一、比例法檢測1875株結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性(論文文獻綜述)
陳越[1](2021)在《云南省部分地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的病原學(xué)及其生物特性研究》文中研究指明目的:收集到疑似HIV/NTM非結(jié)核分枝桿菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)雙重感染樣本共64株,分別來自云南省保山市、德宏傣族景頗族自治州、大理白族自治州。通過對臨床雙感菌株進行一系列實驗,包括生理生化和基因測序鑒定、MIRU-VNTR基因分型和多態(tài)性分析、藥物敏感實驗等,以了解云南省部分地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌菌種分布、優(yōu)勢菌種鑒定、耐藥情況,為溯源致病菌的研究和臨床預(yù)防與診治提供參考及幫助。方法:1.將樣本接種于對硝基苯甲酸(PNB)和噻吩2-羧酸肼(TCH)兩種鑒別培養(yǎng)基后觀察細菌生長情況,對臨床分離株做初步菌種鑒定。同時,進行抗酸染色,觀察染色陽性菌株。選取16S r RNA、hsp65、rpo B三種引物對初篩后的樣本進行聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增后測序,結(jié)果在NCBI的BLAST中進行序列比對,從而進行菌種鑒定。2.對優(yōu)勢菌群鳥分枝桿菌使用MIRU-VNTR方法做基因分型和多態(tài)性研究。選取15個位點,使用PCR和瓊脂糖凝膠電泳得到條帶。運用Quantity One軟件計算目的條帶大小,通過公式計算重復(fù)次數(shù)并保存數(shù)據(jù)。將以上數(shù)據(jù)及菌株分離地導(dǎo)入Bionumerics6.6軟件中,使用UPGM功能制作聚類分析圖和MAT功能生成最小樹狀圖。最后,計算每個位點的分辨率,可獲得分辨率最高的位點,淘汰分辨率最低的位點。3.對分枝桿菌進行鏈霉素(SM)、異煙肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、卡那霉素(K)、利福布?。≧BU)的藥物敏感性分析。使用比例法逐步稀釋菌液后,選取合適的高稀釋度和低稀釋度菌懸液分別接種于以上5種藥敏培養(yǎng)基和對照培養(yǎng)基中。置于36℃±1℃的溫箱培養(yǎng)4周后讀取結(jié)果。結(jié)果:1.樣本經(jīng)鑒定后得到鳥分枝桿菌16株、胞內(nèi)分枝桿菌11株、戈登氏菌7株、馬賽分枝桿菌4株、三重分枝桿菌4株、鼻疽諾卡菌3株、結(jié)核分枝桿菌2株、龜分枝桿菌1株、膿腫分枝桿菌1株、M.paraintracellulare 1株。鳥分枝桿菌數(shù)量最多,為優(yōu)勢菌群。2.本次實驗鑒定出的鳥分枝桿菌合并本課題組2019年鑒定保存的菌株共23株,做聚類分析圖可知,23株鳥分枝桿菌分為3個基因群,A群占比60.9%(14/23),B群占比26.1%(6/23)、C群占比13%(3/23)。保山與德宏地區(qū)分為A群基因,大理州大理市、洱源縣、劍川縣、永平縣分為B群基因,大理州賓川縣3株菌分為C群基因。最小樹狀圖結(jié)果,云南部分地區(qū)鳥分枝桿菌與日本菌株之間存在顯著差異,云南部分地區(qū)菌株與葡萄牙菌株也存在差異但不如日本地區(qū)顯著。15個位點中,分辨率最高的是MATR-3位點0.714,分辨率最低的為MATR-6位點0.143。3.藥敏結(jié)果顯示,16株鳥分枝桿菌除對利福布丁不耐藥,對異煙肼、乙胺丁醇、卡那霉素、鏈霉素耐藥。結(jié)論:1.云南省保市、德宏傣族景頗族自治州、大理白族自治州與HIV相關(guān)的非結(jié)核分枝桿菌主要分離株為鳥分枝桿菌,可作為優(yōu)勢菌群。2.運用MIRU-VNTR法計算鳥分枝桿菌的基因多態(tài)性,MATR-3位點分辨率最高,除MATR-6位點分辨率低外,其他14個位點可以作為鑒定該地區(qū)鳥分枝桿菌的位點。云南省部分地區(qū)的鳥分枝桿菌基因分型與葡萄牙和日本兩國存在較大差異。3.16株鳥分枝桿菌對利福布丁敏感率較高,但對于異煙肼、乙胺丁醇、卡那霉素、鏈霉素耐藥。藥敏結(jié)果顯示,治療雙感鳥分枝桿菌疾病,利福布丁更具有優(yōu)勢。
劉金娜[2](2020)在《微量液體培養(yǎng)基最低抑菌濃度法與羅氏比例法在結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗中的價值比較》文中指出目的比較微量液體培養(yǎng)基最低抑菌濃度(MIC)法與羅氏比例法在結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗中的臨床價值。方法以100株結(jié)核分枝桿菌菌株(由遼寧省結(jié)核實驗室提供)為研究樣本,分別采用羅氏比例法與微量液體培養(yǎng)基MIC法檢測結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性。結(jié)果微量液體培養(yǎng)基MIC法與羅氏比例法檢測結(jié)核分枝桿菌對乙胺丁醇、二卡那霉素、利福平、異煙肼、氧氟沙星、卷曲霉素藥物的敏感性比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P> 0.05)。結(jié)論微量液體培養(yǎng)基MIC法應(yīng)用于結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗中與羅氏比例法有著良好的一致性,且檢測速度快,經(jīng)濟適用性好,能夠為臨床指導(dǎo)結(jié)核病用藥提供幫助。
周蕾[3](2020)在《結(jié)核分枝桿菌抗性藥物體外評價菌株體系的構(gòu)建及新藥篩選》文中認(rèn)為結(jié)核病是全球第十大致死病因,我國是結(jié)核病的高負(fù)擔(dān)國家。隨著耐多藥結(jié)核病和廣泛耐藥結(jié)核病的增多,結(jié)核病的流行勢態(tài)更為嚴(yán)峻,對新型抗結(jié)核藥物的需求也更加緊迫。系統(tǒng)的包含不同耐藥水平和耐藥機制的菌株體系可以用于抗結(jié)核藥物的篩選和藥效評價,因此是藥物研發(fā)中必不可少的。此外,非結(jié)核分枝桿菌(Non-tuberculous mycobacteria,NTM)引起的疾病在結(jié)核病中的占比也在不斷增高,使結(jié)核病的防控更加復(fù)雜,對人類健康構(gòu)成了雙重威脅。與結(jié)核病系統(tǒng)的監(jiān)測報告體系不同,NTM病例目前并不強制性報告,NTM疾病缺乏系統(tǒng)的常規(guī)性監(jiān)測數(shù)據(jù)。同時因為NTM分離鑒定的方法繁瑣,技術(shù)條件要求高,對NTM的研究比較局限,因此NTM流行趨勢和耐藥性等方面的綜合數(shù)據(jù)歷來是主要依賴于Meta分析。結(jié)合現(xiàn)實需求,本研究設(shè)立了兩項內(nèi)容,1)本課題旨在建立一個較為系統(tǒng),包含不同耐藥表型的耐藥位點數(shù)據(jù)庫及菌株庫。根據(jù)任務(wù)分工,本研究承擔(dān)了其中利福平和乙胺丁醇兩種一線藥物的菌庫構(gòu)建工作,并利用已建成的菌株體系,進行了71個候選抗結(jié)核藥物的藥效評價。