性評(píng)價(jià)提供了引物來源。2、采用40對(duì)EST-SSR標(biāo)記對(duì)36份老芒麥種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性評(píng)價(jià),并且在田間測(cè)定了老芒麥的落粒性。結(jié)果顯示老芒麥分子遺傳多樣性和落粒性變異均較為豐富。篩選出落粒性狀差異較大、遺傳背景較遠(yuǎn)的高落粒基因型Y1005和低落?；蛐蚙hN06作為親本雜交構(gòu)建F1群體。對(duì)F1群體的7份材料進(jìn)行遺傳多樣性和表型變異分析,發(fā)現(xiàn)了落粒、葉片、莖節(jié)、穗長及芒長等性狀表現(xiàn)出超親雜種優(yōu)勢(shì)。遺傳多樣性分析顯示母本（ZhN06）與子代群體的共有條帶多于父本（Y1005）,顯示其遺傳力水平較高。通過分子標(biāo)記鑒定和低落粒子代選擇,將F1-7單株自交構(gòu)建了包含200份單株的F2作圖群體。3、利用SLAF簡化基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)F2群體測(cè)序,構(gòu)建了首張老芒麥高密度遺傳圖譜,圖譜總長1,866.35cM,14個(gè)連鎖群含1,971個(gè)標(biāo)記。連鎖群長度范圍在87.67cM（LG7）和183.45cM（LG1）之間,標(biāo)記平均距離為1.66cM。比較基因組發(fā)現(xiàn)老芒麥與小麥和大麥分別有79%（1,556）和70%（1,380）的同源標(biāo)記。連續(xù)三年觀測(cè)了穗長、小花數(shù)、落粒率、芒長、種子寬、千粒重等種子相關(guān)性狀,并進(jìn)行了QTL鑒定,在14個(gè)連鎖群上共檢測(cè)到29個(gè)QTL位點(diǎn),在第2、3、6和11號(hào)連鎖群上共檢測(cè)到6個(gè)落粒性QTL。通過與小麥和大麥基因組比對(duì)注釋發(fā)現(xiàn)了30個(gè)落粒候選基因,這些基因分別與植物激素信號(hào)調(diào)控（15個(gè)）、轉(zhuǎn)錄因子（7個(gè)）、水解酶活性（6個(gè)）及木質(zhì)素合成（2個(gè)）等相關(guān)。4、采用SLAF技術(shù)對(duì)包含213份種質(zhì)的老芒麥關(guān)聯(lián)群體進(jìn)行了測(cè)序,結(jié)合落粒等15個(gè)表型性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。SNP連鎖不平衡分析結(jié)果顯示,老芒麥LD（linkage disequilibrium）衰減較快,衰減距離為0.291kb,供試材料親緣關(guān)系較弱,適用于全基因組關(guān)聯(lián)分析。連續(xù)兩年在田間對(duì)落粒率等關(guān)鍵表型性狀觀測(cè)表明,不同性狀間存在較大的遺傳變異,平均變異系數(shù)為30.49%,其中落粒率遺傳力為85.13%。關(guān)聯(lián)分析共檢測(cè)到41個(gè)與落粒相關(guān)的顯著性位點(diǎn),平均解釋26.3%的表型變異。在這些位點(diǎn)上注釋到14個(gè)落粒相關(guān)候選基因,主要與半乳糖醛酸酶、水解酶、細(xì)胞分裂素葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶等調(diào)控相關(guān)。此外,在種子和產(chǎn)量相關(guān)性狀中分別檢測(cè)到66個(gè)和1,715個(gè)顯著性位點(diǎn),分別注釋到與種子性狀相關(guān)的候選基因31個(gè),與產(chǎn)量性狀相關(guān)的候選基因110個(gè)。
陳景蕓[5]（2019）在《五種斑潛蠅形態(tài)特征比較研究及重要種的遺傳結(jié)構(gòu)分析》文中指出斑潛蠅屬Liriomyza種類繁多,約有160種可為害栽培作物和觀賞植物。由于這些昆蟲個(gè)體小或微小（長1.3～2.1mm）,形態(tài)特征相似,部分種類生態(tài)位重疊明顯,種間競爭與替代迅速,鑒定工作受蟲態(tài)和蟲體保存完整狀態(tài)的限制,因此其分類鑒定比較困難,在實(shí)際工作中容易造成混亂,給植物檢疫、測(cè)報(bào)和防治等工作帶來困難。2014-2017年作者調(diào)查采集了中國大陸11省、38市4771頭斑潛蠅屬昆蟲,經(jīng)形態(tài)和分子鑒定種類共有5種,分別為三葉斑潛蠅L trifolii、美洲斑潛蠅L.sativae、南美斑潛蠅L.huidob、rensis番茄斑潛蠅L.bryoniae和蔥斑潛蠅L.chinensis,其中前三種是目前世界上最具為害性的入侵性斑潛蠅。為了進(jìn)一步研究斑潛蠅屬昆蟲種間和種內(nèi)的形態(tài)學(xué)特征變異和基因遺傳分化程度,給檢疫鑒定工作提供準(zhǔn)確的依據(jù)和更便捷的鑒定方法,給斑潛蠅的分化、擴(kuò)張、控制和防治工作提供理論研究基礎(chǔ),本文對(duì)采集到的5種4771頭斑潛蠅個(gè)體形態(tài)特征做了詳細(xì)的比較分析,其中對(duì)5種285頭斑潛蠅個(gè)體的主要背面特征（詳見附錄Ⅰ）做了拍照記錄和線粒體COI基因檢測(cè)的驗(yàn)證,以期探索更穩(wěn)定、快速和便捷的鑒定方法;對(duì)5種258頭斑潛蠅個(gè)體COI基因片段序列和對(duì)5種255頭斑潛蠅個(gè)體EF-1a基因片段序列做了種間及三葉斑潛蠅種內(nèi)的遺傳結(jié)構(gòu)分析;對(duì)5種284頭斑潛蠅個(gè)體進(jìn)行了基于微衛(wèi)星（SSR）標(biāo)記的遺傳結(jié)構(gòu)分析;對(duì)蔥斑潛蠅的線粒體基因組進(jìn)行了測(cè)序分析,主要研究結(jié)果如下:1、五種斑潛蠅形態(tài)鑒定特征本文研究了 5種斑潛蠅的雄性外生殖器形態(tài)特征,結(jié)果與Spencer（1973）書中描述一致,經(jīng)過觀察統(tǒng)計(jì)和分析,結(jié)果表明該特征仍然是斑潛蠅形態(tài)鑒定中最可靠的特征。由于現(xiàn)有文獻(xiàn)資料中的大多鑒定圖都是引自Spencer的手繪圖,缺少清晰的實(shí)物對(duì)比鑒定特征圖,所以本文拍攝了 5種斑潛蠅雄性外生殖器清晰的實(shí)物特征圖,作為手繪鑒定圖的補(bǔ)充。此外,本文研究發(fā)現(xiàn)目前使用最頻繁的斑潛蠅種類鑒定特征具有一定的局限性:1)內(nèi)外頂鬃著生區(qū)域的顏色具有不穩(wěn)定性和種間界限不清晰的缺點(diǎn),只可作為輔助鑒定特征;2)前翅M3+4脈末段長與次末段長的比值在種內(nèi)差異范圍較大,種間無明顯絕對(duì)的界限且比值范圍重疊部分較大,無法區(qū)分三葉斑潛蠅和美洲斑潛蠅,只能作為區(qū)分其它種類的輔助特征;3)斑潛蠅腹部背面觀花紋多變,但三葉斑潛蠅具有獨(dú)特的腹部背面特征。在不解剖、不做分子鑒定的情況下,為達(dá)到快速準(zhǔn)確鑒定,本文總結(jié)了這5種斑潛蠅最穩(wěn)定和可靠的形態(tài)鑒別特征:1)三葉斑潛蠅腹部背面中間有一條貫穿腹部背面黑色橫條紋的黃色縱帶將黑色條紋分割成兩列,或者至少在可見的倒數(shù)第二黑色條紋中間靠近下端有或大或小可明顯區(qū)別于其它種類的黃色斑塊在黑色條紋中形成一個(gè)明顯的缺口,且大多個(gè)體內(nèi)外頂鬃著生區(qū)域均為黃色;2)美洲斑潛蠅腹部背面可見的倒數(shù)第二黑色條紋下緣平滑,無明顯缺口,且外頂鬃著生區(qū)域顏色為黑色;3)番茄斑潛蠅腹部背面可見的倒數(shù)第二黑色條紋下緣平滑或整條成一個(gè)大弧形,中間無明顯缺口,且內(nèi)外頂鬃著生區(qū)域均為黃色;4)南美斑潛蠅腿節(jié)有明顯的黑色斑塊,且內(nèi)外頂鬃著生區(qū)域均為黑色;5)蔥斑潛蠅小盾片為全黑色,且內(nèi)頂鬃著生區(qū)域?yàn)辄S色,外頂鬃著生區(qū)域或下側(cè)有明顯區(qū)別于其它斑潛蠅屬種類的圓形或不規(guī)則形狀黑色斑塊。2、基于線粒體COI基因與核基因EF-1a的種群遺傳結(jié)構(gòu)分析研究結(jié)果表明,這5種斑潛蠅種群COI基因在不同地理種群間和不同寄主植物間均表現(xiàn)出相對(duì)保守的特性,可以作為斑潛蠅屬種類鑒定的分子依據(jù);EF-1a基因的堿基突變率相對(duì)較高,可用于斑潛蠅種群遺傳分化的研究。基于COI基因單倍型構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明,5種斑潛蠅種間分化明顯,其中三葉斑潛蠅與美洲斑潛蠅親緣關(guān)系最近,雖然形態(tài)極其相似,但種間無基因交流,未發(fā)現(xiàn)雜交現(xiàn)象;番茄斑潛蠅與南美斑潛蠅親緣關(guān)系最近,蔥斑潛蠅與4種斑潛蠅親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),這種關(guān)系與雄性外生殖器的相似程度一致。基于EF-1a基因單倍型構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹與基于COI基因單倍型構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹總體一致,但美洲斑潛蠅單倍型與三葉斑潛蠅單倍型種間分化界限不明顯。針對(duì)三葉斑潛蠅種內(nèi)不同種群間的進(jìn)一步遺傳分化結(jié)果顯示,這兩個(gè)分別位于線粒體和細(xì)胞核的基因,在三葉斑潛蠅種內(nèi)分化程度和方向上并不完全一致。3、基于微衛(wèi)星標(biāo)記的種群遺傳結(jié)構(gòu)分析本文選用了 8個(gè)三葉斑潛蠅微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)20個(gè)三葉斑潛蠅種群和6個(gè)近似種種群的種群遺傳結(jié)構(gòu)做了進(jìn)一步分析,總體分析結(jié)果與基于COI基因和EF-1a基因的分析結(jié)果一致。在測(cè)試樣品中,5種斑潛蠅種間遺傳距離明顯大于種內(nèi)遺傳距離,三葉斑潛蠅、美洲斑潛蠅、南美斑潛蠅、番茄斑潛蠅、蔥斑潛蠅種間的種群之間均發(fā)生高度分化。微衛(wèi)星的研究結(jié)果也證明了這5種斑潛蠅之間（尤其是三葉斑潛蠅和美洲斑潛蠅之間）雖然形態(tài)極為相似,但在線粒體和核基因?qū)用婢呀?jīng)發(fā)生了高度的遺傳分化,即種間分化明顯。本測(cè)試樣本中三葉斑潛蠅一半種群的觀測(cè)雜合度（Ho）大于0.5,一半種群的觀測(cè)雜合度（Ho）小于0.5,說明目前中國地區(qū)三葉斑潛蠅種群遺傳多樣性處于較高水平?？傮w看,中國這5種斑潛蠅各個(gè)地理種群內(nèi)具有的遺傳多樣性差異較大,且遺傳分化指數(shù)FsT較高,說明地理隔離等因素對(duì)斑潛蠅種群間的基因交流仍有一定程度的影響。同一地理不同寄主的種群間在等位基因數(shù)和雜合度方面表現(xiàn)出較高的相似性,同一寄主不同地理的種群間在等位基因數(shù)和雜合度方面表現(xiàn)出較高的差異性,說明地理隔離對(duì)三葉斑潛蠅種群的遺傳分化產(chǎn)生很大影響,寄主植物對(duì)斑潛蠅種內(nèi)遺傳多樣性的影響在本研究中尚未檢測(cè)到。數(shù)據(jù)分析表明,中國大陸地區(qū)三葉斑潛蠅部分種群處于明顯或中等程度的遺傳分化狀態(tài),而且大致分為兩大類群,即華南沿海地區(qū)類群和江浙及以北方地區(qū)類群,從入侵路徑判斷,應(yīng)該是華南沿海地區(qū)逐漸向北擴(kuò)散。瓶頸效應(yīng)的分析結(jié)果表明,目前整個(gè)中國大陸地區(qū)的三葉斑潛蠅群體規(guī)模正處于平穩(wěn)增長期。4、蔥斑潛蠅線粒體基因組蔥斑潛蠅線粒體基因全長16175 bp（GenBank登錄號(hào)MG252777）,包括37個(gè)線粒體基因（13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)tRNA,2個(gè)核糖體rRNA）和一個(gè)非編碼區(qū)（控制區(qū)）,其基因排序與模式生物黑腹果蠅Drosophila melanogaster（Lewis et al,1995）的基本相同。該基因組有23個(gè)基因分布在J鏈上（9個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因和14個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)tRNA）,14個(gè)基因分布在N鏈上（4個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、8個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)tRNA和2個(gè)核糖體rRNA）,16個(gè)基因間隔區(qū)總長64 bp,最短的只有1 bp,最長的有19 bp,位于tRNAGlu和tRNAPhe之間。在蔥斑潛蠅線粒體基因組里有9個(gè)基因重疊區(qū),最長的在tRNATrp和tRNACys之間,重疊長度為8 bp。蔥斑潛蠅線粒體基因組與潛蠅科其它種類相似。此外,蔥斑潛蠅基因組序列與原始祖先trnI-trnQ-trnM的分布比較一致。與已測(cè)序的5種潛蠅科昆蟲一樣,蔥斑潛蠅的線粒體基因組沒有發(fā)現(xiàn)重排現(xiàn)象,即具有高度的保守性,而且基因間隔區(qū)的長度和位置也具有高度的保守性。本文通過分析線粒體基因上13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因的堿基序列對(duì)斑潛蠅屬5個(gè)種構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,得出了一致的結(jié)果,證明蔥斑潛蠅應(yīng)該隸屬于斑潛蠅屬。
洪波[6]（2019）在《我國棗食芽象甲種群遺傳結(jié)構(gòu)、適生性及種群歷史動(dòng)態(tài)研究》文中研究說明棗食芽象甲Scythropus yasumatsui Kono et Morimoto又名棗飛象,屬鞘翅目象甲科（Coleoptera:Curculionidae）,是我國棗樹上一種重要的災(zāi)害性害蟲。該蟲1977年首次在我國河南新鄭、濮陽等地區(qū)被報(bào)道,近幾十年來,受全球氣候變化、棗樹栽培面積增加、人類活動(dòng)等因素的影響,其種群密度不斷增加,分布區(qū)域逐漸北移,目前已在新疆、寧夏部分地區(qū)發(fā)生,為害程度日趨嚴(yán)重。本研究以采自我國5個(gè)省份12個(gè)地理種群的棗食芽象甲樣本為材料,利用微衛(wèi)星、線粒體基因與核基因分子標(biāo)記的方法,分析棗食芽象甲不同地理種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)棗食芽象甲在我國的適生區(qū)域和適生關(guān)鍵環(huán)境因子,分析棗食芽象甲不同種群的歷史動(dòng)態(tài),并預(yù)測(cè)其種群擴(kuò)散來源及潛在擴(kuò)散路徑。主要研究結(jié)果如下:一、基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的棗食芽象甲微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選利用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)棗食芽象甲成蟲進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并篩選適用于棗食芽象甲種群遺傳學(xué)研究的微衛(wèi)星位點(diǎn)。在棗食芽象甲轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的171322條Unigene中發(fā)現(xiàn)2613個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),二核苷酸與三核苷酸重復(fù)為主要重復(fù)類型,分別占微衛(wèi)星位點(diǎn)總數(shù)的48.22%和46.12%。在二核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星中,AT/TA為優(yōu)勢(shì)重復(fù)基元;在三核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星中,AAT/ATT為優(yōu)勢(shì)重復(fù)基元類型,且微衛(wèi)星重復(fù)單元的重復(fù)次數(shù)主要分布在5-12次之間。基于篩選得到的微衛(wèi)星位點(diǎn),利用Primer Premier 5設(shè)計(jì)出50對(duì)微衛(wèi)星引物,最終開發(fā)出16個(gè)具有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn),可用于棗食芽象甲的種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究。二、棗食芽象甲線粒體基因組全序列測(cè)定與系統(tǒng)發(fā)育研究利用二代測(cè)序技術(shù)測(cè)定出棗食芽象甲線粒體基因組全序列,序列全長16472bp,DNA為閉合雙鏈,包括13個(gè)PCGs基因、22個(gè)tRNA基因和2個(gè)rRNA基因,另外含有2段較長的非編碼區(qū)。