2)對中國大陸地區(qū)20年間NTM的流行趨勢進行系統(tǒng)回顧和Meta分析。第一項研究中,首先進行一線抗結(jié)核藥物利福平和乙胺丁醇耐藥機制的文獻檢索,匯總出經(jīng)過多項藥敏試驗驗證的確證性耐藥相關(guān)突變位點。其次從科室菌株庫中根據(jù)藥敏試驗檢測結(jié)果挑選不同耐藥水平的菌株進行傳代培養(yǎng)。經(jīng)過耐藥位點檢測與復(fù)核后,進行單菌落純化培養(yǎng),藥敏試驗進一步驗證復(fù)核后擴增保菌,建立一套包含不同耐藥水平和耐藥位點的菌株組合。文獻匯總顯示,利福平的確證性突變位點為rpo B基因的511位點(CTG511CGG/CCG),513(CAA513AAA/CCA/GAA/CTA),516(GAC516TTC/TAC/GTC/GGC/GCC),526(CA526CCCG/TGC/AAC/CTC/CGC/GAC/TAC/TTT/TGG/TTG)以及531(TCG531TTG/TGG/TTT)等位點。乙胺丁醇的確證性突變位點主要分布在emb B、emb A、emb C、ubi A 4個基因中,其中最主要的是emb B基因的306位點(ATG306CTG/ATA/ATC/GTG)、319(TAT319TCT)、334(TAC334CAC)、354(GAC354GCC/AAC)、361(TGC361TAC)、406(GGC406GAC/AGC/GCC)和497(CAG497CAT/AAG)。從菌庫選取了428株不同耐藥水平的菌株,經(jīng)耐藥基因的擴增、比對,獲得了利福平rpo B基因的511、513、516、526、531、533和572位點的共77個菌株;乙胺丁醇emb B基因306和497,emb A基因-16、-12和-11位點,emb C基因270位點以及ubi A基因174位點共38個菌株。應(yīng)用已建立的菌株體系,對71個具有潛在抗結(jié)核活性的候選化合物進行藥敏試驗。結(jié)果顯示,化合物L(fēng)11、L5、L6、L2、L8、L9、L1、Z3、Z10、Z16、Z38和Z46對結(jié)核分枝桿菌和快生型非結(jié)核分枝桿菌具有較好的抑制效果,尤其是L11。而從獨山瓜馥木中分離出的組分1和2對于單耐藥菌株(耐異煙肼和耐利福平)和耐多藥菌株具有較好的抑制作用,這提示在目前耐藥菌株、耐多藥和廣泛耐藥菌株不斷增加的流行背景下,該藥值得進一步研發(fā)。第二項研究中從四個英文在線資源(BIOSIS,Embase,Pub Med和Web of Science)和三個中文醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫(CNKI,Wanfang和Vip)檢索了從2000年1月1日至2019年5月31日發(fā)表的中國大陸地區(qū)的NTM臨床樣本的研究報告。系統(tǒng)評價總共包括339篇文獻,藥物敏感性分析包括129篇,分離率的meta分析包括了95篇。結(jié)果顯示在中國大陸地區(qū),NTM的分離、鑒定和藥敏試驗最常用的方法是將Lowenstein-Jensen(L-J)培養(yǎng)基與P-nitrobenzene acid(PNB)和thiophene-2-carboxylic acid hydrazine(TCH)培養(yǎng)基結(jié)合使用的傳統(tǒng)培養(yǎng)方法。在結(jié)核疑似病例中,NTM的粗分離率為4.66-5.78%,在分枝桿菌中占11.57%。膿腫和鳥分枝桿菌是最常見的臨床NTM菌種。大陸地區(qū),NTM的患病率在2015年之后呈下降趨勢,且胞內(nèi)分枝桿菌替代膿腫分枝桿菌成為順位第一的優(yōu)勢菌種。NTM的分布具有地域差異,沿海地區(qū)高于內(nèi)陸。環(huán)境和經(jīng)濟差異對NTM菌種的分布具有影響。藥敏結(jié)果顯示,NTM僅對乙胺丁醇、利奈唑胺、氯法齊明、阿米卡星、妥布霉素和克拉霉素普遍較為敏感。綜上所述,本研究兩項內(nèi)容所建立的耐藥位點數(shù)據(jù)庫、系統(tǒng)的菌株體系將為抗結(jié)核藥物的研發(fā)提供技術(shù)平臺,而NTM的綜合分析數(shù)據(jù)可以作為臨床治療的用藥參考,并指導(dǎo)結(jié)核防控策略的調(diào)整。
馬翠蝶[4](2020)在《抗結(jié)核菌藥物耐藥數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及其體外活性評價》文中研究表明結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的傳染病,和艾滋病、瘧疾并列為危害人類健康的三大傳染病。結(jié)核病流行趨勢日益嚴(yán)峻的原因之一是耐藥結(jié)核病的誕生。耐藥結(jié)核病的早期診斷和治療是控制耐藥現(xiàn)象的關(guān)鍵途徑。系統(tǒng)了解抗生素的耐藥產(chǎn)生機制,了解各類型突變在耐藥性產(chǎn)生中的比重,對改進分子診斷,指導(dǎo)醫(yī)生改善治療方案具有重要意義。同時,系統(tǒng)的包含不同耐藥水平和耐藥機制的菌株組合在藥物篩選及藥效評價各階段都必不可少。本研究主要歸納了一線抗結(jié)核藥物中的異煙肼和鏈霉素的耐藥作用基因及靶點,整理了耐藥位點的分布及頻率,建立了一個較完整的抗結(jié)核藥物的耐藥位點數(shù)據(jù)庫,一套系統(tǒng)的包含不同耐藥水平和耐藥機制的菌株組合已初步形成,并對106種化合物進行了抗結(jié)核菌活性評價。環(huán)絲氨酸是一種有效的C組抗結(jié)核藥。其體外藥敏試驗的可靠性和可重復(fù)性無法保證,對臨床療效的預(yù)測價值不佳。但在實際應(yīng)用中,環(huán)絲氨酸的體外藥敏試驗可以用于粗略估計分枝桿菌的耐藥性,因此有必要闡明環(huán)絲氨酸體外藥敏試驗中存在的問題及解決的辦法。本研究使用Alamar Blue法測定了在37℃下環(huán)絲氨酸溶液系列孵育1至29天后的有效性,并通過UPLC-MS分析培養(yǎng)基中的環(huán)絲氨酸的降解程度。結(jié)果表明,環(huán)絲氨酸在培養(yǎng)基中不穩(wěn)定,持續(xù)性降解,其降解量足以改變分枝桿菌的最低抑菌濃度(MIC)值。不等長的測試時間和環(huán)絲氨酸的降解是造成不同藥敏試驗方法之間缺乏一致性以及體外測試可靠性低的原因。根據(jù)孵育時間依賴的環(huán)絲氨酸降解量進行校正,可以獲得更準(zhǔn)確的MIC值,從而提高體外實驗與臨床使用之間的一致性。這將提供更有效和可靠的實驗數(shù)據(jù),以指導(dǎo)臨床醫(yī)生進行抗結(jié)核治療。
翟凱新[5](2020)在《大理地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的菌種分布及優(yōu)勢菌群的生物學(xué)性狀研究》文中研究指明目的:對大理地區(qū)HIV相關(guān)的非結(jié)核分枝桿菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)臨床分離株進行菌種鑒定;對大理地區(qū)HIV相關(guān)的鳥分枝桿菌(Mycobacterium avium,MAV)用MLVA(Multi locus variable-number tandemrepeat analysis)法進行基因分型,探討優(yōu)勢菌群基因型特征以及流行趨勢;通過比例法檢測MAV的藥物敏感性,探討HIV相關(guān)的鳥分枝桿菌耐藥現(xiàn)狀;探究MAV中的毒力蛋白PPE25-MAV對巨噬細胞凋亡的影響。方法:1、NTM的菌種鑒定:用對硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)鑒別培養(yǎng)基對分枝桿菌進行初步鑒定。設(shè)計16Sr RNA、hsp65和rpo B基因的引物,以初步鑒定的分枝桿菌DNA為模板進行PCR擴增,將擴增結(jié)果測序后提交至NCBI中,與Gen Bank中的標(biāo)準(zhǔn)序列進行BLAST比對,然后進行同源性分析。2、MAV的基因分型:鑒定后的大理地區(qū)HIV相關(guān)MAV菌株,選取15個數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)特異位點,運用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)初步建立檢測大理地區(qū)HIV相關(guān)MAV菌株DNA指紋圖譜方法。運用Quantity One和Bio Numerics(6.6)軟件對結(jié)果進行數(shù)字化處理,采用UPGMA法和MST法進行聚類分析。3、對MAV的藥物敏感性:采用比例法對所有MAV菌株進行包括左氧氟沙星(LFX)、阿米卡星(AK)、卷曲霉素(CPM)、丙硫異煙胺(TH1321)、利福布丁(RBU)、莫西沙星(MFX)在內(nèi)的這6種藥物進行藥敏試驗。4、PPE25-MAV誘導(dǎo)巨噬細胞凋亡:克隆表達和純化PPE25-MAV蛋白,分別用濃度為0.5μg/m L、1μg/m L、2μg/m L、5μg/m L的蛋白處理巨噬細胞,各處理2h和10h后,使用流式細胞技術(shù)檢測巨噬細胞凋亡率。結(jié)果:1、NTM的菌種鑒定:大理地區(qū)HIV相關(guān)的12株NTM中,慢生長分枝桿菌11株,其中9株鳥分枝桿菌,1株帕拉分枝桿菌,1株戈登分枝桿菌;快生長分枝桿菌1株為膿腫分枝桿菌。主要以鳥分枝桿菌為優(yōu)勢菌群。2、MAV的基因分型:VNTR的15個位點的HGDI值存在差異,最高值為0.75,最低值為0。在15個位點中MATR-14最高為0.75,而MATR-9、MATR-1、MATR-2等13個位點HGDI值均大于等于0.5。根據(jù)UPGMA法聚類分析樹狀圖顯示,大理地區(qū)雙感的9株鳥分枝桿菌分為3個基因群,8個基因型。其中C群的2個臨床分離株形成1個簇,A、B群沒有成簇的菌株。用MST法聚類分析的結(jié)果大理地區(qū)的鳥分枝桿菌分為三個簇。3、對MAV的藥物敏感性:9株HIV相關(guān)的MAV全部對阿米卡星(AK)耐藥,有7株對左氧氟沙星(LFX)耐藥,有6株對莫西沙星(MFX)耐藥,有5株對卷曲霉素(CPM)耐藥,有1株對利福布丁(RBU)耐藥,另外9株MAV均對丙硫異煙胺(TH1321)敏感。4、PPE25-MAV誘導(dǎo)巨噬細胞凋亡:在作用2h后,與空白對照組相比,細胞的晚期凋亡率和總凋亡率在0.5μg/m L與1μg/m L時均低于空白組(P<0.05);在作用10h后,與空白對照組相比,細胞的早期凋亡率僅5μg/m L時略有升高(P<0.05),在0.5μg/m L、1μg/m L和2μg/m L之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),細胞晚期凋亡率和總凋亡率在2μg/m L和5μg/m L時明顯降低(P<0.05)。結(jié)論:1、大理地區(qū)HIV相關(guān)的12株NTM中主要優(yōu)勢菌群為鳥分枝桿菌,rpo B和hsp65基因可以將膿腫分枝桿菌的亞種鑒別出來。2、對大理地區(qū)MAV菌株MATR-VNTR分析,不同菌株的同一位點的基因片段差異明顯,基因分型多態(tài)性較高。MATR-14和MATR-9等13個位點分辨力高,可作為大理地區(qū)HIV相關(guān)MAV的基因分型首選位點。3、MAV對丙硫異煙胺(TH1321)敏感,同時存在對二線抗結(jié)核藥物耐藥的情況以及多藥耐藥的特點。4、PPE25-MAV蛋白對巨噬細胞凋亡有抑制作用。而且PPE25-MAV蛋白主要作用于巨噬細胞的晚期凋亡階段。
竇敏[6](2020)在《DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥基因的價值研究》文中進行了進一步梳理研究目的:采用DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥基因,為臨床診治提供實驗依據(jù)。研究方法:收集整理青島市胸科醫(yī)院2018年7月1日-2019年12月31日結(jié)核科收住的痰涂片陽性的肺結(jié)核患者,同時行傳統(tǒng)痰結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)及藥敏試驗、DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌的耐藥性,且兩項均有陽性結(jié)果回復(fù)的患者。所有患者入院后均留取晨痰2份分別送檢進行傳統(tǒng)痰結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)及藥敏、DNA微陣列芯片法檢測。傳統(tǒng)培養(yǎng)及藥敏采用改良羅氏培養(yǎng)法及菌種初步鑒定,并行比例法抗結(jié)核藥物敏感性試驗。以傳統(tǒng)培養(yǎng)及藥敏試驗結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn)。DNA微陣列芯片法與傳統(tǒng)結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)及藥敏試驗對利福平耐藥性監(jiān)測結(jié)果進行比較;對耐多藥檢測結(jié)果進行比較;總結(jié)基因位點突變情況。研究結(jié)果:1.對入選的416例患者的樣本結(jié)果進行比較,以傳統(tǒng)培養(yǎng)及藥敏試驗結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),DNA微陣列芯片法檢測利福平耐藥的敏感度為84.3 1%,特異度為99.18%,一致率為97.36%,陽性預(yù)測值為93.48%,陰性預(yù)測值為97.84%。X2=1.45,P>0.05。對兩組的利福平耐藥性監(jiān)測情況進行比較,不具有明顯的差異。2.我們在DNA微陣列芯片法中共檢測出基因突變46例,其中真耐藥43例,假耐藥3例。真耐藥中有36例發(fā)生rpoB 531位點突變,突變率78.26%;4例發(fā)生rpoB 526位點突變,1例發(fā)生rpoB 516位點突變,1例發(fā)生rpoB 511和rpoB 516同時突變,1例發(fā)生rpoB 511和rpoB 526同時突變。假耐藥的3例中,1例發(fā)生rpoB516位點突變,2例發(fā)生rpoB 511位點突變。3.對入選的416例患者的樣本結(jié)果進行比較,以傳統(tǒng)培養(yǎng)及藥敏試驗結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),DNA微陣列芯片法檢測耐多藥結(jié)果的敏感度為89.29%,特異度為80.00%,一致率為81.67%,陽性預(yù)測值為80.65%,陰性預(yù)測值為88.89%。研究結(jié)論:通過對DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥基因的效果評價,證實此檢測方法具有較高的敏感度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值,與傳統(tǒng)的結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)藥敏試驗一致率高。而且該方法檢測時間短,結(jié)果可靠,價格相對經(jīng)濟,值得被應(yīng)用于臨床結(jié)核病耐藥的診斷及指導(dǎo)耐藥方案的調(diào)整。