利用13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因核苷酸序列建立貝葉斯系統(tǒng)發(fā)育樹,明確棗食芽象甲與其它近緣的7個(gè)亞科12個(gè)物種的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,結(jié)果表明棗食芽象甲與同屬于粗喙象亞科Entiminae的大灰象甲親緣關(guān)系最近。三、基于微衛(wèi)星的棗食芽象甲種群遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究利用8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)我國5個(gè)省份（山西、陜西、寧夏、河北和河南）12個(gè)地理種群的371頭棗食芽象甲樣本進(jìn)行種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明我國棗食芽象甲種群具有較高的遺傳多樣性,各位點(diǎn)的有效等位基因數(shù)（Ne）為2.1138.016,等位基因豐富度（Ar）為2.6485.665,多態(tài)信息含量（PIC）為0.5610.908,期望雜合度（He）為0.4760.865;種群間遺傳分化系數(shù)(Fst)平均值為0.151;基因流（Nm）平均值為1.594?；赨PGMA和NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹、主成分分析與STRUCTURE分析3種方法均支持將12個(gè)地理種群分為3組,組1包括陜西神木、陜西佳縣、陜西清澗、陜西延川、山西臨縣、山西柳林與山西永和種群,組2包括河北滄縣與河南新鄭種群,組3包括陜西閻良、河南靈寶與寧夏同心種群。各組之間受太行山脈、黃土高原等地理隔離的影響,存在明顯的遺傳結(jié)構(gòu)。其中組1這7個(gè)種群間的Nm平均值為6.258,表明它們具有高度的基因交流。Mantel檢驗(yàn)結(jié)果表明,棗食芽象甲各種群間的遺傳距離與地理距離之間呈顯著正相關(guān)關(guān)系。四、基于線粒體與核基因的棗食芽象甲種群遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究利用線粒體（COI、COII和Cytb）和核基因（ITS1和ITS2）分子標(biāo)記分析9個(gè)地理種群的棗食芽象甲樣本的遺傳多樣性,計(jì)算得出各種群的線粒體單倍型多樣性平均值為0.527,核苷酸多樣性平均值為0.0018;ITS序列單倍型多樣性平均值為0.318,核苷酸多樣性平均值為0.0005,單倍型多樣性高（Hd>0.5）,核苷酸多樣性低（π<0.005）的特征表明棗食芽象甲為古老群體,可能在第四紀(jì)冰期時(shí)曾經(jīng)歷過瓶頸效應(yīng)?；趩伪缎蛿?shù)據(jù),通過系統(tǒng)進(jìn)化樹、鄰接網(wǎng)絡(luò)圖和BAPS 3種方法分析棗食芽象甲種群的遺傳結(jié)構(gòu),結(jié)果表明,棗食芽象甲各種群間形成了明顯的系統(tǒng)地理結(jié)構(gòu)。線粒體單倍型支持將棗食芽象甲9個(gè)地理種群分為5個(gè)分支,而ITS單倍型結(jié)果與微衛(wèi)星相同,支持將不同種群分為3個(gè)分支。各地理種群的遺傳分化與基因流分析結(jié)果表明,陜西和山西黃河谷地區(qū)域的各種群間不存在遺傳分化,黃河沒有成為種群間基因交流的地理障礙,這與微衛(wèi)星的研究結(jié)果相同。五、棗食芽象甲在我國的適生性與適生環(huán)境因子分析利用MaxEnt生態(tài)位模型,結(jié)合棗食芽象甲在我國的分布區(qū)域,以及末次間冰期（LIG）、末次盛冰期（LGM）、現(xiàn)代和未來4個(gè)時(shí)期的Worldclim全球氣象環(huán)境數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)棗食芽象甲在我國不同歷史時(shí)期的潛在適生區(qū),并預(yù)測(cè)出末次盛冰期前后的太行山脈東部華北平原地區(qū)、陜西渭河谷地和山西汾河谷地這3個(gè)區(qū)域始終為棗食芽象甲的適生區(qū)域,推測(cè)這些區(qū)域可能為棗食芽象甲在第四紀(jì)冰期的避難所。利用2070年的氣候環(huán)境因子進(jìn)行棗食芽象甲的適生性分析表明該蟲的適生區(qū)域有在未來繼續(xù)北移的趨勢(shì),內(nèi)蒙、遼寧、新疆、甘肅和寧夏等地都將成為棗食芽象甲的適生區(qū)。通過Jackknife分析法得出影響棗食芽象甲分布最重要的環(huán)境因子是溫度,冬夏溫差較大且氣候干燥的環(huán)境條件最適宜棗食芽象甲的發(fā)生。六、棗食芽象甲種群歷史動(dòng)態(tài)及擴(kuò)散路徑分析利用BEAST估算出棗食芽象甲種群的最初分歧時(shí)間在2.54 Ma（百萬年）左右,錯(cuò)配分布分析和中性檢驗(yàn)結(jié)果表明,棗食芽象甲有5個(gè)地理種群的錯(cuò)配分布為單峰模式,Tajima′s D和Fu′s Fs中性檢驗(yàn)值在這幾個(gè)種群達(dá)到顯著水平（P<0.05）,證明棗食芽象甲曾經(jīng)歷過種群擴(kuò)張,擴(kuò)張時(shí)間從末次間冰期開始,到末次冰期后結(jié)束（0.012-0.15 Ma）,貝葉斯天際線分析（BSP）也得到相似的結(jié)論。使用Migrate-n對(duì)種群間的歷史遷移率進(jìn)行分析,推測(cè)出可能的擴(kuò)散起源地有2個(gè):山西呂梁和河南靈寶,目前已擴(kuò)散至河北滄縣、陜西榆林和寧夏同心等種群所在地區(qū)。使用ArcGIS的SDMtoolbox工具中的最低成本路徑法（LCP）,結(jié)合棗食芽象甲分子標(biāo)記數(shù)據(jù)和地理分布數(shù)據(jù),預(yù)測(cè)棗食芽象甲在我國的潛在擴(kuò)散路徑。結(jié)果表明,黃河中下游谷地區(qū)域是棗食芽象甲種群最可能的擴(kuò)散通道。本研究為闡明我國棗食芽象甲的種群遺傳結(jié)構(gòu),了解其在我國的分布和擴(kuò)散趨勢(shì)提供了理論依據(jù),為揭示其成災(zāi)規(guī)律和制定綜合防治策略提供了重要參考,同時(shí)也為研究其對(duì)環(huán)境、寄主及人類活動(dòng)的適應(yīng)性和進(jìn)化機(jī)制提供了幫助。
武懷恒[7]（2018）在《斜紋夜蛾誘集種群動(dòng)態(tài)及不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu)分析的研究》文中研究表明斜紋夜蛾（Spodoptera litura）是一種世界性分布的多食性重要害蟲,自從1775年在印度有斜紋夜蛾的記錄以來,該蟲一直是蔬菜、煙草、大豆、棉花等經(jīng)濟(jì)作物上的重要害蟲。該蟲在我國的云南、廣西、廣東、海南、福建和臺(tái)灣等地一年可以發(fā)生8-9代,世代重疊,部分地區(qū)甚至全年可見;長江流域一般發(fā)生5-6代,其中以4-5代危害較重;而在黃河流域則每年發(fā)生4-5代,其中以7-9月份發(fā)生嚴(yán)重。遷飛行為是昆蟲在長期進(jìn)化過程中形成的一種趨避不適生存環(huán)境的選擇策略,常會(huì)造成異地突然爆發(fā)成災(zāi),給當(dāng)?shù)剞r(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來災(zāi)難性損失。因此,開展斜紋夜蛾的遷飛行為學(xué)研究,有助于了解該害蟲的成災(zāi)規(guī)律,為進(jìn)一步準(zhǔn)確預(yù)測(cè)預(yù)報(bào)、大面積綜合治理提供理論基礎(chǔ)。本研究從宏觀和微觀兩方面,對(duì)斜紋夜蛾的遷飛情況進(jìn)行了比較系統(tǒng)的研究。宏觀方面,利用高空探照燈誘集了武漢、廊坊和長島三地的斜紋夜蛾,統(tǒng)計(jì)了三地誘集種群的季節(jié)性數(shù)量動(dòng)態(tài)、雌雄性比,確定了雌蛾的卵巢發(fā)育級(jí)別和交配率,進(jìn)一步檢測(cè)了雌蛾體內(nèi)的保幼激素含量。而微觀方面,則利用微衛(wèi)星和AFLP分子標(biāo)記技術(shù)研究了遼寧沈陽、湖北武漢、緬甸Hlegu Twonship等18個(gè)不同地理種群間的種群分化及遺傳多樣性。主要研究結(jié)果如下:1.斜紋夜蛾高空誘集數(shù)量及其卵巢發(fā)育動(dòng)態(tài)。武漢地區(qū)斜紋夜蛾在5月中旬就可以誘到,但是數(shù)量不多,在8月中旬到8月底出現(xiàn)第一個(gè)高峰,出現(xiàn)9月中旬到9月底第二個(gè)高峰,之后斜紋夜蛾數(shù)量開始下降。而廊坊和長島城島的斜紋夜蛾7月中旬才出現(xiàn),誘集的成蟲高峰主要集中在8月底到9月中下旬,到10月份成蟲量顯著減少。從三地誘蟲的性比來看,雄蛾數(shù)量多于雌蛾。卵巢發(fā)育級(jí)別顯示武漢地區(qū)8月份之前的雌蛾卵巢級(jí)別以2級(jí)以上為主,1級(jí)的卵巢級(jí)別比例較低,表明這幾個(gè)月雌蛾到達(dá)武漢時(shí)雌蛾已達(dá)性成熟;而從8月份開始,1級(jí)的卵巢級(jí)別比例開始上升,到10月份時(shí)該比例達(dá)到50%,這說明在10月份武漢地區(qū)外遷的斜紋夜蛾數(shù)量較多。廊坊地區(qū)8月份誘集的斜紋夜蛾雌蛾卵巢級(jí)別均在2級(jí)以上,說明幾乎是遷入的性成熟個(gè)體,9月份的個(gè)體中出現(xiàn)1級(jí)水平卵巢,10月份1級(jí)水平卵巢比例達(dá)到40%,說明遷出個(gè)體數(shù)量較多。而長島8月和9月的雌蛾卵巢級(jí)別均在2級(jí)以上,說明這里的雌蛾均屬于遷飛路過,性發(fā)育成熟。5-10月份武漢誘集的斜紋夜蛾雌蛾交配率是從高到低下降的,說明遷入雌蛾的交配率較高,而到10月以遷出雌蛾居多,因此交配率也明顯下降。長島誘集的斜紋夜蛾雌蛾交配率也體現(xiàn)出交配率下降的趨勢(shì);但是廊坊的雌蛾交配率并沒有表現(xiàn)出非常明顯的變化趨勢(shì)。2.遷飛中的斜紋夜蛾保幼激素滴度動(dòng)態(tài)。室內(nèi)不同日齡斜紋夜蛾雌雄成蟲的保幼激素滴度水平測(cè)定顯示,剛羽化的雌成蟲,保幼激素含量水平相對(duì)較低,隨后在3天內(nèi),保幼激素水平快速上升,3日齡時(shí)體內(nèi)JH滴度水平達(dá)到峰值,隨后（3-9日齡）逐漸下降,而雄成蟲的保幼激素含量的變化相對(duì)比較平穩(wěn)。武漢2009-2011年年度間斜紋夜蛾雌成蟲保幼激素的季節(jié)變化規(guī)律均是從初夏到秋季,雌蛾保幼激素的含量整體呈下降趨勢(shì)。而廊坊和長島誘集的斜紋夜蛾體內(nèi)的保幼激素含量年變化趨勢(shì)比較平緩,沒有明顯的降低,甚至長島種群的保幼激素含量年變化趨勢(shì)稍微有些上升,且這兩個(gè)地方誘集種群的保幼激素平均含量要低于武漢的平均值。3.基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的斜紋夜蛾種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。建立了適合斜紋夜蛾種群分子遺傳學(xué)分析的微衛(wèi)星體系,選用9個(gè)微衛(wèi)星座位進(jìn)行PCR擴(kuò)增并應(yīng)用Gene Scan測(cè)序技術(shù)測(cè)定了各位點(diǎn)片段的長度多態(tài)性。在18個(gè)不同地理種群中,共發(fā)現(xiàn)了162個(gè)等位基因,不同的微衛(wèi)星位點(diǎn)觀測(cè)等位基因數(shù)Na從5到34不等,有效等位基因數(shù)Ne變化范圍為1.23-9.16,平均Shannon信息指數(shù)I為1.6,觀測(cè)雜合度Ho在0.18到0.98之間變化,期望雜合度He在0.19-0.89之間的范圍,平均期望雜合度HE的分布范圍在0.17-0.86之間。9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均等位基因豐富度AR為3.93,平均多態(tài)信息含量PIC為0.64。斜紋夜蛾群體內(nèi)9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的觀測(cè)等位基因數(shù)、等位基因豐富度和平均觀測(cè)雜合度普遍比較高,說明斜紋夜蛾群體內(nèi)遺傳多樣性非常豐富。9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的種群內(nèi)平均近交系數(shù)Fis在-0.1150.154之間;各種群9個(gè)位點(diǎn)的平均近交系數(shù)Fis為0.056。顯示斜紋夜蛾所有種群內(nèi)9個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均Fis為0.04,平均Fit為0.08,平均Fst為0.05,總?cè)后w基因流平均為5。種群兩兩之間的FST大部分小于0.05,一小部分在0.050.15之間。說明大部分種群無分化,個(gè)別種群中度分化,而且遺傳分化主要發(fā)生在個(gè)體之間,群體之間則相對(duì)較低。同時(shí)從六個(gè)位點(diǎn)（CWM-1、CWM-2、CWM-3、CWM-4、CWM-5、CWM-8）的基因流數(shù)目（Nm>4）可以看出不同種群之間的基因交流比較充分。4.不同地區(qū)斜紋夜蛾種群遺傳多樣性的AFLP分析。64對(duì)引物組合中篩選出的6對(duì)引物對(duì)17個(gè)種群共408個(gè)個(gè)體進(jìn)行AFLP分析,共得到157個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),總的多態(tài)性位點(diǎn)百分率（PPB）為100%。17個(gè)種群的Nei’s基因多樣性變化范圍在0.18-0.3114,總體Nei’s基因多樣性明顯高于各群體,為0.3591。Shannon’s指數(shù)的變化范圍在0.2559-0.4438之間,總?cè)后w為0.5407。利用兩種分子標(biāo)記分析的斜紋夜蛾各種群間的遺傳相似度和遺傳距離基本相吻合,但是遺傳相似性最高和相似性最低的種群并不一致。此外,斜紋夜蛾地理種群間的遺傳距離與地理距離之間具有較低的相關(guān)性。因此,系統(tǒng)發(fā)育樹聚合后,并未表現(xiàn)出明顯的地域性,而且依據(jù)兩種標(biāo)記所做的發(fā)育樹也有一定的差異,但是大致可以分為兩支,一支是沿海走向,一支是沿華北-巫山-橫斷山一線走向。
葉占峰[8]（2017）在《棉鈴蟲PBP1功能鑒定及不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較研究》文中認(rèn)為蛾類昆蟲的性信息素通訊具有高度的靈敏性和種特異性,除人工仿生合成的性信息素被開發(fā)應(yīng)用于害蟲防治外,性信息素感受相關(guān)的蛋白（基因）有望作為靶標(biāo)被用于新型害蟲行為調(diào)控技術(shù)的開發(fā)。性信息素結(jié)合蛋白（Pheromone binding protein,PBP）是存在于觸角嗅覺感器中的一類小分子水溶性蛋白,組織表達(dá)譜及體外研究推測(cè),其主要功能是運(yùn)輸脂溶性的性信息素分子穿過感器腔中的水溶性淋巴液到達(dá)感受神經(jīng)樹突膜表面的受體（Olfactory receptor,OR）,因而在性信息素的感受中起重要作用,但由于技術(shù)限制,很少有活體功能研究予以證實(shí)。CRISPR/Cas9系統(tǒng)是近年發(fā)展起來的一種高效的基因編輯技術(shù),已成功應(yīng)用于一些昆蟲基因的功能研究,為PBP的活體功能研究提供了可能。此外,性信息素作為一種重要的綠色防治技術(shù),已在棉鈴蟲的種群測(cè)報(bào)和防治中得到應(yīng)用,但效果在不同地理區(qū)域間往往不大穩(wěn)定。這種不穩(wěn)定的原因可能是多方面的,包括生物因素（如害蟲地理種群、發(fā)生代次、寄主植物類型等）和非生物因素（溫、濕、光照）,而在生物因素中,地理種群間的差異值得重點(diǎn)研究。針對(duì)上述兩個(gè)問題,本文首先將CRISPR/Cas9系統(tǒng)應(yīng)用于棉鈴蟲PBP活體功能研究,成功獲得了 PBP1被敲除的棉鈴蟲突變個(gè)體,并發(fā)現(xiàn)PBP1突變個(gè)體對(duì)棉鈴蟲性信息素組分的EAG反應(yīng)顯著降低（幅度達(dá)40%以上）,首次活體證實(shí)了 PBP1在棉鈴蟲性信息素感受中的重要作用。在不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較研究中,從雌蛾腺體中各性信息素組分的含量及比例、雄蛾對(duì)不同比例性信息素二元誘芯的行為反應(yīng)（誘蛾量）兩方面進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)棉鈴蟲性信息素通訊系統(tǒng)在不同地理種群間基本穩(wěn)定,但比較而言,新疆地區(qū)的雄蛾引誘量與誘芯中組分比例的關(guān)系和其他種群不同。為進(jìn)一步探討雄蟲感受性信息素差異的分子機(jī)制,對(duì)不同地理種群PBP基因（PBP1和PBP2）的核苷酸多樣性和遺傳分化進(jìn)行了分析,分子差異度和核酸聚類分析表明PBP基因在種群間沒有明顯分化,但基于遺傳距離進(jìn)行的PCoA分析顯示新疆沙灣種群同其他種群明顯分開。本文結(jié)果對(duì)于深入研究棉鈴蟲性信息素通訊的機(jī)制及相關(guān)基因的遺傳分化,從而更好地利用性信息素進(jìn)行害蟲防治,具有重要的指導(dǎo)意義。主要結(jié)果總結(jié)如下:1.