陳蓉[7](2020)在《耐多藥結(jié)核分枝桿菌藥物敏感譜及其與基因型相關(guān)性研究》文中指出目的:了解耐多藥結(jié)核分枝桿菌的藥敏譜及基因型流行特征,分析基因型與耐藥性間的相關(guān)性,為臨床上選擇有效治療方案、制定科學(xué)的耐藥結(jié)核病防控策略提供科學(xué)依據(jù)。方法:從菌株庫中篩選既往收集的結(jié)核分枝桿菌臨床分離株327株,采用微孔板藥敏法及BACTECTMM MGIT 960TM液體培養(yǎng)法對其17種臨床常用的一、二線抗結(jié)核藥物的敏感特征進行檢測,測定其藥物敏感性;同時采用單核苷酸多態(tài)性分型技術(shù)篩選北京基因型及其亞型,分析耐多藥結(jié)核分枝桿菌不同基因型菌株與耐藥表型的相關(guān)性及藥物交叉耐藥情況。計數(shù)資料組間比較采用?2檢驗,P(27)0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果:在本研究的327株MTB中,MTB對INH、RIF、SM、KAN以及AMI耐藥的菌株以高濃度耐藥為主,而LZD、BDQ、CAP和EMB耐藥菌株MIC值主要分布于臨界值附近。本研究中193株MDR-TB菌株對除INH、RIF外15種抗MTB藥物呈現(xiàn)高度耐藥,耐藥率從高到低依次為RFB(83.42%)、SM(69.95%)、PZA(47.67%)、EMB(37.82%)、OFL(30.05%)、MOX(27.98%)、PAS(15.03%)、KAN(15.03%)、ETO(14.51%)、AMI(11.92%)、LZD(10.88%)、CAP(9.84%)、CYC(8.29%)、CFZ(4.15%)、BDQ(3.11%)。耐多藥結(jié)核分枝桿菌中對RFB、SM、PZA、EMB、OFL、MOX、PAS、KAN、ETO、AMI和CYC的耐藥率明顯高于非耐多藥結(jié)核分枝桿菌,差異均存在統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。193株耐多藥結(jié)核分枝桿菌中,pre-XDR菌株57株,占29.53%(57/193),XDR-TB菌株共檢出22株,占MDR-TB的11.40%。耐藥關(guān)聯(lián)性分析顯示,利福平與利福布汀存交叉耐藥率為83.42%,相關(guān)系數(shù)0.80(>0.7),高度相關(guān);且不同程度利福平耐藥組間利福布汀耐藥率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(?2=45.212,P=0.000);OFL與MOX、KAN與AMI、CFZ與BDQ耐藥具有相關(guān)性,交叉耐藥率分別為93.10%、75.86%和40.00%,相關(guān)系數(shù)分別為0.95、0.83和0.56,關(guān)聯(lián)程度較高。193株MDR-TB菌株中,北京基因型149株(77.20%),非北京基因型44株(22.80%);北京基因型菌株中,古典北京基因型66株(44.30%),現(xiàn)代北京基因型83株(55.70%)。北京基因型菌株中SM耐藥率顯著高于非北京基因型(?2=16.266,P<0.05);非北京基因型OFL和MOX耐藥率顯著高于北京基因型(?2=4.674,P<0.05和?2=4.728,P<0.05);現(xiàn)代北京基因型菌株中CYC、EMB、ETO、KAN、OFL、MOX和AMI耐藥率顯著高于古典北京基因型(?2CYC=4.825,PCYC<0.05;?2EMB=4.279,PEMB<0.05;?2ETO=6.315,PETO<0.05;?2KAN=4.866,PKAN<0.05;?2OFL=7.45,POFL<0.05;?2MOX=7.162,PMOX<0.05和?2AMI=8.23,PAMI<0.05)。結(jié)論:本研究通過微孔板藥敏法和BACTEC MGIT 960液體培養(yǎng)法檢測MDR-TB菌株對17種主要的一線及二線抗結(jié)核藥物的耐藥情況,為臨床篩選潛在的治療藥物,制定MDR-TB治療方案,開展耐藥結(jié)核病精準(zhǔn)防控策略,防止耐藥性結(jié)核病的傳播與流行提供重要的參考依據(jù)。
劉佳[8](2020)在《耐藥結(jié)核分枝桿菌的篩查及其血清結(jié)核抗體價值研究》文中提出目的:探討耐藥結(jié)核分枝桿菌的篩查及其血清結(jié)核抗體檢測結(jié)果的臨床價值。方法:選取294例結(jié)核患者作為研究對象,采用INH,RFP,Sm,EMB,OFX,CPM,Km以及Pto八種抗結(jié)核藥物的檢測結(jié)果篩查出結(jié)核耐藥組143人和結(jié)核敏感組151人,選取同期住院的非結(jié)核患者150人作為對照組。分別對結(jié)核耐藥組,結(jié)核敏感組和對照組使用結(jié)核血清蛋白芯片法檢測38KDa抗體、16KDa抗體及LAM抗體,所得結(jié)果采用SPSS19.0進行統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果:抗結(jié)核藥物耐藥率最高的為INH(73.42%),其余依次為RFP(69.96%)、Sm(41.95%)、OFX(37.76%)、EMB(20.27%)、Km(5.59%)和CPM(2.79%),未發(fā)現(xiàn)Pto耐藥的菌株。結(jié)核耐藥組包括耐多藥結(jié)核、單耐藥結(jié)核、多耐藥結(jié)核、耐藥OFX結(jié)核和廣泛耐藥結(jié)核等5種耐藥類型,耐多藥結(jié)核類型陽性發(fā)生率最高占51.7%、其次為單耐藥結(jié)核27.8%、多耐藥結(jié)核病11.9%和耐藥OFX結(jié)核9.1%,廣泛耐藥結(jié)核類型發(fā)生率最低占3.5%,未發(fā)現(xiàn)單耐CPM、單耐Km和單耐Pto的菌株。多耐藥結(jié)核類型的耐藥模式最多有5種,耐多藥結(jié)核類型有4種、單耐藥結(jié)核類型和廣泛耐藥結(jié)核類型均為3種,耐藥OFX結(jié)核有1種。血清結(jié)核抗體檢測陽性模式共有6種,以“38k Da(陽性)+16k Da(陰性)+LAM(陽性)”模式最為常見。結(jié)核組血清結(jié)核抗體陽性率與對照組相比,差異有顯著統(tǒng)計學(xué)意義(c2=261.33,P<0.01);結(jié)核耐藥組血清結(jié)核抗體陽性率85.31%與結(jié)核敏感組77.48%比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(c2=2.10,P>0.05)。耐多藥結(jié)核類型血清結(jié)核抗體陽性率最高占91.89%,其余依次為多耐藥結(jié)核類型占88.23%、單耐藥結(jié)核類型占82.35%、廣泛耐藥結(jié)核類型占80.0%以及耐藥OFX結(jié)核類型占53.84%。