棉鈴蟲性信息素結(jié)合蛋白PBP1的功能研究同其他蛾類昆蟲一樣,棉鈴蟲存在3個(gè)不同的PBP基因,且組織表達(dá)譜及體外配體結(jié)合實(shí)驗(yàn)表明PBP1的作用更為重要,因此我們選取PBP1基因?qū)ζ溥M(jìn)行活體功能研究。首先利用軟件在PBP1基因上篩選獲得一個(gè)靶標(biāo)位點(diǎn),據(jù)此設(shè)計(jì)并體外轉(zhuǎn)錄合成sgRNA,同時(shí)合成Cas9mRNA。然后利用顯微注射技術(shù),將Cas9-mRNA和PBP1-sgRNA的混合液注射到新產(chǎn)的棉鈴蟲卵中（產(chǎn)后4h內(nèi)）,24h后隨機(jī)抽取20粒卵進(jìn)行限制性內(nèi)切酶酶切檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)突變率達(dá)到36.9%（后續(xù)對(duì)成蟲個(gè)體DNA測(cè)序,突變率高達(dá)86.7%）;進(jìn)一步對(duì)DNA的TA克隆和測(cè)序發(fā)現(xiàn),PBP1基因靶位點(diǎn)發(fā)生多種插入或缺失突變類型,其中有一個(gè)突變類型是插入兩個(gè)堿基,這導(dǎo)致PBP1蛋白整個(gè)氨基酸翻譯提前終止,最終只翻譯10個(gè)氨基酸（完整的PBP1蛋白有143個(gè)氨基酸）。對(duì)該突變類型進(jìn)行單對(duì)系篩選,獲得穩(wěn)定遺傳的突變個(gè)體,并用EAG檢測(cè)方法測(cè)定了 PBP1突變個(gè)體在性信息素感受中的作用。結(jié)果顯示,純合突變雄蟲對(duì)棉鈴蟲3種性信息素組分（Z11-16:Ald、Z9-16:Ald和Z9-14:Ald）的EAG反應(yīng)均顯著降低,降低幅度在40%以上;雜合突變個(gè)體同樣對(duì)3種性信息素組分的反應(yīng)顯著降低,但幅度低于純合突變雄蟲。本研究首次在活體內(nèi)證明了棉鈴蟲PBP1在3個(gè)性信息素組分感受中的重要作用,同時(shí)為利用CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)對(duì)其他基因的功能研究提供了方法參考。2.棉鈴蟲不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較為探討棉鈴蟲性信息素誘芯在不同地區(qū)間不穩(wěn)定的原因,2013-14年,我們采集河南安陽、江蘇大豐、山東惠民、湖北荊州、河北南皮、山東汶上和高陽、河南夏津及新疆沙灣共9個(gè)地理種群的棉鈴蟲,利用腺體浸泡法提取棉鈴蟲腺體的性信息素組分,用氣相色譜檢測(cè)2個(gè)主要性信息素組分（Z11-16:Ald和Z9-16:Ald）的含量和比例（Z11/Z9）。結(jié)果表明,雖然2個(gè)性信息素組分的含量在不同地理種群間變化較大,但兩者間比例基本穩(wěn)定。根據(jù)雌蛾腺體中Z11/Z9的變動(dòng)范圍并結(jié)合田間防治中使用的Z11/Z9比例,配制99:1到90:10共4個(gè)不同比例的誘芯,在河南安陽、山東惠民和新疆昌吉進(jìn)行田間雄蛾誘捕實(shí)驗(yàn)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),安陽和惠民種群的誘捕量在不同比例誘芯間均沒有顯著差異,但昌吉種群的誘蛾量隨Z11/Z9比例的降低而增高,且90:10比例誘芯的誘蛾量顯著高于99:1比例的誘芯。綜合分析認(rèn)為,不同棉鈴蟲種群間的性信息素通訊系統(tǒng)基本一致,地理種群差異并非性信息素田間效果不穩(wěn)定的主要原因。3.棉鈴蟲不同地理種群PBP基因的多態(tài)性分析為探索不同地理種群在性信息素感受方面的遺傳變異,采集自冀、魯、豫、鄂、新的6個(gè)棉鈴蟲田間種群及1個(gè)室內(nèi)種群,針對(duì)性信息素感受中起重要作用的PBP基因,就基因編碼區(qū)序列的核苷酸多樣性和遺傳分化進(jìn)行了分析。其中,單倍型網(wǎng)絡(luò)遺傳關(guān)系顯示,除個(gè)別單倍型（PBP1有6個(gè),PBP2有4個(gè)）為兩個(gè)種群共享外,其他單倍型（PBP1有77個(gè),PBP2有45個(gè)）只存在于某一個(gè)種群,且一個(gè)種群的單倍型四散分布,沒有形成明顯的地理種群簇。分子差異度結(jié)果（AMOVA）表明,PBP在種群內(nèi)的差異度明顯高于種群間,其中PBP1種群間差異度為10.13%,種群內(nèi)差異度為89.87%,分化系數(shù)Fst為0.1013;PBP2種群間差異度為18.77%,種群內(nèi)差異度為81.23%,分化系數(shù)Fst為0.1877。核苷酸序列聚類分析結(jié)果顯示,來自同一種群的個(gè)體并未聚集在一起（室內(nèi)種群除外）。上述結(jié)果說明,6個(gè)田間種群間沒有形成明顯的遺傳分化。然而,根據(jù)種群遺傳距離進(jìn)行主坐標(biāo)分析（PCoA）顯示,雖然PBP2在種群間分組不明顯,但PBP1被明顯分為3組（室內(nèi)種群和沙灣種群分別為一組,其他5個(gè)種群為一組）,說明新疆種群和其他田間種群間形成了一定的遺傳分化,該結(jié)果與各種群的地理分布一致。
段辛樂[9]（2015）在《我國禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)及農(nóng)藥對(duì)其脅迫效應(yīng)研究》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理禾谷縊管蚜Rhopalosiphum padi（L.）屬于半翅目（Hemiptera）蚜科（Aphididae）,其廣泛分布于我國及世界各小麥種植區(qū),是小麥生產(chǎn)中的主要害蟲之一。該蟲刺吸小麥汁液,造成小麥減產(chǎn)和品質(zhì)下降,還能夠傳播大麥黃矮病毒（BYDV）,給全世界小麥生產(chǎn)帶來巨大損失。在全球氣候、耕作制度、種植品種、人為因素及其他因素的影響下,近年來禾谷縊管蚜的危害程度隨之加重,危害范圍也隨之?dāng)U大,并逐漸成為我國多個(gè)小麥種植區(qū)的重要害蟲。本研究篩選了5個(gè)能夠穩(wěn)定擴(kuò)增且多態(tài)性較好的禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn),利用這些微衛(wèi)星位點(diǎn)研究了采自我國不同麥區(qū)的禾谷縊管蚜種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu),以及實(shí)驗(yàn)室條件下農(nóng)藥脅迫對(duì)不同禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性的影響和農(nóng)藥對(duì)禾谷縊管蚜種群的亞致死效應(yīng);本研究還以禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),篩選能夠應(yīng)用于種群遺傳學(xué)研究的微衛(wèi)星位點(diǎn),為進(jìn)一步的相關(guān)研究奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:一、禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選、擴(kuò)增穩(wěn)定性及多態(tài)性研究從我國8個(gè)?。ㄊ校┕?個(gè)地區(qū)采集282頭禾谷縊管蚜試蟲,采用熒光標(biāo)記PCR與自動(dòng)掃描分型方法,研究了8個(gè)在歐洲禾谷縊管蚜中報(bào)道的微衛(wèi)星位點(diǎn)在這些試蟲中的擴(kuò)增穩(wěn)定性和遺傳多樣性。結(jié)果顯示,位點(diǎn)R1.35在9個(gè)禾谷縊管蚜種群中均不能擴(kuò)增;位點(diǎn)R5.29b只在7個(gè)禾谷縊管蚜種群的少數(shù)樣本中能擴(kuò)增;位點(diǎn)R2.73、R3.171、R5.10、R5.138、R5.50和R6.3在各禾谷縊管蚜種群中均能穩(wěn)定擴(kuò)增;6個(gè)穩(wěn)定擴(kuò)增的微衛(wèi)星位點(diǎn)的無效等位基因頻率為0.0044-0.2663,平均等位基因數(shù)為2.9-9.3個(gè),各等位基因的等位基因頻率為1.92%-93.48%,多態(tài)信息含量為0.3398-0.7658,觀測(cè)雜合度為0.047-0.912,期望雜合度為0.421-0.815,除吉林白城（JLB）和青海西寧（QHX）種群外,各位點(diǎn)在多數(shù)禾谷縊管蚜種群中偏離哈迪溫伯格平衡;位點(diǎn)R6.3具有較低的觀測(cè)雜合度（0.047）和較低的平均等位基因數(shù)（2.9）,不適合用于種群遺傳多樣性研究,而微衛(wèi)星位點(diǎn)R2.73、R3.171、R5.10、R5.138和R5.50在各禾谷縊管蚜種群中均具有較高的雜合度和等位基因數(shù),可用于我國禾谷縊管蚜的種群遺傳學(xué)研究。二、禾谷縊管蚜不同地理種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究從我國15個(gè)?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市）采集22個(gè)禾谷縊管蚜種群,利用篩選的5個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),研究這些地理種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,采自我國不同地區(qū)的禾谷縊管蚜種群具有不同的遺傳多樣性,這些種群存在不同的遺傳結(jié)構(gòu);地理隔離和生殖方式與種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)具有明顯的相關(guān)性,是影響禾谷縊管蚜種群遺傳學(xué)特征的重要因素。在5個(gè)禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)中共檢測(cè)到114個(gè)等位基因,各位點(diǎn)的平均無效等位基因頻率為0.032。22個(gè)禾谷縊管蚜地理種群的平均等位基因數(shù)量為5.39個(gè),平均有效等位基因數(shù)為3.19個(gè),平均等位基因豐富度為4.989,平均shannon指數(shù)為1.171,多位點(diǎn)基因型mlg個(gè)數(shù)為3-32個(gè),多位點(diǎn)基因型多樣性為15%-100%,平均觀測(cè)雜合度為0.756,平均期望雜合度為0.604,除吉林白城（jlb）、青海西寧（qhx）、甘肅蘭州（gsl）、陜西漢中（sah）、cqb（重慶北碚）和甘肅天水（gst）種群外,其他種群均表現(xiàn)為雜合子過剩（fis<0）;哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),jlb、qhx和gsl種群符合哈迪-溫伯格平衡,其他種群均偏離哈迪-溫伯格平衡（p<0.05）。微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析顯示,禾谷縊管蚜22個(gè)地理種群的遺傳相似系數(shù)在0.3477-0.9966之間,遺傳距離在0.0034-1.0564之間,遺傳分化系數(shù)在-0.021-0.334之間,這表明禾谷縊管蚜種群間存在不同程度的遺傳分化。manteltest結(jié)果顯示,地理距離和遺傳分化之間具有顯著的相關(guān)性。基于structure遺傳結(jié)構(gòu)分析、cavalli-sforza&edwards余弦遺傳距離和nei氏遺傳距離的nj聚類分析,以及主成分分析發(fā)現(xiàn),禾谷縊管蚜種群中存在顯著的遺傳結(jié)構(gòu),22個(gè)禾谷縊管蚜地理種群可劃分為3個(gè)類群。第i類群包括青海西寧（qhx）、甘肅蘭州（gsl）、甘肅天水（gst）、吉林白城（jlb）、重慶北碚（cqb）和陜西漢中（sah）種群;第ii類群包含云南昆明（ynk）、西藏拉薩（xzl）和貴州貴陽（gzg）種群;第iii類群包括河北保定（hbb）、山西太谷（sxt）、山西洪洞（sxh）、陜西咸陽（sax）、陜西榆林（say）、內(nèi)蒙包頭（nmb）、山東淄博（sdz）、山東泰安（sdt）、山東菏澤（sdh）、安徽滁州（ahc）、河南南陽（hnn）、湖北棗陽（huz）和湖北武漢（huw）種群?；谶z傳結(jié)構(gòu)模型和生殖方式模型的amova分析結(jié)果表明,大部分的遺傳變異來自禾谷縊管蚜種群內(nèi),小部分的遺傳變異來自類群內(nèi)種群間和類群間;分析認(rèn)為,除生殖方式和地理隔離柱之外,人類的活動(dòng)(如害蟲防治方法、禾谷縊管蚜的遷移和擴(kuò)散、特殊地理屏障的阻隔作用、種群所處的復(fù)雜的微氣候條件,也可能是影響其遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的重要因子三、毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性的影響本研究利用5個(gè)禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn),研究了毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜種群內(nèi)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的影響。與相對(duì)敏感種群相比,室內(nèi)汰選20代后,與相對(duì)敏感品系相比,河北保定（hbb）種群、河南南陽（hnn）種群、貴州貴陽（gzg）種群和甘肅蘭州（gsl）種群對(duì)毒死蜱的抗性分別為15.12和13.28倍、5.46和10.18倍;對(duì)異丙威的抗性分別為11.12和8.86倍、5.58和9.18倍;微衛(wèi)星分析結(jié)果顯示,兩種藥劑汰選后,各微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)信息含量和各等位基因頻率發(fā)生不同程度的變化。與相對(duì)敏感種群相比,各抗性種群的等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)、等位基因豐富度、多位點(diǎn)基因型數(shù)、期望雜合度、遺傳多樣性指數(shù)和shannon指數(shù)分析等遺傳多樣性指數(shù)均呈下降趨勢(shì)。兩種藥劑的持續(xù)選擇導(dǎo)致具有相同遺傳背景的抗性種群與相對(duì)敏感種群之間的遺傳距離增加,遺傳相似系數(shù)降低,且抗性種群和敏感種群分布在不同的系統(tǒng)樹分支上;通過對(duì)4個(gè)禾谷縊管蚜種群的抗性種群和相對(duì)敏感種群進(jìn)行貝葉斯聚類分析,結(jié)果表明具有相同遺傳背景的抗性種群與相對(duì)敏感種群劃分在同一個(gè)分類簇,這表明毒死蜱和異丙威雖能夠?qū)е潞坦瓤O管蚜抗性種群和相對(duì)敏感種群間發(fā)生遺傳分化,但對(duì)其遺傳結(jié)構(gòu)沒有顯著的影響。四、毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜種群的亞致死效應(yīng)研究為明確亞致死濃度的毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜試驗(yàn)種群的影響。本研究采用浸蟲法,分別測(cè)定了毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜成蚜的毒力;并以含0.1%吐溫-80的蒸餾水為對(duì)照,利用生命表技術(shù)分別研究了毒死蜱亞致死濃度（C-LC20和C-LC30）和異丙威亞致死濃度（I-LC20和I-LC30）對(duì)禾谷縊管蚜F0代和F1代種群生長發(fā)育和繁殖的影響。結(jié)果表明,C-LC20、C-LC30、I-LC20和I-LC30處理后,禾谷縊管蚜F0代成蚜壽命分別縮短14.03%、36.04%、12.01%和26.86%,產(chǎn)蚜量分別下降20.55%、42.27%、17.13%和26.00%,均顯著低于對(duì)照種群;與對(duì)照相比,C-LC20、C-LC30、I-LC20和I-LC30處理后,禾谷縊管蚜F1代種群的若蟲期分別延長1.51 d、1.92 d、0.9 d和1.19 d,成蚜壽命分別縮短21.62%、33.68%、15.51%和23.14%,產(chǎn)蚜量分別降低21.81%、37.4%、14.51%和29.29%,且F1代種群的內(nèi)稟增長率rm、凈生殖率R0、周限增長率λ以及總生殖率GRR都比對(duì)照降低,而F1代種群加倍時(shí)間Dt和平均世代周期T均延長。本研究結(jié)果顯示,亞致死濃度的毒死蜱和異丙威能夠降低禾谷縊管蚜種群的發(fā)育和繁殖速率,對(duì)禾谷縊管蚜種群具有明顯的抑制作用。五、基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選目前已經(jīng)報(bào)道的禾谷縊管蚜的微衛(wèi)星數(shù)量較少,為了開發(fā)更多的禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn),在前述工作完成以后,本研對(duì)禾谷縊管蚜進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選適用于禾谷縊管蚜種群遺傳學(xué)研究的微衛(wèi)星位點(diǎn)。在禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的29467條unigene中發(fā)現(xiàn)7936個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn),其中三核苷酸重復(fù)為主要重復(fù)類型,占微衛(wèi)星位點(diǎn)總數(shù)的45.75%,其次為單核苷酸重復(fù),占微衛(wèi)星總數(shù)的28.86%。在三核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星中,AAT/ATT和ACG/CGT為優(yōu)勢(shì)重復(fù)基元類型,且微衛(wèi)星重復(fù)單元的重復(fù)次數(shù)分布在4-24次之間?；诤Y選得到的微衛(wèi)星位點(diǎn),利用Primer 3設(shè)計(jì)了60對(duì)微衛(wèi)星引物,其中24對(duì)引物能夠穩(wěn)定擴(kuò)增并且得到與預(yù)期片段大小相符的條帶同時(shí)對(duì)24對(duì)微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),24個(gè)位點(diǎn)中14個(gè)位點(diǎn)具有較好的多態(tài)性,可以用于進(jìn)一步的禾谷縊管蚜種群遺傳學(xué)研究之中。