多種藥物耐藥結(jié)核其血清結(jié)核抗體陽性率為90.62%(87/96)明顯高于結(jié)核敏感組77.48%,兩者相比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(c2=6.59,P<0.05)。結(jié)論:一線抗結(jié)核藥物INH耐藥率最高;二線抗結(jié)核藥物OFX耐藥率最高;耐藥結(jié)核類型有16種,以“INH+RFP”類型最常見,說明耐藥結(jié)核類型繁多復(fù)雜,給臨床治療提出更高的要求,特別是耐多藥結(jié)核類型更引起臨床的高度重視;未發(fā)現(xiàn)單耐CPM、單耐Km和單耐Pto的菌株,說明CPM、Km和Pto對結(jié)核分枝桿菌具有良好的抗菌性;結(jié)核患者血清結(jié)核抗體檢測陽性結(jié)果模式以“38k Da(陽性)+16k Da(陰性)+LAM(陽性)”為主;血清結(jié)核抗體陽性率以耐多藥結(jié)核類型最高,最低為耐藥OFX結(jié)核類型;“多種藥物耐藥結(jié)核”其血清結(jié)核抗體陽性率90.62%高于結(jié)核敏感組77.48%且具有統(tǒng)計學(xué)差異,說明血清結(jié)核抗體的陽性結(jié)果可能對“多種藥物耐藥結(jié)核”的判定具有一定的臨床價值。
劉昕亮,曹鑄,牟懷德,李娜,吳薇,張濤[9](2019)在《樂山市應(yīng)用線性探針法快速檢測耐藥結(jié)核病研究》文中研究表明目的評價線性探針法在四川省樂山市結(jié)核耐藥性檢測中的應(yīng)用效果。方法收集2017-04/2019-02樂山各縣區(qū)疾控中心結(jié)核病實驗室痰培養(yǎng)獲得的270株結(jié)核菌株作為研究對象,同時采用線性探針法和標(biāo)準(zhǔn)方法比例法檢測結(jié)核分枝桿菌對異煙肼和利福平的耐藥情況,采用一致性檢驗和χ2檢驗進行分析,計算Kappa值評價線性探針法和比例法結(jié)果的一致性,以P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果 270株結(jié)核菌株標(biāo)本中,使用線性探針法檢測異煙肼耐藥性的靈敏度為84.00%,特異度為97.54%,陽性預(yù)測值為77.78%,陰性預(yù)測值為98.35%,Kappa值為0.79;對利福平耐藥性的靈敏度為95.83%,特異度為96.34%,陽性預(yù)測值為71.88%,陰性預(yù)測值為99.58%,Kappa值為0.80;對耐多藥結(jié)核的靈敏度為80.00%,特異度為98.03%,陽性預(yù)測值為80.00%,陰性預(yù)測值為98.81%,Kappa值為0.73。與標(biāo)準(zhǔn)方法比例法相比,兩者具有高度的一致性。結(jié)論線性探針法具有高度的特異性和敏感性,且高效、快速,能有效的彌補標(biāo)準(zhǔn)方法的不足,為樂山市耐藥結(jié)核病的早發(fā)現(xiàn)、早治療提供了有力的保障。
程睿儇[10](2019)在《大理地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定及耐藥性分析》文中研究指明目的:對大理地區(qū)疑似非結(jié)核分枝桿菌((Non-tuberculous mycobacteria,NTM)的臨床分離株進行菌種鑒定;通過藥敏試驗檢測NTM的耐藥性,分析NTM耐藥菌株對利福平、異煙肼耐藥相關(guān)基因rpoB和inhA的基因突變情況,初步研究NTM的耐藥機制。方法:1.非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的的菌種鑒定:運用PNB/TCH鑒別培養(yǎng)基將18株疑似NTM的臨床株進行初步菌種鑒定,再設(shè)計16SrRNA引物,以初步鑒定為NTM的臨床分離株的DNA為模板進行聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR),PCR擴增產(chǎn)物送測序公司測序,將結(jié)果提交NCBI-BLAST網(wǎng)站,與GenBank中的標(biāo)準(zhǔn)序列進行比較和同源性分析,獲得菌種鑒定結(jié)果。結(jié)果所得2株膿腫分枝桿菌再用hsp65和rpoB引物進行PCR擴增、測序、BLAST比對后,可以將此2株膿腫分枝桿菌(Mycobacterium abscessus,M.abscessu)鑒定為不同亞種。2.非結(jié)核分枝桿菌的耐藥性研究(1)非結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性測定:采用比例法對所有NTM進行包括異煙肼(Isoniazid,INH)、利福平(Rifampicin,RFP)、乙胺丁醇(Ethambutol,EMB)、卡那霉素(Kanamycin,KM)在內(nèi)的4種藥物的敏感性試驗,其中對鳥分枝桿菌增加莫西沙星(Moxifloxacin,MFX),膿腫分枝桿菌增加阿米卡星(Amikacin,AK)的藥物敏感性試驗,來分析NTM的耐藥情況。(2)非結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因分析:1)設(shè)計合成引物inhA,采用PCR技術(shù)擴增膿腫分枝桿菌的inhA基因,對目的基因inhA進行DNA測序并將測序結(jié)果與結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(H37Rv)以及膿腫分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC19977)的inhA基因序列進行比較,分析他們之間的基因差異,從而進一步分析inhA基因的突變與膿腫分枝桿菌對異煙肼耐藥的關(guān)系。2)設(shè)計合成引物rpoB2,采用PCR法擴增對利福平耐藥的膿腫分枝桿菌臨床株的rpoB2基因,將擴增后目的基因所測序列與膿腫分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC19977)的rpoB2基因序列相比對尋找基因差異。3)設(shè)計合成引物rpoB1,利用PCR技術(shù)擴增對利福平耐藥的鳥分枝桿菌的rpoB1基因的81bp核心區(qū)域,提取目的基因rpoB1片段送測序公司測序,所得測序結(jié)果與鳥分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC25291)的rpoB1基因序列進行比對,找出鳥分枝桿菌耐藥株與標(biāo)準(zhǔn)株在該區(qū)域的基因差異。結(jié)果:1.非結(jié)核分枝桿菌的菌種鑒定:運用PNB/TCH鑒別培養(yǎng)基將18株疑似非結(jié)核分枝桿菌的臨床株初步鑒別為NTM 14株和MTB 4株,再擴增NTM的基因16SrRNA,測序、比對后將初步鑒定為NTM的14株臨床株準(zhǔn)確地鑒定為NTM 12株、束村氏菌1株及戈登氏菌1株,其中12株NTM亦能被16SrRNA引物鑒定為慢生長分枝桿菌(Slowly growing mycobacterium,SGM)中的鳥分枝桿菌10株(83%)和快生長分枝桿菌(Rapidly growing mycobacterium,RGM)中的膿腫分枝桿菌2株(17%)。在膿腫分枝桿菌中,可運用hsp65和rpoB兩對引物將其更為準(zhǔn)確地鑒定為Bolletii亞種和Abscessus亞種,其中有Bolletii亞種1株,Abscessus亞種1株。