劉永剛[10]（2010）在《基于微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的馬鈴薯桃蚜不同種群遺傳分化研究》文中指出馬鈴薯（Solanum tuberosum L.）是世界上僅次于水稻、小麥、玉米的第四大糧食作物,也是重要的飼料作物和工業(yè)原料。我國是世界上最大的馬鈴薯生產(chǎn)國,馬鈴薯生產(chǎn)關(guān)系到我國甚至世界的糧食安全問題。蚜蟲（Aphids）是馬鈴薯生產(chǎn)中重要的傳毒介體昆蟲和遷飛性害蟲,具有寄主雜、分布廣、種類多的特點(diǎn),不僅直接刺吸馬鈴薯汁液,而且傳播多種病毒病,造成植株生長發(fā)育不良、產(chǎn)量和品質(zhì)下降、品種退化等諸多問題,有效防治蚜蟲是馬鈴薯生產(chǎn)和脫毒種薯繁育的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。受長期的特定環(huán)境條件脅迫和寄主選擇壓力的雙重影響,導(dǎo)致蚜蟲不同地理種群、不同寄主種群間產(chǎn)生遺傳分化,從而形成新的適應(yīng)性種群,然而蚜蟲的遷飛行為又在一定程度上增強(qiáng)了種群間的基因交流,降低種群間的遺傳分化。深入研究馬鈴薯蚜蟲優(yōu)勢(shì)種群遺傳結(jié)構(gòu)和種群間生殖隔離、基因交流等問題,有利于從根本上了解馬鈴薯蚜蟲的適應(yīng)機(jī)制和成災(zāi)機(jī)理,從而為準(zhǔn)確把握其發(fā)生規(guī)律并進(jìn)行有效防治提供依據(jù)。本研究應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)不同寄主、不同地理馬鈴薯優(yōu)勢(shì)種群—桃蚜的遺傳多樣性進(jìn)行了研究,旨在對(duì)不同種群桃蚜相似性進(jìn)行比較,了解不同寄主間、地區(qū)間的基因交流,分析可能的遷飛路線,判斷可能的蟲源地和遷入地,為馬鈴薯蚜蟲區(qū)域性成災(zāi)調(diào)控和治理提供理論基礎(chǔ)。取得的主要研究結(jié)果如下:1.對(duì)甘肅天水、定西、張掖三地馬鈴薯蚜蟲形態(tài)學(xué)鑒定表明:甘肅省馬鈴薯田間遷飛蚜蟲的主要種類有桃蚜、棉蚜、甘藍(lán)蚜、蘿卜蚜、豆蚜和長管蚜6種蚜蟲,桃蚜是甘肅省馬鈴薯蚜蟲優(yōu)勢(shì)蚜蟲種類,發(fā)生量占到田間總蚜量的53.3%,是馬鈴薯病毒病的主要傳毒介體。2.針對(duì)蚜蟲體型微小、體表有外骨骼的特點(diǎn),采用改進(jìn)的醋酸鉀法（KAC）提取單頭蚜蟲基因組DNA,并進(jìn)行了優(yōu)化:在常溫下直接用滅菌的一次性牙簽破碎細(xì)胞,不易造成交叉污染;提取勻漿液時(shí)加入蛋白酶K、延長水浴時(shí)間可以促進(jìn)蚜蟲組織徹底消化和促進(jìn)RNA分解;取消了平衡酚和氯仿抽提,延長DNA沉淀的時(shí)間,提高了DNA得率。本方法操作簡單,對(duì)試劑和設(shè)備要求不高,解決了單頭蚜蟲DNA提取難、不穩(wěn)定的問題,是一種較為理想的提取蚜蟲DNA方法。3.通過對(duì)不同濃度mg2+、引物、dNTP、Taq聚合酶、模板DNA對(duì)SSR-PCR擴(kuò)增影響的實(shí)驗(yàn)研究,篩選得到各組分的適宜濃度,建立了桃蚜SSR反應(yīng)體系:在20μL的反應(yīng)體系中,Mg2+濃度為1.5mM,dNTP為0.25mM,Taq酶為1.0U/μL,模板DNA為40ng/μL,引物為25ng/μL,為進(jìn)行桃蚜種群遺傳分化的研究奠定基礎(chǔ)。4.從46個(gè)微衛(wèi)星引物中篩選出14對(duì)多態(tài)性較高的微衛(wèi)星引物,對(duì)桃蚜5種不同寄主植物桃、煙草、甘藍(lán)、辣椒和馬鈴薯上的桃蚜種群的遺傳關(guān)系進(jìn)行了多態(tài)性分析,結(jié)果表明:14對(duì)SSR引物共擴(kuò)增出70條多態(tài)性條帶,多態(tài)位點(diǎn)比率達(dá)到98.59%,DNA片段分子量大小在70～300bp之間。馬鈴薯桃蚜種群的多態(tài)位點(diǎn)最多,為29個(gè),甘藍(lán)的多態(tài)位點(diǎn)最少,為6個(gè)。各寄主桃蚜種群的Shannon多樣性指數(shù)0.5382,Nei’s指數(shù)0.3631,基因流Nm為0.1343,多樣性的變化趨勢(shì)為:馬鈴薯桃蚜種群>桃樹桃蚜種群>煙草桃蚜種群>辣椒桃蚜種群>甘藍(lán)桃蚜種群。桃蚜寄主種群遺傳變異主要存在于種群內(nèi)。UPGMA聚類結(jié)果表明,桃蚜在茄科的煙草和辣椒上的種群親緣關(guān)系最近,與馬鈴薯桃蚜種群的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),預(yù)示著桃蚜正朝著遠(yuǎn)離煙草和辣椒種群的方向進(jìn)化。5.應(yīng)用7對(duì)具有高度多態(tài)性微衛(wèi)星引物,對(duì)來自甘肅省張掖、武威、酒泉、蘭州、臨洮、臨夏、定西、漳縣、渭源、岷縣、天水、武都、慶陽13個(gè)桃蚜地理種群進(jìn)行了遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,7對(duì)SSR引物在468個(gè)桃蚜個(gè)體基因組中共檢測(cè)到43個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),多態(tài)性條帶百分率為95.56%。13個(gè)馬鈴薯桃蚜地理種群觀察等位基因數(shù)為1.3333,有效等位基因數(shù)為1.2293,Nei’s（1973）基因多樣性指數(shù)為0.1311,Shannon指數(shù)為0.1898,多態(tài)位點(diǎn)百分率為33.33%,基因流Nm為0.3027。臨夏種群和臨洮種群的遺傳多樣性較高,漳縣種群最低。張掖和武威種群間的遺傳距離最小;張掖和慶陽種群間的遺傳距離最大。分子方差分析表明,遺傳變異的81.03%來自于種群內(nèi)部。Mantel檢測(cè)結(jié)果表明,種群間的遺傳距離和地理距離、海拔差距無顯著相關(guān)性。6 .聚類分析表明,馬鈴薯桃蚜在甘肅省分為河西和河?xùn)|（以黃河為界）兩個(gè)大的類群,河西類群中主要包括張掖、酒泉、武威和蘭州種群,河?xùn)|種群中定西、慶陽、會(huì)川種群聚為位于甘肅中東部的一支;天水、武都、岷縣聚為位于甘肅東南部的一支;漳縣種群、臨洮種群和臨夏種群則各自成為一支。進(jìn)一步的分析表明,甘肅中部馬鈴薯優(yōu)勢(shì)區(qū)桃蚜來源主要有兩個(gè)自然擴(kuò)散途徑,一是由位于甘肅東邊的慶陽等地傳入到定西,然后向西南部擴(kuò)散;另一個(gè)則是由東南部的天水等地傳入,逐漸向西南部擴(kuò)散,前者的相關(guān)性較后者明顯,據(jù)此推斷:陜北、隴東是隴中馬鈴薯桃蚜主要蟲源地,而隴南是次要蟲源地,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)上述地區(qū)桃蚜的監(jiān)測(cè)和治理,降低蟲源基數(shù)和遷入量。本研究將微觀的分子遺傳學(xué)和宏觀的昆蟲形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)有機(jī)的聯(lián)系在一起,這對(duì)于從理論上進(jìn)一步揭示馬鈴薯桃蚜災(zāi)變機(jī)理和遷飛規(guī)律,在實(shí)踐中有效開展綜合防治和甘肅省馬鈴薯優(yōu)質(zhì)種薯繁殖基地建設(shè)都具有重要的參考價(jià)值。
二、棉蚜地理種群重復(fù)序列引物擴(kuò)增DNA多態(tài)性分析(英文)（論文開題報(bào)告）
（1）論文研究背景及目的
此處內(nèi)容要求：
首先簡單簡介論文所研究問題的基本概念和背景，再而簡單明了地指出論文所要研究解決的具體問題，并提出你的論文準(zhǔn)備的觀點(diǎn)或解決方法。
寫法范例：
本文主要提出一款精簡64位RISC處理器存儲(chǔ)管理單元結(jié)構(gòu)并詳細(xì)分析其設(shè)計(jì)過程。在該MMU結(jié)構(gòu)中,TLB采用叁個(gè)分離的TLB,TLB采用基于內(nèi)容查找的相聯(lián)存儲(chǔ)器并行查找,支持粗粒度為64KB和細(xì)粒度為4KB兩種頁面大小,采用多級(jí)分層頁表結(jié)構(gòu)映射地址空間,并詳細(xì)論述了四級(jí)頁表轉(zhuǎn)換過程,TLB結(jié)構(gòu)組織等。該MMU結(jié)構(gòu)將作為該處理器存儲(chǔ)系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)的一個(gè)重要組成部分。
（2）本文研究方法
調(diào)查法：該方法是有目的、有系統(tǒng)的搜集有關(guān)研究對(duì)象的具體信息。
觀察法：用自己的感官和輔助工具直接觀察研究對(duì)象從而得到有關(guān)信息。
實(shí)驗(yàn)法：通過主支變革、控制研究對(duì)象來發(fā)現(xiàn)與確認(rèn)事物間的因果關(guān)系。
文獻(xiàn)研究法：通過調(diào)查文獻(xiàn)來獲得資料，從而全面的、正確的了解掌握研究方法。
實(shí)證研究法：依據(jù)現(xiàn)有的科學(xué)理論和實(shí)踐的需要提出設(shè)計(jì)。
定性分析法：對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行“質(zhì)”的方面的研究，這個(gè)方法需要計(jì)算的數(shù)據(jù)較少。
定量分析法：通過具體的數(shù)字，使人們對(duì)研究對(duì)象的認(rèn)識(shí)進(jìn)一步精確化。
跨學(xué)科研究法：運(yùn)用多學(xué)科的理論、方法和成果從整體上對(duì)某一課題進(jìn)行研究。
功能分析法：這是社會(huì)科學(xué)用來分析社會(huì)現(xiàn)象的一種方法，從某一功能出發(fā)研究多個(gè)方面的影響。
模擬法：通過創(chuàng)設(shè)一個(gè)與原型相似的模型來間接研究原型某種特性的一種形容方法。
三、棉蚜地理種群重復(fù)序列引物擴(kuò)增DNA多態(tài)性分析(英文)（論文提綱范文）
（1）遼寧省二化螟種群遺傳變異及腸道細(xì)菌多樣性研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第一章 二化螟種群遺傳與腸道細(xì)菌研究進(jìn)展 |
| 1.1 二化螟研究概述 |
| 1.1.1 二化螟分布與危害 |
| 1.1.2 二化螟主要生物學(xué)特性 |
| 1.1.3 遼寧省二化螟發(fā)生現(xiàn)狀 |
| 1.2 昆蟲種群遺傳學(xué)研究 |
| 1.2.1 種群遺傳學(xué)概念 |
| 1.2.2 分子標(biāo)記技術(shù)在種群遺傳學(xué)應(yīng)用概述 |
| 1.2.3 二化螟遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展 |
| 1.3 昆蟲腸道細(xì)菌研究 |
| 1.3.1 昆蟲腸道細(xì)菌多樣性研究進(jìn)展 |
| 1.3.2 影響昆蟲腸道細(xì)菌多樣性因素 |
| 1.4 本研究目的與意義 |
| 第二章 基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記的遼寧省二化螟種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 2.1 材料與方法 |
| 2.1.1 樣品采集與保存 |
| 2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器 |
| 2.1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑 |
| 2.1.4 基因組DNA提取 |
| 2.1.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選及PCR擴(kuò)增 |
| 2.2 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)處理 |
| 2.2.1 遺傳多樣性與遺傳分化 |
| 2.2.2 種群遺傳結(jié)構(gòu) |
| 2.2.3 瓶頸效應(yīng)與遷移個(gè)體檢測(cè) |
| 2.3 結(jié)果與分析 |
| 2.3.1 熒光引物篩選及分組 |
| 2.3.2 遺傳變異與遺傳多樣性 |
| 2.3.3 種群遺傳分化與基因流 |
| 2.3.4 種群遺傳結(jié)構(gòu) |
| 2.3.5 地理距離與遺傳距離相關(guān)性 |
| 2.3.6 瓶頸效應(yīng)分析 |
| 2.3.7 個(gè)體分配與遷移檢測(cè) |
| 2.4 討論 |
| 2.4.1 遺傳多樣性與遺傳分化 |
| 2.4.2 種群遺傳結(jié)構(gòu) |
| 2.4.3 二化螟防控策略 |
| 第三章 遼寧省不同地理種群二化螟腸道細(xì)菌多樣性及群落結(jié)構(gòu) |
| 3.1 材料與方法 |
| 3.1.1 供試?yán)ハx |
| 3.1.2 二化螟腸道的解剖與保存 |
| 3.1.3 DNA提取及PCR擴(kuò)增 |
| 3.1.4 文庫構(gòu)建及測(cè)序 |
| 3.1.5 測(cè)序數(shù)據(jù)前處理 |
| 3.1.6 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)分析 |
| 3.2 結(jié)果與分析 |
| 3.2.1 序列統(tǒng)計(jì)及物種注釋 |
| 3.2.2 不同地理種群二化螟腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu) |
| 3.2.3 Alpha多樣性與豐富度指數(shù)分析 |
| 3.2.4 Beta多樣性分析 |
| 3.2.5 LEfSe分析 |
| 3.2.6 系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析 |
| 3.2.7 腸道菌群與環(huán)境因子的相關(guān)性分析 |
| 3.2.8 腸道細(xì)菌16SrDNA基因功能預(yù)測(cè) |
| 3.3 討論 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 致謝 |
（2）遼寧省稻曲病菌生物學(xué)特性及遺傳多樣性研究（論文提綱范文）
| 中文摘要 |
| 英文摘要 |
| 第一章 稻曲病菌生物學(xué)特性及遺傳多樣性研究進(jìn)展 |
| 1.1 稻曲病的癥狀及危害 |
| 1.2 稻曲病菌的生物學(xué)特性研究進(jìn)展 |
| 1.2.1 稻曲病菌的厚垣孢子 |
| 1.2.2 稻曲病菌的薄壁分生孢子 |
| 1.2.3 稻曲病菌的子囊孢子 |
| 1.2.4 稻曲病菌的分離及菌落特征 |
| 1.3 稻曲病菌的人工接種及致病力研究進(jìn)展 |
| 1.3.1 稻曲病菌的人工接種 |
| 1.3.2 稻曲病菌的致病力 |
| 1.4 稻曲病菌的遺傳多樣性研究進(jìn)展 |
| 1.4.1 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù) |
| 1.4.2 擴(kuò)增片段長度多態(tài)性技術(shù) |
| 1.4.3 重復(fù)序列PCR技術(shù) |
| 1.4.4 簡單重復(fù)序列技術(shù) |
| 1.4.5 單核苷酸多態(tài)性技術(shù) |
| 1.5 本研究選題依據(jù)及意義 |
| 第二章 遼寧省稻曲病菌分離及rDNA-ITS鑒定 |
| 2.1 材料與方法 |
| 2.1.1 供試試劑、儀器及培養(yǎng)基 |
| 2.1.2 樣品的采集及分離純化 |
| 2.1.3 供試菌株的DNA提取 |
| 2.1.4 供試菌株的rDNA-ITS擴(kuò)增及序列測(cè)定 |
| 2.1.5 數(shù)據(jù)分析 |
| 2.2 結(jié)果與分析 |