2.非結(jié)核分枝桿菌的耐藥性研究(1)非結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性測定:試驗結(jié)果顯示,在10株鳥分枝桿菌的5種藥物的藥敏試驗中,10株菌株對異煙肼、卡那霉素全部耐藥;9株對利福平耐藥,1株敏感;7株對乙胺丁醇、莫西沙星耐藥,3株敏感。2株膿腫分枝桿菌對5種抗結(jié)核藥物全部耐藥。(2)非結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因分析:1)采用PCR技術(shù)擴增出3條膿腫分枝桿菌長度為810bp的inhA基因片段,與Genebank中相應(yīng)基因一致;2株膿腫分枝桿菌臨床株與標(biāo)準(zhǔn)株相比較,結(jié)果顯示1號臨床株的核苷酸差異表達位點2個,5號株的核苷酸差異表達位點7個。3株膿腫分枝桿菌與H37Rv的inhA基因通過測序、序列比對分析發(fā)現(xiàn)差異表達位點1號株有607個,5號株有581個,標(biāo)準(zhǔn)株有567個;在inhA基因中,H37Rv的inhA基因第94位密碼子所表達的氨基酸為絲氨酸(Ser),2株膿腫分枝桿菌臨床株表達為蘇氨酸(Thr)。2)2株膿腫分枝桿菌利用rpoB2基因經(jīng)PCR擴增,合成大小約1300bp的DNA片段;在第146位密碼子、基因突變集結(jié)Ⅰ區(qū)、基因突變集結(jié)Ⅱ區(qū)這3部分區(qū)域,通過比較膿腫分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC19977)與結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(H37Rv),膿腫分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株與耐利福平的膿腫分枝桿菌臨床株在各個區(qū)域的比對結(jié)果,均未發(fā)現(xiàn)存在有義突變,均編碼相同氨基酸。3)5株對利福平耐藥的鳥分枝桿菌通過運用rpoB1基因擴增出長度約為1400bp的目的基因片段;檢測對利福平耐藥的鳥分枝桿菌的rpoB1基因的81bp核心區(qū)域發(fā)現(xiàn)鳥分枝桿菌的rpoB1基因在此區(qū)域未發(fā)生有義突變。結(jié)論:1.NTM臨床株通過運用16SrRNA基因,被更精確的鑒定為NTM不同菌種。hsp65和rpoB的基因擴增測序法可將膿腫分枝桿菌鑒定為不同亞種,且2種鑒定法結(jié)果一致。2.鳥分枝桿菌對常見抗結(jié)核藥物高度耐藥,膿腫分枝桿菌不僅對抗結(jié)核藥物耐藥,且表現(xiàn)為多藥耐藥;膿腫分枝桿菌臨床株和結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株(H37Rv)在inhA基因上的差異位點所表達的核苷酸不同可能是導(dǎo)致膿腫分枝桿菌對異煙肼天然耐藥的原因;分枝桿菌對異煙肼的耐藥機制并非由于其第94位密碼子發(fā)生的絲氨酸(Ser)被丙氨酸(Ala)取代,提示膿腫分枝桿菌耐異煙肼存在其他原因;耐利福平的膿腫分枝桿菌的rpoB2基因在基因突變高發(fā)區(qū)并未發(fā)生突變,說明其對利福平的耐藥機制與MTB不同;對利福平耐藥的鳥分枝桿菌的rpoB1基因其81bp的基因突變區(qū)未發(fā)生突變,表明鳥分枝桿菌對利福平的耐藥機制亦不同于MTB。
二、比例法檢測1875株結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性(論文開題報告)
(1)論文研究背景及目的
此處內(nèi)容要求:
首先簡單簡介論文所研究問題的基本概念和背景,再而簡單明了地指出論文所要研究解決的具體問題,并提出你的論文準(zhǔn)備的觀點或解決方法。
寫法范例:
本文主要提出一款精簡64位RISC處理器存儲管理單元結(jié)構(gòu)并詳細分析其設(shè)計過程。在該MMU結(jié)構(gòu)中,TLB采用叁個分離的TLB,TLB采用基于內(nèi)容查找的相聯(lián)存儲器并行查找,支持粗粒度為64KB和細粒度為4KB兩種頁面大小,采用多級分層頁表結(jié)構(gòu)映射地址空間,并詳細論述了四級頁表轉(zhuǎn)換過程,TLB結(jié)構(gòu)組織等。該MMU結(jié)構(gòu)將作為該處理器存儲系統(tǒng)實現(xiàn)的一個重要組成部分。
(2)本文研究方法
調(diào)查法:該方法是有目的、有系統(tǒng)的搜集有關(guān)研究對象的具體信息。
觀察法:用自己的感官和輔助工具直接觀察研究對象從而得到有關(guān)信息。
實驗法:通過主支變革、控制研究對象來發(fā)現(xiàn)與確認(rèn)事物間的因果關(guān)系。
文獻研究法:通過調(diào)查文獻來獲得資料,從而全面的、正確的了解掌握研究方法。
實證研究法:依據(jù)現(xiàn)有的科學(xué)理論和實踐的需要提出設(shè)計。
定性分析法:對研究對象進行“質(zhì)”的方面的研究,這個方法需要計算的數(shù)據(jù)較少。
定量分析法:通過具體的數(shù)字,使人們對研究對象的認(rèn)識進一步精確化。
跨學(xué)科研究法:運用多學(xué)科的理論、方法和成果從整體上對某一課題進行研究。
功能分析法:這是社會科學(xué)用來分析社會現(xiàn)象的一種方法,從某一功能出發(fā)研究多個方面的影響。
模擬法:通過創(chuàng)設(shè)一個與原型相似的模型來間接研究原型某種特性的一種形容方法。
三、比例法檢測1875株結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性(論文提綱范文)
(1)云南省部分地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的病原學(xué)及其生物特性研究(論文提綱范文)
摘要 |
Abstract |
課題資助情況 |
縮略語中英對照表 |
前言 |
第一章 云南省部分地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌菌種鑒定 |
1.1 實驗材料 |
1.1.1 菌株來源 |
1.1.2 實驗耗材及試劑 |
1.2 實驗方法 |
1.2.1 菌種復(fù)蘇 |
1.2.2 菌種保存 |
1.2.3 菌種初步鑒別 |
1.2.4 菌體DNA提取 |
1.2.5 聚合酶鏈反應(yīng) |
1.2.6 瓊脂糖凝膠電泳 |
1.2.7 普通瓊脂糖凝膠DNA回收試驗 |
1.2.8 純化后DNA測序結(jié)果比對 |
1.3 實驗結(jié)果 |
1.3.1 抗酸染色結(jié)果 |
1.3.2 非結(jié)核分枝桿菌在中性羅氏培養(yǎng)基上的生長情況 |
1.3.3 鑒別培養(yǎng)基菌種鑒定初步結(jié)果 |
1.3.4 PCR擴增后瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果 |
1.3.5 DNA測序比對結(jié)果 |
1.4 討論 |
1.5 小結(jié) |
第二章 鳥分枝桿菌基因多態(tài)性分析 |
2.1 實驗材料 |
2.1.1 菌株來源 |
2.1.2 實驗耗材及試劑 |
2.2 實驗方法 |
2.2.1 PCR |
2.2.2 瓊脂糖凝膠電泳 |
2.2.3 結(jié)果分析方法 |