| 2.2.1 稻曲病粒樣品分離結(jié)果 |
| 2.2.2 供試菌株的形態(tài)特征 |
| 2.2.3 供試菌株的rDNA-ITS序列擴(kuò)增 |
| 2.2.4 供試菌株的rDNA-ITS序列比對(duì) |
| 2.2.5 供試菌株的rDNA-ITS序列聚類分析 |
| 2.2.6 供試菌株的遺傳關(guān)系分化 |
| 2.3 本章小結(jié) |
| 第三章 遼寧省不同地區(qū)稻曲病菌的生物學(xué)特性比較 |
| 3.1 材料與方法 |
| 3.1.1 供試試劑、儀器及培養(yǎng)基 |
| 3.1.2 供試菌株 |
| 3.1.3 不同培養(yǎng)基對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率及菌落背面顏色的影響 |
| 3.1.4 不同碳氮源對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率及菌落背面顏色的影響 |
| 3.1.5 不同溫度對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.1.6 不同pH對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.1.7 不同光照條件對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.1.8 菌絲及薄壁分生孢子致死溫度測(cè)定 |
| 3.1.9 數(shù)據(jù)分析 |
| 3.2 結(jié)果與分析 |
| 3.2.1 不同培養(yǎng)基對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率及菌落背面顏色的影響 |
| 3.2.2 不同碳氮源對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率及菌落背面顏色的影響 |
| 3.2.3 不同溫度對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.2.4 不同pH對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.2.5 不同光照條件對(duì)稻曲病菌菌絲生長速率、菌落背面顏色及薄壁分生孢子萌發(fā)速率的影響 |
| 3.2.6 菌絲及薄壁分生孢子致死溫度測(cè)定 |
| 3.2.7 稻曲病菌的菌絲生長速率與不同菌株和培養(yǎng)環(huán)境之間的相關(guān)性 |
| 3.2.8 稻曲病菌的菌落背面顏色與不同菌株和培養(yǎng)環(huán)境之間的相關(guān)性 |
| 3.2.9 稻曲病菌的薄壁分生孢子萌發(fā)速率與不同菌株和培養(yǎng)環(huán)境之間的相關(guān)性 |
| 3.3 本章小結(jié) |
| 第四章 遼寧省稻曲病菌rep-PCR遺傳多樣性及致病力分析 |
| 4.1 材料與方法 |
| 4.1.1 供試試劑、儀器及培養(yǎng)基 |
| 4.1.2 供試菌株及水稻品種 |
| 4.1.3 遼寧省稻曲病菌遺傳多樣性分析 |
| 4.1.4 遼寧省稻曲病菌致病力分析 |
| 4.1.5 數(shù)據(jù)分析 |
| 4.2 結(jié)果與分析 |
| 4.2.1 遼寧省稻曲病菌DNA指紋圖譜分析 |
| 4.2.2 基于聚類分析的遼寧省稻曲病菌類群劃分 |
| 4.2.3 不同地理來源遼寧省稻曲病菌的致病型 |
| 4.2.4 遼寧省稻曲病菌不同遺傳類群的致病型 |
| 4.3 本章小結(jié) |
| 第五章 遼寧省稻曲病菌SRAP體系建立及遺傳多樣性分析 |
| 5.1 材料與方法 |
| 5.1.1 供試試劑、儀器及培養(yǎng)基 |
| 5.1.2 供試菌株及引物 |
| 5.1.3 稻曲病菌DNA提取及檢測(cè) |
| 5.1.4 基準(zhǔn)SRAP反應(yīng)體系及程序 |
| 5.1.5 SRAP隨機(jī)引物篩選 |
| 5.1.6 SRAP反應(yīng)體系中單因素優(yōu)化 |
| 5.1.7 SRAP反應(yīng)體系優(yōu)化的正交設(shè)計(jì) |
| 5.1.8 SRAP優(yōu)化體系的確立及稻曲病菌的遺傳多樣性分析 |
| 5.1.9 數(shù)據(jù)分析 |
| 5.2 結(jié)果與分析 |
| 5.2.1 SRAP引物篩選 |
| 5.2.2 SRAP反應(yīng)體系中單因素優(yōu)化 |
| 5.2.3 正交試驗(yàn)擴(kuò)增圖譜的直觀分析及方差分析 |
| 5.2.4 稻曲病菌SRAP-PCR擴(kuò)增結(jié)果 |
| 5.2.5 稻曲病菌種群遺傳多樣性 |
| 5.2.6 稻曲病菌種群遺傳分化 |
| 5.2.7 稻曲病菌種群遺傳距離 |
| 5.2.8 稻曲病菌種群聚類分析 |
| 5.3 本章小結(jié) |
| 第六章 結(jié)論與討論 |
| 6.1 結(jié)論 |
| 6.1.1 遼寧省稻曲病菌分離及rDNA-ITS鑒定 |
| 6.1.2 遼寧省不同地區(qū)稻曲病菌生物學(xué)特性比較 |
| 6.1.3 遼寧省稻曲病菌rep-PCR遺傳多樣性及致病力分析 |
| 6.1.4 遼寧省稻曲病菌SRAP體系建立及遺傳多樣性分析 |
| 6.2 討論 |
| 6.2.1 遼寧省稻曲病菌分離及rDNA-ITS鑒定 |
| 6.2.2 遼寧省不同地區(qū)稻曲病菌生物學(xué)特性比較 |
| 6.2.3 遼寧省稻曲病菌rep-PCR遺傳多樣性及致病力分析 |
| 6.2.4 遼寧省稻曲病菌SRAP體系建立及遺傳多樣性分析 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 致謝 |
| 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況 |
（3）基于SSR標(biāo)記及mt DNA序列的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析（論文提綱范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 第1章 前言 |
| 1.1 塔里木裂腹魚介紹 |
| 1.1.1 塔里木裂腹魚的分布和資源現(xiàn)狀 |
| 1.1.2 塔里木裂腹魚研究進(jìn)展 |
| 1.2 魚類遺傳多樣性及研究方法 |
| 1.2.1 遺傳多樣性的概念 |
| 1.2.2 魚類遺傳多樣性的研究方法 |
| 1.3 微衛(wèi)星分子標(biāo)記 |
| 1.3.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記及其特點(diǎn) |
| 1.3.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記在魚類研究中的應(yīng)用 |
| 1.4 線粒體DNA標(biāo)記 |
| 1.4.1 線粒體的一般結(jié)構(gòu)和特征 |
| 1.4.2 線粒體分子標(biāo)記在魚類研究中的應(yīng)用 |
| 1.5 本研究的目的和意義 |
| 第2章 塔里木裂腹魚基因組微衛(wèi)星特征及SSR標(biāo)記的開發(fā) |
| 2.1 材料與方法 |
| 2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 |
| 2.2.1 塔里木裂腹魚基因組SSR頻率及其SSR重復(fù)基序類型 |
| 2.2.2 塔里木裂腹魚微衛(wèi)星的豐度及分布密度分析 |
| 2.2.3 塔里木裂腹魚基因組微衛(wèi)星長度分布及變異 |
| 2.2.4 基因組DNA的提取 |
| 2.2.5 引物的設(shè)計(jì)及多態(tài)性SSR位點(diǎn)的篩選 |
| 2.2.6 毛細(xì)管電泳和多態(tài)性引物信息 |
| 2.2.7 引物多態(tài)性分析 |
| 2.3 討論 |
| 2.3.1 塔里木裂腹魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā) |
| 2.3.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性分析 |
| 2.4 小結(jié) |
| 第3章 基于SSR標(biāo)記的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析 |
| 3.1 材料與方法 |
| 3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 3.2 結(jié)果與分析 |
| 3.2.1 塔里木裂腹魚群體的遺傳多樣性 |
| 3.2.2 塔里木裂腹魚群體間遺傳結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系 |
| 3.3 討論 |
| 3.3.1 塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析 |
| 3.3.2 塔里木裂腹魚群體遺傳結(jié)構(gòu) |
| 3.3.3 塔里木裂腹魚種群遺傳關(guān)系 |
| 3.4 小結(jié) |
| 第4章 基于線粒體DNA的 COII、ND4 基因序列的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析 |
| 4.1 材料和方法 |
| 4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 4.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 |
| 4.2.1 基于線粒體COII基因序列的結(jié)果與分析 |
| 4.2.2 基于線粒體ND4 基因序列的結(jié)果與分析 |
| 4.3 討論 |
| 4.3.1 堿基組成和序列變異分析 |
| 4.3.2 塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析 |
| 4.3.3 塔里木裂腹魚群體遺傳結(jié)構(gòu) |
| 4.3.4 塔里木裂腹魚種群歷史動(dòng)態(tài) |
| 4.3.5 2種線粒體分子標(biāo)記的比較 |
| 4.3.6 微衛(wèi)星標(biāo)記和線粒體分子標(biāo)記的比較 |
| 4.4 小結(jié) |
| 第5章 結(jié)論 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 致謝 |
| 作者簡介 |
（4）老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及落粒相關(guān)基因QTL定位（論文提綱范文）
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 第一章 引言 |
| 第二章 國內(nèi)外研究進(jìn)展 |
| 2.1 遺傳多樣性及DNA分子標(biāo)記研究進(jìn)展 |
| 2.1.1 遺傳多樣性概述及研究方法 |
| 2.1.2 DNA分子標(biāo)記的類型 |
| 2.1.3 DNA分子標(biāo)記的應(yīng)用 |
| 2.1.4 披堿草屬植物遺傳進(jìn)化研究 |
| 2.1.5 老芒麥遺傳多樣性研究 |
| 2.2 DNA測(cè)序技術(shù)原理及研究進(jìn)展 |
| 2.3 遺傳圖譜構(gòu)建及QLT定位 |
| 2.3.1 遺傳作圖原理與方法 |
| 2.3.2 QTL作圖原理與方法 |
| 2.3.3 牧草遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL定位研究進(jìn)展 |
| 2.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析 |
| 2.4.1 關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)、優(yōu)勢(shì)和策略 |
| 2.4.2 牧草重要農(nóng)藝性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析研究進(jìn)展 |
| 2.5 落粒性狀及禾本科牧草落粒研究進(jìn)展 |
| 2.5.1 植物器官脫落的解剖學(xué)基礎(chǔ) |
| 2.5.2 植物器官脫落的生理基礎(chǔ) |
| 2.5.3 落?；蜓芯窟M(jìn)展 |
| 2.5.4 禾本科牧草落粒研究進(jìn)展 |
| 2.6 老芒麥育種研究概況 |
| 2.7 本研究的目的意義及技術(shù)路線 |
| 2.7.1 目的及意義 |
| 2.7.2 技術(shù)路線 |
| 第三章 老芒麥EST-SSR分子標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用 |
| 3.1 前言 |
| 3.2 材料與方法 |
| 3.2.1 供試材料 |
| 3.2.2 EST-SSR分子標(biāo)記識(shí)別 |
| 3.2.3 DNA提取及濃度檢測(cè) |
| 3.2.4 PCR擴(kuò)增及凝膠電泳 |
| 3.2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列驗(yàn)證 |
| 3.2.6 數(shù)據(jù)處理 |
| 3.3 結(jié)果 |
| 3.3.1 EST-SSR的頻率及分布 |
| 3.3.2 引物通用性及多態(tài)性分析 |
| 3.3.3 PCR產(chǎn)物驗(yàn)證 |
| 3.3.4 披堿草屬遺傳多樣性分析 |
| 3.3.5 披堿草屬遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳進(jìn)化分析 |
| 3.4 討論 |
| 3.4.1 基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的老芒麥EST-SSR分子標(biāo)記開發(fā) |
| 3.4.2 披堿草屬不同基因組材料的遺傳進(jìn)化關(guān)系 |
| 3.4.3 種質(zhì)資源保存策略 |
| 第四章 老芒麥種質(zhì)資源遺傳多樣性評(píng)價(jià)與作圖群體構(gòu)建 |
| 4.1 前言 |
| 4.2 材料與方法 |
| 4.2.1 供試材料 |
| 4.2.2 試驗(yàn)地概況 |
| 4.2.3 表型觀測(cè)項(xiàng)目及方法 |
| 4.2.4 DNA提取及PCR擴(kuò)增 |
| 4.2.5 數(shù)據(jù)處理 |
| 4.3 結(jié)果 |
| 4.3.1 老芒麥種質(zhì)資源落粒性評(píng)價(jià) |
| 4.3.2 EST-SSR標(biāo)記多態(tài)性及老芒麥遺傳多樣性分析 |
| 4.3.3 遺傳圖譜作圖親本選擇 |
| 4.3.4 F_1群體構(gòu)建及其遺傳和表型變異評(píng)價(jià) |
| 4.4 討論 |
| 4.4.1 老芒麥遺傳多樣性 |
| 4.4.2 老芒麥落粒性遺傳改良 |
| 第五章 老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建與落粒QTL定位 |
| 5.1 前言 |
| 5.2 材料與方法 |
| 5.2.1 供試材料 |
| 5.2.2 試驗(yàn)地概況 |
| 5.2.3 表型觀測(cè)項(xiàng)目及方法 |
| 5.2.4 基因組DNA提取、SLAF文庫構(gòu)建及高通量測(cè)序 |
| 5.2.5 高密度遺傳圖譜構(gòu)建 |
| 5.2.6 落粒相關(guān)性狀QTL分析 |
| 5.2.7 候選基因挖掘 |
| 5.3 結(jié)果 |
| 5.3.1 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與評(píng)價(jià) |
| 5.3.2 SLAF標(biāo)簽開發(fā) |
| 5.3.3 遺傳圖譜構(gòu)建 |
| 5.3.4 圖譜質(zhì)量評(píng)價(jià) |
| 5.3.5 F_2群體表型變異 |
| 5.3.6 QTL作圖及比較基因組分析 |
| 5.4 討論 |
| 5.4.1 基于新一代基因組測(cè)序技術(shù)構(gòu)建首張老芒麥高密度遺傳圖譜 |
| 5.4.2 老芒麥落粒性QLT位點(diǎn)檢測(cè) |
| 5.4.3 老芒麥落粒候選基因挖掘 |
| 第六章 老芒麥落粒性全基因組關(guān)聯(lián)分析 |
| 6.1 前言 |
| 6.2 材料與方法 |
| 6.2.1 供試材料 |
| 6.2.2 試驗(yàn)地概況 |
| 6.2.3 表型觀測(cè)項(xiàng)目及方法 |
| 6.2.4 基因組DNA提取、酶切建庫、測(cè)序及SLAF標(biāo)簽開發(fā) |
| 6.2.5 遺傳進(jìn)化、親緣關(guān)系及連鎖不平衡分析 |
| 6.2.6 全基因組關(guān)聯(lián)分析 |
| 6.2.7 候選基因 |
| 6.3 結(jié)果 |
| 6.3.1 實(shí)驗(yàn)建庫評(píng)估及測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) |
| 6.3.2 SLAF標(biāo)簽開發(fā)及SNP信息統(tǒng)計(jì) |
| 6.3.3 連鎖不平衡和親緣關(guān)系分析 |
| 6.3.4 遺傳進(jìn)化分析 |
| 6.3.5 表型性狀評(píng)價(jià)及相關(guān)性分析 |
| 6.3.6 關(guān)聯(lián)分析 |