2.3 實驗結(jié)果 |
2.3.1 聚合酶鏈反應(yīng)實驗結(jié)果 |
2.3.2 VNTR多位點基因分析 |
2.3.3 鳥分枝桿菌各個位點的重復(fù)次數(shù)及分辨率以及聚類分析結(jié)果 |
2.4 討論 |
2.5 小結(jié) |
第三章 鳥分枝桿菌藥物敏感性檢測 |
3.1 實驗材料 |
3.1.1 菌株來源 |
3.1.2 實驗耗材及試劑 |
3.2 實驗方法 |
3.2.1 菌懸液制備 |
3.2.2 菌懸液稀釋 |
3.2.3 比例法藥物敏感性試驗接種 |
3.2.4 鳥分枝桿菌的培養(yǎng) |
3.2.5 藥敏實驗結(jié)果判讀 |
3.3 實驗結(jié)果 |
3.3.1 HIV合并NTM雙感來源鳥分枝桿菌的生長情況 |
3.3.2 鳥分枝桿菌低稀釋度和高稀釋度藥敏實驗結(jié)果 |
3.3.3 鳥分枝桿菌對抗結(jié)核藥物的耐藥分析 |
3.4 討論 |
3.5 小結(jié) |
結(jié)論 |
參考文獻 |
綜述 AIDS合并鳥分枝桿菌感染的研究進展 |
參考文獻 |
致謝 |
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果 |
(2)微量液體培養(yǎng)基最低抑菌濃度法與羅氏比例法在結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗中的價值比較(論文提綱范文)
1 資料與方法 |
1.1 一般資料 |
1.2 方法 |
1.3 觀察指標(biāo) |
1.4 統(tǒng)計學(xué)分析 |
2 結(jié)果 |
2.1 2種方法的結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗結(jié)果比較 |
2.2 2種檢測方法的一致性判斷 |
3 討論 |
(3)結(jié)核分枝桿菌抗性藥物體外評價菌株體系的構(gòu)建及新藥篩選(論文提綱范文)
縮略詞列表 |
摘要 |
Summary |
第一章 抗結(jié)核菌藥物耐藥菌庫的構(gòu)建 |
1.1 前言 |
1.1.1 結(jié)核病治療藥物的分類 |
1.1.2 兩種一線抗結(jié)核藥物的作用機制 |
1.1.2.1 利福平及其作用機制 |
1.1.2.2 乙胺丁醇及其作用機制 |
1.1.3 利福平及乙胺丁醇耐藥菌庫構(gòu)建意義 |
1.1.4 候選藥物體外抗結(jié)核活性藥效評價的意義 |
1.2 材料和方法 |
1.2.1 菌株來源 |
1.2.2 主要試劑及耗材 |
1.2.3 主要儀器設(shè)備 |
1.2.4 試劑配置 |
1.2.5 實驗方法 |
1.2.5.1 文獻檢索、數(shù)據(jù)提取及匯總 |
1.2.5.2 菌種保藏及復(fù)蘇傳代 |
1.2.5.3 單菌落篩選及傳代 |
1.2.5.4 水煮法提取DNA |
1.2.5.5 PCR擴增 |
1.2.5.6 瓊脂糖凝膠電泳 |
1.2.5.7 測序及序列分析 |
1.2.5.8 藥物敏感性試驗 |
1.2.5.9 候選藥物體外抗結(jié)核活性藥效評價 |
1.3 實驗結(jié)果 |
1.3.1 利福平和異煙肼耐藥位點數(shù)據(jù)庫 |
1.3.1.1 利福平耐藥位點 |
1.3.1.2 乙胺丁醇耐藥位點 |
1.3.2 利福平及乙胺丁醇耐藥菌株庫的構(gòu)建 |
1.3.3 候選藥物體外抗結(jié)核活性藥效評價 |
1.3.3.1 菌株選取結(jié)果 |
1.3.3.2 藥液配制信息 |
1.3.3.3 結(jié)核分枝桿菌耐藥菌株庫在藥物研發(fā)中的應(yīng)用 |
1.4 討論 |
第二章 2000-2019年我國非結(jié)核分枝桿菌流行趨勢及耐藥性的系統(tǒng)評價及meta分析 |
2.1 前言 |
2.2 材料和方法 |
2.2.1 文獻檢索 |
2.2.2 文獻納入和排除標(biāo)準(zhǔn) |
2.2.3 文獻數(shù)據(jù)提取 |
2.2.4 重復(fù)數(shù)據(jù)處理 |
2.2.5 數(shù)據(jù)分析 |
2.3 實驗結(jié)果 |
2.3.1 文獻篩選結(jié)果 |
2.3.2 非結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)分離和鑒定方法統(tǒng)計分析 |
2.3.3 非結(jié)核分支桿菌菌種構(gòu)成 |
2.3.3.1 樣本來源省份分布 |
2.3.3.2 文獻異質(zhì)性分析 |
2.3.3.3 菌種構(gòu)成 |
2.3.3.4 優(yōu)勢菌種分布差異 |
2.3.3.5 RGM與 SGM的分離率 |
2.3.4 基礎(chǔ)性疾病統(tǒng)計 |
2.3.5 中國大陸地區(qū)優(yōu)勢菌種的耐藥情況 |
2.3.5.1 藥敏試驗方法使用頻率統(tǒng)計 |
2.3.5.2 使用的抗生素折點濃度的統(tǒng)計 |
2.3.5.3 優(yōu)勢菌種的耐藥率 |
2.4 討論 |
第三章 總結(jié) |
3.1 主要結(jié)論 |
3.2 主要創(chuàng)新點 |
3.3 后續(xù)研究建議 |
致謝 |
參考文獻 |
附錄 |
(4)抗結(jié)核菌藥物耐藥數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及其體外活性評價(論文提綱范文)
學(xué)位論文數(shù)據(jù)集 |
摘要 |
ABSTRACT |
第一章 緒論 |
1.1 結(jié)核流行現(xiàn)狀 |
1.2 結(jié)核分枝桿菌概述 |
1.3 耐藥結(jié)核分枝桿菌 |
1.3.1 利福平耐藥機制 |
1.3.2 異煙肼耐藥機制 |
1.3.3 鏈霉素耐藥機制 |
1.3.4 乙胺丁醇耐藥機制 |
1.4 耐藥結(jié)核分枝桿菌的檢測和治療 |
1.5 環(huán)絲氨酸 |
1.6 本論文主要研究的意義及內(nèi)容 |
1.6.1 本論文研究的意義 |
1.6.2 本論文研究的內(nèi)容 |
第二章 一線抗結(jié)核菌藥物耐藥位點數(shù)據(jù)庫 |
2.1 引言 |
2.2 材料和方法 |
2.2.1 數(shù)據(jù)檢索 |
2.2.2 文獻選擇標(biāo)準(zhǔn) |
2.2.3 數(shù)據(jù)提取 |
2.2.4 測序位點范圍 |
2.2.5 突變頻率的計算 |
2.3 實驗結(jié)果及討論 |
2.3.1 異煙肼突變頻率 |
2.3.2 鏈霉素突變頻率 |
2.3.3 菌庫耐藥位點 |
2.4 本章小結(jié) |
第三章 一線抗結(jié)核菌藥物體外評價體系的構(gòu)建 |
3.1 引言 |
3.2 實驗材料 |
3.2.1 菌株來源 |
3.2.2 實驗試劑 |
3.2.3 主要溶液配制 |
3.2.4 主要儀器設(shè)備 |
3.3 實驗方法 |
3.3.1 改良羅氏培養(yǎng)基制備 |
3.3.2 單克隆培養(yǎng) |
3.3.3 DNA模板制備 |
3.3.4 PCR擴增和測序 |
3.3.5 藥物敏感性測試 |
3.4 實驗結(jié)果及討論 |
3.4.1 菌庫構(gòu)建——異煙肼 |
3.4.2 菌庫構(gòu)建——鏈霉素 |
3.5 本章小結(jié) |
第四章 新藥篩選 |
4.1 引言 |
4.2 實驗材料 |
4.2.1 菌株來源 |
4.2.2 實驗試劑 |
4.2.3 主要溶液配制 |
4.2.4 主要儀器設(shè)備 |
4.3 實驗方法 |