| 6.3.6.1 老芒麥落粒性關(guān)聯(lián)分析及候選基因挖掘 |
| 6.3.6.2 老芒麥種子相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析及候選基因挖掘 |
| 6.3.6.3 老芒麥產(chǎn)量相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析及候選基因挖掘 |
| 6.4 討論 |
| 6.4.1 連鎖不平衡與群體結(jié)構(gòu) |
| 6.4.2 表型多樣性與關(guān)聯(lián)分析 |
| 6.4.3 落粒候選基因挖掘 |
| 第七章 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn) |
| 7.1 結(jié)論 |
| 7.2 主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn) |
| 7.3 展望 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附表 |
| 附圖 |
| 縮略詞表 |
| 在學(xué)期間參與的科研項(xiàng)目 |
| 在學(xué)期間的研究成果 |
| 在學(xué)期間獲得的榮譽(yù) |
| 致謝 |
（5）五種斑潛蠅形態(tài)特征比較研究及重要種的遺傳結(jié)構(gòu)分析（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 1 斑潛蠅屬的研究概況 |
| 1.1 斑潛蠅屬的分類研究簡史 |
| 1.2 斑潛蠅屬的形態(tài)分類 |
| 1.3 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒別特征 |
| 1.3.1 三葉斑潛蠅 |
| 1.3.2 美洲斑潛蠅 |
| 1.3.3 南美斑潛蠅 |
| 1.3.4 番茄斑潛蠅 |
| 1.3.5 蔥斑潛蠅 |
| 1.4 五種重要斑潛蠅的研究概況 |
| 1.4.1 三葉斑潛蠅 |
| 1.4.2 美洲斑潛蠅 |
| 1.4.3 南美斑潛蠅 |
| 1.4.4 番茄斑潛蠅 |
| 1.4.5 蔥斑潛蠅 |
| 1.5 五種重要斑潛蠅的分子生物學(xué)研究 |
| 2 物種分化的方式 |
| 2.1 異域物種分化 |
| 2.2 同域物種分化 |
| 2.3 種群分化研究概述 |
| 2.4 昆蟲本身具備的種群分化的條件 |
| 2.5 斑潛蠅的種群分化研究 |
| 3 線粒體基因組學(xué)研究概況 |
| 3.1 線粒體簡介 |
| 3.2 動(dòng)物線粒體基因組 |
| 3.3 線粒體DNA的進(jìn)化 |
| 3.4 線粒體RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)變化 |
| 3.5 斑潛蠅線粒體基因組研究概況 |
| 4 微衛(wèi)星標(biāo)記研究概況 |
| 4.1 微衛(wèi)星序列的概念和類型 |
| 4.2 微衛(wèi)星的功能 |
| 4.2.1 作為重組和復(fù)制密碼 |
| 4.2.2 參與結(jié)構(gòu)基因的表達(dá) |
| 4.2.3 作為染色質(zhì)折疊密碼 |
| 4.2.4 與性別決定有關(guān) |
| 4.2.5 與蛋白表達(dá)的劑量效應(yīng)有關(guān) |
| 4.2.6 參與組成端粒與著絲粒結(jié)構(gòu) |
| 4.3 微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性形成的機(jī)理 |
| 4.3.1 滑鏈錯(cuò)配假說 |
| 4.3.2 基因重組假說 |
| 4.4 微衛(wèi)星標(biāo)記的特點(diǎn) |
| 4.4.1 數(shù)量豐富 |
| 4.4.2 豐富的多態(tài)性 |
| 4.4.3 共顯性遺傳 |
| 4.4.4 具有一定的通用性 |
| 4.4.5 檢測(cè)的高效性 |
| 5 小結(jié)與討論 |
| 第二章 五種重要斑潛蠅的形態(tài)鑒定研究 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 供試樣本 |
| 1.2 主要試劑 |
| 1.3 主要儀器 |
| 1.4 觀察、解剖及拍攝方法 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 雄性外生殖器 |
| 2.2 內(nèi)外項(xiàng)鬃著生區(qū)域顏色 |
| 2.3 翅脈M3+4脈比例 |
| 2.4 腹部背面觀 |
| 3 討論與小結(jié) |
| 第三章 基于線粒體基因COI與核基因EF-1A的種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 供試樣本 |
| 1.2 主要試劑 |
| 1.3 主要儀器 |
| 1.4 基因組DNA的提取 |
| 1.5 引物設(shè)計(jì)和PCR反應(yīng) |
| 1.6 PCR產(chǎn)物檢測(cè)及測(cè)序 |
| 1.7 序列整理及數(shù)據(jù)分析 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 基因片段的序列分析 |
| 2.1.1 三葉斑潛蠅種群COI基因片段的序列分析 |
| 2.1.2 三葉斑潛蠅種群EF-1a基因片段的序列分析 |
| 2.2 五種斑潛蠅遺傳多樣性的分析 |
| 2.2.1五種斑潛蠅COI基因各種群內(nèi)的遺傳多樣性分析 |
| 2.2.2 五種斑潛蠅EF-1a基因各種群內(nèi)的遺傳多樣性分析 |
| 2.3 三葉斑潛蠅種群間遺傳多樣性的分析 |
| 2.3.1 三葉斑潛蠅種群間遺傳分化 |
| 2.3.2 分子變異分析 |
| 2.4 5種斑潛蠅單倍型系統(tǒng)發(fā)育 |
| 2.4.1 5種斑潛蠅系統(tǒng)發(fā)育樹 |
| 2.4.2 三葉斑潛蠅種群系統(tǒng)發(fā)育樹 |
| 2.5 單倍型網(wǎng)絡(luò)圖 |
| 2.5.1 三葉斑潛蠅單倍型的網(wǎng)狀圖 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第四章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的三葉斑潛蠅及近似種種群遺傳結(jié)構(gòu)對(duì)比分析 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 供試樣本 |
| 1.2 主要試劑及主要儀器 |
| 1.3 基因組DNA的提取 |
| 1.4 微衛(wèi)星序列的檢測(cè)與引物設(shè)計(jì) |
| 1.5 微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性檢測(cè) |
| 1.6 微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增 |
| 1.7 基因分型 |
| 1.8 數(shù)據(jù)分析 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 基因組DNA提取結(jié)果 |
| 2.2 引物篩選結(jié)果 |
| 2.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果 |
| 2.4 種群的遺傳多樣性 |
| 2.4.1 位點(diǎn)間的遺傳多樣性 |
| 2.4.2 種群間的遺傳多樣性 |
| 2.4.3 種群間的遺傳分化 |
| 2.5 種群遺傳結(jié)構(gòu) |
| 2.6 瓶頸效應(yīng)的檢測(cè) |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第五章 蔥斑潛蠅線粒體基因組 |
| 1 材料和方法 |
| 1.1 樣品和DNA提取 |
| 1.2 PCR擴(kuò)增和測(cè)序反應(yīng) |
| 1.3 測(cè)序組裝、注釋和分析 |
| 1.4 系統(tǒng)進(jìn)化分析 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 核苷酸組成 |
| 2.2 蛋白質(zhì)編碼基因 |
| 2.3 轉(zhuǎn)運(yùn)tRNA基因 |
| 2.4 核糖體rRNA基因 |
| 2.5 控制區(qū)(A+T富含區(qū)) |
| 2.6 系統(tǒng)進(jìn)化分析 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄 |
| 致謝 |
| 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄 |
（6）我國棗食芽象甲種群遺傳結(jié)構(gòu)、適生性及種群歷史動(dòng)態(tài)研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 1.1 我國棗食芽象甲研究概述 |
| 1.1.1 我國棗樹分布及病蟲害現(xiàn)狀 |
| 1.1.2 我國棗食芽象甲分布概況 |
| 1.1.3 棗食芽象甲生物學(xué)特征 |
| 1.1.4 棗食芽象甲的研究現(xiàn)狀 |
| 1.2 種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 1.2.1 種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)概念 |
| 1.2.2 遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的影響因素 |
| 1.2.3 遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的研究方法 |
| 1.2.4 遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的研究意義 |
| 1.3 分子系統(tǒng)地理學(xué)研究 |
| 1.3.1 分子系統(tǒng)地理學(xué)概念 |
| 1.3.2 分子系統(tǒng)地理學(xué)重要理論 |
| 1.3.3 分子系統(tǒng)地理學(xué)研究方法 |
| 1.3.4 分子系統(tǒng)地理學(xué)的研究應(yīng)用 |
| 1.4 物種生態(tài)位模型研究 |
| 1.4.1 生態(tài)位的概念和發(fā)展 |
| 1.4.2 生態(tài)位模型的概念和類型 |
| 1.4.3 生態(tài)位模型的研究應(yīng)用 |
| 1.5 本研究目的和意義 |
| 1.5.1 研究目的意義 |
| 1.5.2 研究技術(shù)路線 |
| 第二章 基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的棗食芽象甲微衛(wèi)星位點(diǎn)信息分析 |
| 2.1 材料與方法 |
| 2.1.1 供試成蟲 |
| 2.1.2 主要儀器及試劑 |
| 2.1.3 成蟲總RNA的提取 |
| 2.1.4 cDNA文庫構(gòu)建及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 |
| 2.1.5 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)組裝分析及微衛(wèi)星篩選 |
| 2.1.6 成蟲基因組DNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 2.1.7 微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增 |
| 2.1.8 非變性聚丙烯酰胺電泳及T載體連接轉(zhuǎn)化 |
| 2.2 結(jié)果與分析 |
| 2.2.1 轉(zhuǎn)錄組序列組裝及注釋 |
| 2.2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)在轉(zhuǎn)錄組中的分布特征 |
| 2.2.3 微衛(wèi)星引物PCR擴(kuò)增 |
| 2.2.4 非變性聚丙烯酰胺電泳及連接轉(zhuǎn)化引物篩選 |
| 2.3 討論 |
| 第三章 棗食芽象甲線粒體基因組全序列測(cè)定與系統(tǒng)發(fā)育研究 |
| 3.1 材料與方法 |
| 3.1.1 供試成蟲 |
| 3.1.2 主要儀器和試劑 |
| 3.1.3 成蟲基因組DNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 3.1.4 DNA文庫構(gòu)建及測(cè)序 |
| 3.1.5 數(shù)據(jù)預(yù)處理及線粒體基因組序列拼接和鑒定 |
| 3.1.6 基因功能注釋和全基因組圈圖繪制 |
| 3.1.7 系統(tǒng)發(fā)育分析 |
| 3.2 結(jié)果與分析 |
| 3.2.1 線粒體全基因組結(jié)構(gòu) |
| 3.2.2 線粒體基因組蛋白質(zhì)編碼基因特征 |
| 3.2.3 線粒體基因組非編碼區(qū)特征 |
| 3.2.4 棗食芽象甲系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究 |
| 3.3 討論 |
| 第四章 基于微衛(wèi)星的棗食芽象甲地理種群遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 4.1 材料與方法 |
| 4.1.1 供試成蟲及采樣信息 |
| 4.1.2 試劑和儀器 |
| 4.1.3 基因組DNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 4.1.4 微衛(wèi)星熒光標(biāo)記引物的合成及PCR擴(kuò)增 |
| 4.1.5 毛細(xì)管電泳基因分型 |
| 4.1.6 種群遺傳多樣性分析 |
| 4.1.7 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 4.2 結(jié)果與分析 |
| 4.2.1 熒光標(biāo)記PCR擴(kuò)增結(jié)果檢測(cè) |
| 4.2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)基因分型分析 |
| 4.2.3 哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn) |
| 4.2.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)的無效等位基因頻率 |
| 4.2.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性分析 |
| 4.2.6 微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因頻率 |
| 4.2.7 不同地理種群的遺傳多樣性分析 |
| 4.2.8 不同地理種群的遺傳分化和基因流分析 |
| 4.2.9 種群系統(tǒng)發(fā)育樹分析 |
| 4.2.10 種群主成分分析 |
| 4.2.11 STRUCTURE結(jié)構(gòu)分析 |
| 4.2.12 種群間遺傳距離與地理距離的相關(guān)性分析 |
| 4.2.13 AMOVA分子方差分析 |
| 4.3 討論 |
| 第五章 基于線粒體和核基因的棗食芽象甲地理種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 5.1 材料與方法 |
| 5.1.1 供試成蟲 |
| 5.1.2 試劑和儀器 |
| 5.1.3 基因組DNA提取 |
| 5.1.4 線粒體基因引物篩選及PCR擴(kuò)增 |
| 5.1.5 核基因引物篩選及PCR擴(kuò)增 |
| 5.1.6 序列比對(duì)分析 |
| 5.1.7 種群遺傳多樣性分析 |
| 5.1.8 單倍型系統(tǒng)發(fā)育分析 |
| 5.1.9 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 5.2 結(jié)果與分析 |
| 5.2.1 PCR擴(kuò)增及測(cè)序結(jié)果檢測(cè) |
| 5.2.2 基因序列變異統(tǒng)計(jì)和單倍型分析 |
| 5.2.3 地理種群的遺傳多樣性分析 |
| 5.2.4 單倍型在地理種群中的分布 |
| 5.2.5 地理種群的單倍型系統(tǒng)發(fā)育分析 |
| 5.2.6 地理種群的單倍型鄰接網(wǎng)絡(luò)分析 |
| 5.2.7 地理種群空間分組分析 |
| 5.2.8 地理種群遺傳分化和基因流分析 |
| 5.3 討論 |
| 第六章 棗食芽象甲在我國的適生性與適生環(huán)境因子分析 |
| 6.1 材料與方法 |
| 6.1.1 棗食芽象甲全國分布數(shù)據(jù) |
| 6.1.2 環(huán)境變量指標(biāo)的選取 |
| 6.1.3 MaxEnt模型適生性分析 |
| 6.1.4 模型評(píng)價(jià)和適生環(huán)境因子分析 |
| 6.1.5 不同時(shí)期適生區(qū)分布變化及避難所推測(cè) |
| 6.2 結(jié)果與分析 |
| 6.2.1 MaxEnt模型評(píng)價(jià) |
| 6.2.2 適生性分布預(yù)測(cè)結(jié)果 |
| 6.2.3 適生區(qū)分布變化及避難所推測(cè) |
| 6.2.4 主要適生環(huán)境因子分析 |
| 6.3 討論 |
| 第七章 棗食芽象甲種群歷史動(dòng)態(tài)及擴(kuò)散路徑分析 |
| 7.1 材料與方法 |
| 7.1.1 種群歷史動(dòng)態(tài)分析 |
| 7.1.2 種群分歧時(shí)間估算 |
| 7.1.3 種群歷史遷移率分析 |
| 7.1.4 種群擴(kuò)散路徑預(yù)測(cè) |
| 7.2 結(jié)果與分析 |
| 7.2.1 種群歷史動(dòng)態(tài)分析 |
| 7.2.2 種群分歧時(shí)間估算 |
| 7.2.3 種群歷史遷移率分析 |
| 7.2.4 種群擴(kuò)散路徑預(yù)測(cè) |
| 7.3 討論 |
| 第八章 全文總結(jié)與研究展望 |
| 8.1 全文主要結(jié)論 |
| 8.2 本文創(chuàng)新點(diǎn) |
| 8.3 問題與展望 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄A 8個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在不同種群中的等位基因數(shù)量及頻率 |
| 附錄B WORLDCLIM環(huán)境變量指標(biāo)值名稱 |
| 附錄C 棗食芽象甲不同類群相鄰種群間的遷移率 |
| 致謝 |
| 個(gè)人簡歷 |
（7）斜紋夜蛾誘集種群動(dòng)態(tài)及不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu)分析的研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 1.1 斜紋夜蛾生物學(xué) |
| 1.1.1 斜紋夜蛾的歷史記載和分類地位 |
| 1.1.2 斜紋夜蛾的分布和近緣種 |
| 1.1.3 斜紋夜蛾的寄主植物 |
| 1.1.4 斜紋夜蛾的發(fā)生與為害 |
| 1.2 昆蟲遷飛研究介紹 |
| 1.2.1 遷飛昆蟲概述 |
| 1.2.2 遷飛行為研究內(nèi)容 |
| 1.2.3 斜紋夜蛾遷飛研究現(xiàn)狀 |
| 1.3 分子標(biāo)記概述 |
| 1.3.1 AFLP分子標(biāo)記概述 |
| 1.3.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記概述 |
| 1.4 研究的目的和意義 |
| 1.5 研究的技術(shù)路線 |
| 第二章 斜紋夜蛾高空誘集數(shù)量及其卵巢發(fā)育動(dòng)態(tài) |
| 2.1 材料與方法 |
| 2.1.1 探照燈誘蟲器 |
| 2.1.2 誘蟲地點(diǎn) |
| 2.1.3 卵巢發(fā)育分級(jí) |
| 2.1.4 統(tǒng)計(jì)分析 |
| 2.2 結(jié)果 |
| 2.2.1 斜紋夜蛾誘蟲量動(dòng)態(tài) |
| 2.2.2 性比 |
| 2.2.3 卵巢發(fā)育級(jí)別分析 |
| 2.2.4 三地誘集的雌蛾交配率分析 |
| 2.3 討論 |
| 2.3.1 種群數(shù)量動(dòng)態(tài)及性比 |
| 2.3.2 卵巢發(fā)育及交配率 |
| 第三章 遷飛中的斜紋夜蛾保幼激素滴度動(dòng)態(tài) |
| 3.1 材料與方法 |
| 3.1.1 供試蟲源 |
| 3.1.2 儀器和化學(xué)試劑 |
| 3.1.3 保幼激素測(cè)定 |
| 3.1.4 數(shù)據(jù)處理與分析 |
| 3.2 結(jié)果 |
| 3.2.1 保幼激素的種類 |
| 3.2.2 室內(nèi)飼養(yǎng)不同日齡雌雄成蟲的保幼激素含量動(dòng)態(tài) |
| 3.2.3 斜紋夜蛾成蟲保幼激素的季節(jié)變化規(guī)律 |
| 3.3 討論 |
| 第四章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的斜紋夜蛾種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 4.1 材料與方法 |
| 4.1.1 供試蟲源 |
| 4.1.2 儀器設(shè)備 |
| 4.1.3 試劑 |
| 4.1.4 基因組DNA提取 |
| 4.1.5 斜紋夜蛾EST序列的下載與分析 |
| 4.1.6 引物合成與篩選 |
| 4.1.7 微衛(wèi)星位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增 |
| 4.1.8 微衛(wèi)星片段的電泳檢測(cè)及基因分型 |
| 4.1.9 數(shù)據(jù)分析 |
| 4.2 結(jié)果與分析 |
| 4.2.1 DNA的提取 |
| 4.2.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記的篩選 |
| 4.2.3 微衛(wèi)星片段長度基因分型 |
| 4.2.4 基于微衛(wèi)星數(shù)據(jù)的斜紋夜蛾種群遺傳變異分析 |
| 4.2.5 不同種群的哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡檢測(cè) |
| 4.2.6 連鎖不平衡檢測(cè) |
| 4.2.7 種群分化 |
| 4.2.8 中性檢測(cè) |
| 4.2.9 基于微衛(wèi)星的斜紋夜蛾群體遺傳結(jié)構(gòu)的分子方差分析 |
| 4.2.10 種群內(nèi)近交系數(shù) |
| 4.2.11 種群間固定指數(shù)FST和基因流Nm |
| 4.2.12 不同地理種群的遺傳一致度和遺傳距離 |
| 4.2.13 種群間遺傳距離、基因流與地理距離的相關(guān)性分析 |
| 4.2.14 基于微衛(wèi)星的斜紋夜蛾種群間系統(tǒng)發(fā)育分析 |
| 4.3 討論 |
| 4.3.1 斜紋夜蛾種群的遺傳多態(tài)性水平 |
| 4.3.2 斜紋夜蛾種群的遺傳結(jié)構(gòu)及基因流 |
| 4.3.3 斜紋夜蛾種群間的遺傳距離與系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系 |
| 第五章 不同地區(qū)斜紋夜蛾種群遺傳多樣性的AFLP分析 |
| 5.1 材料與方法 |
| 5.1.1 供試蟲源 |
| 5.1.2 儀器設(shè)備 |
| 5.1.3 試劑 |
| 5.1.4 主要生化試劑及緩沖液配制 |
| 5.1.5 模板DNA的雙酶切 |
| 5.1.6 酶切產(chǎn)物的連接 |
| 5.1.7 預(yù)擴(kuò)增反應(yīng) |
| 5.1.8 選擇性擴(kuò)增反應(yīng) |
| 5.1.9 聚丙烯酰胺凝膠電泳 |
| 5.1.10 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析 |
| 5.2 結(jié)果與分析 |
| 5.2.1 酶切與連接 |
| 5.2.2 預(yù)擴(kuò)增 |
| 5.2.3 選擇性擴(kuò)增及引物篩選 |
| 5.2.4 數(shù)據(jù)分析 |
| 5.3 討論 |
| 5.3.1 斜紋夜蛾種群遺傳多樣性 |
| 5.3.2 斜紋夜蛾種群的遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 5.3.3 聚類分析 |
| 第六章 總結(jié) |
| 6.1 全文總結(jié) |
| 6.2 本文創(chuàng)新點(diǎn) |
| 6.3 展望 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄1 攻讀博士期間發(fā)表和待發(fā)表的論文和成果 |
| 附錄2 TC-412 操作手冊(cè) |
| 致謝 |
（8）棉鈴蟲PBP1功能鑒定及不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 英文縮略語 |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 1.1 昆蟲性信息素 |
| 1.1.1 昆蟲性信息素的結(jié)構(gòu)組成 |
| 1.1.2 昆蟲性信息素的合成 |
| 1.1.3 昆蟲性信息素的應(yīng)用 |
| 1.2 昆蟲的嗅覺感受及其分子機(jī)制 |
| 1.2.1 嗅覺信號(hào)傳導(dǎo)的分子機(jī)制 |
| 1.2.2 嗅覺感受器 |
| 1.2.3 氣味結(jié)合蛋白 |
| 1.3 鱗翅目昆蟲性信息素結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展 |
| 1.3.1 性信息素結(jié)合蛋白的數(shù)量種類和結(jié)構(gòu)特征 |
| 1.3.2 性信息素結(jié)合蛋白的表達(dá)分布 |
| 1.3.3 性信息素結(jié)合蛋白的生理功能 |
| 1.3.4 性信息素結(jié)合蛋白對(duì)性信息素分子的結(jié)合和釋放機(jī)制 |
| 1.4 種群遺傳多樣性研究進(jìn)展 |
| 1.4.1 遺傳多樣性和種群分化 |
| 1.4.2 遺傳多樣性的影響因素 |
| 1.4.3 遺傳多樣性檢測(cè) |
| 1.5 基因操作技術(shù)研究進(jìn)展 |
| 1.5.1 RNA干擾研究進(jìn)展 |
| 1.5.2 CRISPR/Cas系統(tǒng) |
| 1.5.3 CRISPR/Cas系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及作用機(jī)理 |
| 1.5.4 CRISPR/Cas系統(tǒng)的應(yīng)用 |
| 1.6 本研究的目的和意義 |
| 第二章 棉鈴蟲性信息素結(jié)合蛋白PBP1的功能研究 |
| 2.1 材料和方法 |
| 2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 2.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 2.2 結(jié)果和分析 |
| 2.2.1 Cas9/sgRNA注射24h后的突變檢測(cè) |
| 2.2.2 PBP1純合突變個(gè)體的篩選 |
| 2.2.3 突變雄蛾的EAG檢測(cè) |
| 2.2.4 CRISPR/Cas9系統(tǒng)脫靶位點(diǎn)的檢測(cè) |
| 2.3 討論 |
| 第三章 棉鈴蟲不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較 |
| 3.1 材料和方法 |
| 3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 3.2 結(jié)果和分析 |
| 3.2.1 棉鈴蟲性腺中各組分的含量和比例分析 |
| 3.2.2 雄蛾田間誘捕量分析 |
| 3.3 討論 |
| 第四章 棉鈴蟲不同地理種群PBP基因的多態(tài)性分析 |
| 4.1 材料和方法 |
| 4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 4.1.2 實(shí)驗(yàn)方法 |
| 4.2 結(jié)果和分析 |
| 4.2.1 核苷酸多態(tài)性分析 |
| 4.3 討論 |
| 全文總結(jié) |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄: 攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文和參加的學(xué)術(shù)會(huì)議 |
| 致謝 |
（9）我國禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)及農(nóng)藥對(duì)其脅迫效應(yīng)研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 1.1 禾谷縊管蚜研究概述 |
| 1.1.1 分布與危害 |
| 1.1.2 生活史 |
| 1.1.3 抗藥性現(xiàn)狀 |
| 1.2 昆蟲遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 1.2.1 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的概念 |
| 1.2.2 遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)在害蟲防治中的意義 |
| 1.2.3 昆蟲遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的影響因素 |
| 1.3 分子標(biāo)記技術(shù)在昆蟲種群遺傳學(xué)中的應(yīng)用 |
| 1.3.1 基本概述 |
| 1.3.2 分子標(biāo)記的種類及特點(diǎn) |
| 1.3.3 分子標(biāo)記在昆蟲種群遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用 |
| 1.4 禾谷縊管蚜遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性研究 |
| 1.5 農(nóng)藥對(duì)昆蟲的亞致死效應(yīng) |
| 1.6 本研究目的和意義 |
| 第二章 禾谷縊管蚜微衛(wèi)星引物篩選及擴(kuò)增條件優(yōu)化 |
| 2.1 試驗(yàn)材料 |
| 2.1.1 供試蚜蟲 |
| 2.1.2 主要試劑及儀器 |
| 2.2 試驗(yàn)方法 |
| 2.2.1 樣品預(yù)處理 |
| 2.2.2 禾谷縊管蚜基因組DNA提取 |
| 2.2.3 基因組DNA質(zhì)量及純度檢測(cè) |
| 2.2.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)選取 |
| 2.2.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)引物合成 |
| 2.2.6 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系和反應(yīng)條件及產(chǎn)物檢測(cè) |
| 2.2.7 微衛(wèi)星PCR產(chǎn)物檢測(cè)及基因分型 |
| 2.3 數(shù)據(jù)分析 |
| 2.3.1 無效等位基因 |
| 2.3.2 多態(tài)信息含量 |
| 2.3.3 等位基因數(shù)和有效等位基因數(shù) |
| 2.3.4 等位基因頻率 |
| 2.3.5 觀測(cè)雜合度和期望雜合度 |
| 2.3.6 等位基因豐富度 |
| 2.3.7 近交系數(shù) |
| 2.3.8 哈迪-溫伯格平衡 |
| 2.4 結(jié)果與分析 |
| 2.4.1 禾谷縊管蚜基因組DNA檢測(cè)和微衛(wèi)星基因型分析 |
| 2.4.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)擴(kuò)增穩(wěn)定性 |
| 2.4.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)無效等位基因頻率 |
| 2.4.4 微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)信息含量 |
| 2.4.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性 |
| 2.4.6 微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因頻率 |
| 2.4.7 哈迪-溫伯格平衡檢測(cè) |
| 2.5 討論 |
| 第三章 禾谷縊管蚜不同地理種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究 |
| 3.1 試驗(yàn)材料 |
| 3.1.1 供試蚜蟲 |
| 3.1.2 主要試劑及儀器 |
| 3.2 試驗(yàn)方法 |
| 3.2.1 禾谷縊管蚜基因組DNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 3.2.2 微衛(wèi)星引物合成 |
| 3.2.3 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系和反應(yīng)條件及產(chǎn)物檢測(cè) |
| 3.2.4 微衛(wèi)星PCR產(chǎn)物檢測(cè)及基因分型 |
| 3.3 數(shù)據(jù)分析 |
| 3.3.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性分析 |
| 3.3.2 種群遺傳多樣性分析 |
| 3.3.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 3.3.4 分子方差分析 |
| 3.3.5 種群遺傳分化分析 |
| 3.3.6 地理距離與遺傳分化的相關(guān)性分析 |
| 3.3.7 種群遷移率計(jì)算 |
| 3.4 結(jié)果與分析 |
| 3.4.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性分析 |
| 3.4.2 種群遺傳多樣性 |
| 3.4.3 多位點(diǎn)基因型多樣性 |
| 3.4.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 3.4.5 分子方差分析 |
| 3.4.6 種群遺傳分化和基因流 |
| 3.4.7 種群間遺傳分化與地理距離的相關(guān)性分析 |
| 3.4.8 不同地理種群間遷移率計(jì)算 |
| 3.5 討論 |
| 3.5.1 禾谷縊管蚜不同地理種群遺傳多樣性 |
| 3.5.2 禾谷縊管蚜不同地理種群遺傳分化 |
| 3.5.3 禾谷縊管蚜不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu) |
| 第四章 農(nóng)藥選擇壓力對(duì)禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)的影響 |
| 4.1 試驗(yàn)材料 |
| 4.1.1 供試蚜蟲 |
| 4.1.2 供試藥劑 |
| 4.1.3 主要試劑及儀器 |
| 4.2 試驗(yàn)方法 |
| 4.2.1 抗性篩選 |
| 4.2.2 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜毒力測(cè)定 |
| 4.2.3 禾谷縊管蚜抗性種群遺傳多樣性研究方法 |
| 4.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析 |
| 4.3.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)多態(tài)性分析 |
| 4.3.2 種群遺傳多樣性分析 |
| 4.3.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 |
| 4.4 結(jié)果與分析 |
| 4.4.1 抗性篩選結(jié)果 |
| 4.4.2 毒死蜱和異丙威對(duì)微衛(wèi)星等位基因頻率的影響 |
| 4.4.3 禾谷縊管蚜抗性種群和敏感種群中微衛(wèi)星多態(tài)信息含量 |
| 4.4.4 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜不同種群遺傳多樣性的影響 |
| 4.4.5 禾谷縊管蚜不同種群之間遺傳相似系數(shù)和遺傳距離 |
| 4.4.6 禾谷縊管蚜不同種群的相似指數(shù)和聚類分析 |
| 4.4.7 毒死蜱和異丙威對(duì)不同種群遺傳結(jié)構(gòu)的影響 |
| 4.5 討論 |
| 第五章 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜種群的亞致死效應(yīng)研究 |
| 5.1 試驗(yàn)材料 |
| 5.1.1 供試蚜蟲 |
| 5.1.2 供試藥劑 |
| 5.2 試驗(yàn)方法 |
| 5.2.1 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜毒力測(cè)定 |
| 5.2.2 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜的亞致死效應(yīng)試驗(yàn) |
| 5.2.3 亞致死效應(yīng)評(píng)價(jià)方法 |
| 5.3 數(shù)據(jù)分析 |
| 5.4 結(jié)果與分析 |
| 5.4.1 毒死蜱和異丙威對(duì)禾谷縊管蚜的亞致死濃度測(cè)定 |
| 5.4.2 毒死蜱和異丙威亞致死濃度對(duì)禾谷縊管蚜F0代成蚜壽命和生殖力的影響 |
| 5.4.3 毒死蜱和異丙威亞致死濃度對(duì)禾谷縊管蚜F1代發(fā)育歷期的影響 |
| 5.4.4 毒死蜱和異丙威亞致死濃度對(duì)禾谷縊管蚜F1代壽命、存活率和繁殖力的影響 |
| 5.4.5 毒死蜱和異丙威亞致死濃度對(duì)禾谷縊管蚜F1代特定生命參數(shù)的影響 |
| 5.5 討論 |
| 第六章 基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的禾谷縊管蚜微衛(wèi)星位點(diǎn)篩選 |
| 6.1 試驗(yàn)材料 |
| 6.1.1 供試蚜蟲 |
| 6.1.2 主要試劑及儀器 |
| 6.2 試驗(yàn)方法 |
| 6.2.1 禾谷縊管蚜RNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 6.2.2 禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)組裝分析 |
| 6.2.3 禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的微衛(wèi)星篩選 |
| 6.2.4 禾谷縊管蚜DNA提取及質(zhì)量檢測(cè) |
| 6.2.5 禾谷縊管蚜微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì)和擴(kuò)增 |
| 6.2.6 微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳多樣性分析 |
| 6.3 結(jié)果與分析 |
| 6.3.1 禾谷縊管蚜總RNA提取 |
| 6.3.2 禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)拼接和注釋結(jié)果 |
| 6.3.3 禾谷縊管蚜轉(zhuǎn)錄組中微衛(wèi)星位點(diǎn)分布特性 |
| 6.3.4 禾谷縊管蚜微衛(wèi)星引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增 |
| 6.3.5 微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳多樣性 |
| 6.4 討論 |
| 第七章 全文總結(jié)與研究展望 |
| 7.1 全文主要結(jié)論 |
| 7.2 本論文的創(chuàng)新點(diǎn) |
| 7.3 下一步工作展望 |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄 |
| 致謝 |
| 作者簡介 |
（10）基于微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的馬鈴薯桃蚜不同種群遺傳分化研究（論文提綱范文）
| 摘要 |
| ABSTRACT |
| 縮略詞表 |
| 第一章 文獻(xiàn)綜述 |
| 引言 |
| 1 蚜蟲學(xué)研究概述 |
| 1.1 蚜蟲的種類及危害 |
| 1.1.1 蚜蟲分類的研究進(jìn)展 |
| 1.1.2 蚜蟲的種類 |
| 1.1.3 多型現(xiàn)象 |
| 1.1.4 生活史 |
| 1.1.5 蚜蟲傳毒機(jī)制 |
| 1.2 中國蚜蟲的地理分布及多樣性 |
| 1.2.1 生物地理學(xué)的概念 |
| 1.2.2 蚜蟲生物地理學(xué)的研究進(jìn)展 |
| 1.2.3 我國蚜蟲區(qū)系類型及地理分布 |
| 1.3 蚜蟲與寄主植物的關(guān)系 |
| 1.3.1 蚜蟲的寄主選擇性差異 |
| 1.3.2 蚜蟲（桃蚜）的寄主?；约俺梢?/td> |
| 1.4 蚜蟲的防治 |
| 1.4.1 作物的抗蚜性 |
| 1.4.2 利用自然條件 |
| 1.4.3 利用栽培防治避蚜 |
| 1.4.4 化學(xué)防治 |
| 1.4.5 基因工程防治蚜蟲 |
| 1.5 馬鈴薯田蚜蟲及桃蚜研究進(jìn)展 |
| 1.5.1 馬鈴薯田間蚜蟲種類 |
| 1.5.2 桃蚜的起源、分布與危害 |
| 1.5.3 桃蚜生活習(xí)性和發(fā)生規(guī)律 |
| 1.5.4 桃蚜的生物型 |
| 2 蚜蟲種群遺傳多樣性及其遷飛的研究進(jìn)展 |
| 2.1 蚜蟲種群遺傳多樣性的影響因素 |
| 2.1.1 生活史周期的演化 |
| 2.1.2 寄主選擇性差異 |
| 2.1.3 地理氣候因素 |
| 2.2 蚜蟲種群遺傳多樣性的分子基礎(chǔ) |
| 2.2.1 蚜蟲種群核 DNA 遺傳多樣性 |
| 2.2.2 線粒體 DNA 遺傳多樣性 |
| 2.3 蚜蟲的遷飛行為和影響因子 |
| 2.3.1 蚜蟲的飛行能力 |
| 2.3.2 蚜蟲的遷飛行為 |
| 2.3.3 影響蚜蟲遷飛的生態(tài)因子 |
| 2.4 蚜蟲遷飛的研究方法 |
| 3 微衛(wèi)星標(biāo)記及其在蚜蟲種群生物學(xué)中的應(yīng)用 |
| 3.1 蚜蟲分子生物學(xué)研究進(jìn)展 |
| 3.1.1 蚜蟲基因組組成 |
| 3.1.2 核 DNA 技術(shù) |
| 3.1.3 線粒體核 DNA |
| 3.1.4 rDNA 和其間隔區(qū) |
| 3.2 常見的分子標(biāo)記技術(shù) |
| 3.3 微衛(wèi)星 DNA 及其遺傳突變機(jī)制 |
| 3.3.1 微衛(wèi)星簡介 |
| 3.3.2 微衛(wèi)星 DNA 的突變機(jī)制 |
| 3.3.3 微衛(wèi)星分子標(biāo)記的的基本原理和方法 |
| 3.3.4 微衛(wèi)星分子標(biāo)記在蚜蟲種群生物學(xué)中的應(yīng)用 |
| 4 本項(xiàng)研究的可行性分析 |
| 4.1 本項(xiàng)研究的目的和意義 |
| 4.2 研究內(nèi)容和技術(shù)路線 |
| 第二章 馬鈴薯田蚜蟲優(yōu)勢(shì)種類及桃蚜基因組 DNA 提取 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 樣品采集 |
| 1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及主要試劑 |
| 1.3 單頭蚜蟲基因組 DNA 提取及純化 |
| 1.4 DNA 濃度及純度檢測(cè) |
| 1.5 隨機(jī)引物擴(kuò)增 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 馬鈴薯田蚜蟲種類及優(yōu)勢(shì)種 |
| 2.2 優(yōu)化的醋酸鉀（KAC）法提取桃蚜基因組 DNA |
| 2.3 隨機(jī)引物擴(kuò)增結(jié)果 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第三章 桃蚜微衛(wèi)星引物篩選及SSR-PCR反應(yīng)體系優(yōu)化 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 供試材料 |
| 1.2 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑 |
| 1.3 SSR 引物設(shè)計(jì)與獲取 |
| 1.4 桃蚜 SSR 標(biāo)記體系的建立 |
| 1.4.1 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) |
| 1.4.2 SSR-PCR 反應(yīng)體系 |
| 1.4.3 操作步驟 |
| 1.4.4 PCR 擴(kuò)增程序 |
| 1.4.5 電泳檢測(cè) |
| 1.5 桃蚜 SSR 反應(yīng)體系的優(yōu)化 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 桃蚜 SSR 引物篩選 |
| 2.2 桃蚜 SSR 反應(yīng)體系的優(yōu)化 |
| 2.2.1 M92+適宜濃度 |
| 2.2.2 引物適宜濃度 |
| 2.2.3 dNTP 適宜濃度 |
| 2.2.4 Taq 聚合酶適宜濃度 |
| 2.2.5 模板 DNA 適宜濃度 |
| 2.3 桃蚜 SSR-PCR 擴(kuò)增體系的應(yīng)用 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第四章 桃蚜不同寄主種群遺傳分化的微衛(wèi)星擴(kuò)增多態(tài)性 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 供試桃蚜 |
| 1.2 試劑與儀器 |
| 1.3 基因組 DNA 提取 |
| 1.4 SSR-PCR 反應(yīng)體系、反應(yīng)條件及產(chǎn)物檢測(cè) |
| 1.5 數(shù)據(jù)處理與分析統(tǒng)計(jì) |
| 1.5.1 等位基因頻率 |
| 1.5.2 基因雜合度 |
| 1.5.3 有效等位基因數(shù) |
| 1.5.4 種群間的遺傳距離 |
| 1.5.5 聚類分析 |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 微衛(wèi)星引物擴(kuò)增結(jié)果 |
| 2.2 桃蚜寄主種群的遺傳多樣性 |
| 2.3 不同寄主植物桃蚜種群的遺傳相似度和遺傳距離 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第五章 不同地理區(qū)域馬鈴薯田桃蚜種群的遺傳相似性研究 |
| 1 材料與方法 |
| 1.1 實(shí)驗(yàn)材料 |
| 1.2 主要儀器和試劑 |
| 1.3 基因組 DNA 提取 |
| 1.4 引物篩選 |
| 1.5 PCR 擴(kuò)增反應(yīng)和產(chǎn)物檢測(cè) |
| 1.6 地理距離與海拔差距的獲取與計(jì)算 |
| 1.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) |
| 2 結(jié)果與分析 |
| 2.1 微衛(wèi)星引物的 PCR 擴(kuò)增結(jié)果 |
| 2.2 遺傳多樣性分析 |
| 2.3 種群遺傳分化及與地理距離、海拔的相關(guān)性 |
| 2.4 聚類分析 |
| 3 小結(jié)與討論 |
| 第六章 結(jié)論與討論 |
| 1 主要結(jié)果與結(jié)論 |
| 1.1 桃蚜是甘肅省馬鈴薯蚜蟲的優(yōu)勢(shì)種 |
| 1.2 優(yōu)化的醋酸鉀法提取單頭蚜蟲基因組 DNA 的有效性 |
| 1.3 桃蚜微衛(wèi)星引物的獲取和篩選 |
| 1.4 建立了桃蚜 SSR-PCR 反應(yīng)體系 |
| 1.5 桃蚜不同寄主種群的適應(yīng)性分化 |
| 1.6 甘肅省馬鈴薯桃蚜不同地理種群的遺傳相似性和分化 |
| 2 討論 |
| 2.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)在桃蚜遷飛和種群多樣性研究中的有效性 |
| 2.2 單頭蚜蟲基因組 DNA 提取技術(shù)的優(yōu)化 |
| 2.3 桃蚜的寄主專化性 |
| 2.4 甘肅省馬鈴薯桃蚜的遺傳多樣性和遷飛路線推測(cè) |
| 3 創(chuàng)新點(diǎn) |
| 參考文獻(xiàn) |
| 附錄Ⅰ |
| 附錄Ⅱ |
| 附錄Ⅲ |
| 附錄Ⅳ |
| 致謝 |
| 個(gè)人簡介 |
| 博士期間發(fā)表論文和研究成果 |
| 導(dǎo)師簡介 |
四、棉蚜地理種群重復(fù)序列引物擴(kuò)增DNA多態(tài)性分析(英文)（論文參考文獻(xiàn)）
- [1]遼寧省二化螟種群遺傳變異及腸道細(xì)菌多樣性研究[D]. 朱可心. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué), 2021(05)
- [2]遼寧省稻曲病菌生物學(xué)特性及遺傳多樣性研究[D]. 李昕洋. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué), 2020(08)
- [3]基于SSR標(biāo)記及mt DNA序列的塔里木裂腹魚群體遺傳多樣性分析[D]. 任永麗. 塔里木大學(xué), 2020
- [4]老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及落粒相關(guān)基因QTL定位[D]. 張宗瑜. 蘭州大學(xué), 2020
- [5]五種斑潛蠅形態(tài)特征比較研究及重要種的遺傳結(jié)構(gòu)分析[D]. 陳景蕓. 揚(yáng)州大學(xué), 2019(06)
- [6]我國棗食芽象甲種群遺傳結(jié)構(gòu)、適生性及種群歷史動(dòng)態(tài)研究[D]. 洪波. 西北農(nóng)林科技大學(xué), 2019(08)
- [7]斜紋夜蛾誘集種群動(dòng)態(tài)及不同地理種群遺傳結(jié)構(gòu)分析的研究[D]. 武懷恒. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué), 2018(01)
- [8]棉鈴蟲PBP1功能鑒定及不同地理種群性信息素通訊系統(tǒng)的比較研究[D]. 葉占峰. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué), 2017(08)
- [9]我國禾谷縊管蚜種群遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)及農(nóng)藥對(duì)其脅迫效應(yīng)研究[D]. 段辛樂. 西北農(nóng)林科技大學(xué), 2015(06)
- [10]基于微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的馬鈴薯桃蚜不同種群遺傳分化研究[D]. 劉永剛. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué), 2010(01)
標(biāo)簽：等位基因論文; 微衛(wèi)星標(biāo)記論文; 遺傳多樣性論文; 基因合成論文; 引物設(shè)計(jì)論文;