4.3.1 改良羅氏培養(yǎng)基制備 |
4.3.2 單克隆培養(yǎng) |
4.3.3 藥物敏感性測試 |
4.4 實驗結(jié)果及討論 |
4.4.1 藥物篩選 |
4.4.2 藥物評價 |
4.5 本章小結(jié) |
第五章 環(huán)絲氨酸在藥敏實驗中降解性的研究 |
5.1 引言 |
5.2 實驗材料 |
5.2.1 菌株來源 |
5.2.2 實驗試劑 |
5.2.3 主要溶液配制 |
5.2.4 主要儀器設(shè)備 |
5.3 實驗方法 |
5.3.1 環(huán)絲氨酸溶液制備 |
5.3.2 藥物敏感性測試 |
5.3.3 超高效液相色譜和液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用 |
5.4 實驗結(jié)果及討論 |
5.4.1 MIC隨藥敏時間變化 |
5.4.2 環(huán)絲氨酸的定量和定性分析 |
5.5 本章小結(jié) |
第六章 結(jié)論與展望 |
6.1 結(jié)論 |
6.2 展望 |
參考文獻 |
致謝 |
附錄 |
攻讀碩士學(xué)位期間所發(fā)表的論文 |
作者簡介 |
導(dǎo)師簡介 |
北京化工大學(xué)專業(yè)學(xué)位碩士研究生學(xué)位論文答辯委員會決議書 |
(5)大理地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的菌種分布及優(yōu)勢菌群的生物學(xué)性狀研究(論文提綱范文)
中文摘要 |
Abstract |
課題資助情況 |
英漢縮略詞與英漢對照 |
前言 |
第1章 大理地區(qū)NTM/HIV感染者NTM的菌種鑒定 |
1.1 實驗材料 |
1.1.1 標(biāo)本來源 |
1.1.2 主要試劑與儀器 |
1.1.3 主要試劑的配制 |
1.2 實驗方法 |
1.2.1 菌株的初步鑒定與分離培養(yǎng) |
1.2.2 非結(jié)核分枝桿菌的培養(yǎng)和保存 |
1.2.3 非結(jié)核分枝桿菌基因多位點序列分析鑒定 |
1.3 實驗結(jié)果 |
1.3.1 抗酸染色鏡檢 |
1.3.2 部分NTM菌落的生長狀況 |
1.3.3 鑒別培養(yǎng)基的鑒定 |
1.3.4 多位點PCR擴增的電泳結(jié)果 |
1.3.5 多位點PCR擴增產(chǎn)物測序結(jié)果及同源性分析 |
1.3.6 菌種分布情況 |
1.4 討論 |
1.5 小結(jié) |
第2章 大理地區(qū)NTM/HIV感染者NTM中鳥分枝桿菌MLVA法基因分型研究 |
2.1 實驗材料 |
2.1.1 菌株來源 |
2.1.2 實驗試劑和儀器 |
2.1.3 主要試劑的配制 |
2.2 實驗方法 |
2.2.1 鳥分枝桿菌的DNA提取 |
2.2.2 MLVA基因分型法 |
2.3 實驗結(jié)果 |
2.3.1 PCR擴增結(jié)果重復(fù)性的檢測 |
2.3.2 VNTR基因位點的多態(tài)性檢測 |
2.3.3 不同位點的分辨力 |
2.3.4 UPGMA法聚類分析結(jié)果 |
2.3.5 用MST法聚類分析的結(jié)果 |
2.4 討論 |
2.5 小結(jié) |
第3章 鳥分枝桿菌藥物敏感性測定 |
3.1 實驗材料 |
3.1.1 菌株來源 |
3.1.2 實驗試劑和儀器 |
3.2 實驗方法 |
3.2.1 鳥分枝桿菌的傳代培養(yǎng) |
3.2.2 菌株的藥物敏感性測定 |
3.2.3 質(zhì)量控制以及注意事項 |
3.3 實驗結(jié)果 |
3.3.1 雙感菌株在藥敏培養(yǎng)基上的生長情況 |
3.3.2 培養(yǎng)結(jié)果報告 |
3.3.3 鳥分枝桿菌對二線抗結(jié)核藥物的耐藥情況 |
3.4 討論 |
3.5 小結(jié) |
第4章 鳥分枝桿菌PPE25-MAV蛋白對小鼠巨噬細胞凋亡的影響 |
4.1 實驗材料 |
4.1.1 實驗細胞 |
4.1.2 實驗試劑和儀器 |
4.1.3 試劑的配制 |
4.2 實驗方法 |
4.2.1 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定 |
4.2.2 PPE25-MAV蛋白的誘導(dǎo)表達與鑒定 |
4.2.3 PPE-25 MAV蛋白的純化以及柱上復(fù)性 |
4.2.4 Ana-1小鼠巨噬細胞的培養(yǎng) |
4.2.5 PPE25-MAV蛋白對巨噬細胞凋亡的影響 |
4.3 實驗結(jié)果 |
4.3.1 重組質(zhì)粒的鑒定 |
4.3.2 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達 |
4.3.3 PPE25-MAV蛋白的Western Blot鑒定 |
4.3.4 PPE25-MAV蛋白的表達形式 |
4.3.5 流式細胞術(shù)檢測PPE25-MAV蛋白對巨噬細胞的影響 |
4.4 討論 |
4.5 小結(jié) |
全文總結(jié) |
參考文獻 |
綜述 非結(jié)核分枝桿菌基因分型的研究進展 |
參考文獻 |
致謝 |
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果 |
(6)DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥基因的價值研究(論文提綱范文)
摘要 |
abstract |
引言 |
第一章 資料和方法 |
研究對象 |
標(biāo)本采集 |
指標(biāo)檢測 |
1.用改良羅氏培養(yǎng)法及菌種初步鑒定,并行比例法抗結(jié)核藥物敏感性試驗 |
2.用DNA微陣列芯片法(結(jié)核分枝桿菌耐藥基因檢測試劑盒)檢測結(jié)核分枝桿菌的耐藥性 |
統(tǒng)計學(xué)分析 |
第二章 研究結(jié)果 |
1.DNA 微陣列芯片法與傳統(tǒng)結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)及藥敏試驗對利福平耐藥性監(jiān)測結(jié)果的比較 |
2.DNA 微陣列芯片法檢測利福平耐藥基因相關(guān)突變位點情況 |
3.DNA 微陣列芯片法與傳統(tǒng)結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)及藥敏試驗的耐多藥檢測結(jié)果比較 |
4. DNA 微陣列芯片法檢測耐多藥基因相關(guān)突變位點情況 |
第三章 討論 |
第四章 結(jié)論 |
參考文獻 |
綜述 |
綜述參考文獻 |
攻讀學(xué)位期間的研究成果 |
附錄 中英文縮略詞對照表 |
致謝 |
(7)耐多藥結(jié)核分枝桿菌藥物敏感譜及其與基因型相關(guān)性研究(論文提綱范文)
摘要 |
Abstract |
常用縮寫詞中英文對照表 |
第1章 前言 |
第2章 材料與方法 |
2.1 主要材料 |
2.2 菌株來源 |
2.3 菌株傳代復(fù)蘇 |
2.4 結(jié)核分枝桿菌藥物敏感性檢測 |
2.5 CTAB法提取全基因組DNA |
2.6 MDR-TB菌株基因分型 |
2.7 本文中所涉及的相關(guān)定義 |
2.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析 |
2.9 總技術(shù)路線圖 |
第3章 結(jié)果 |
3.1 樣本菌株納入情況 |
3.2 所有菌株MIC值分布情況 |
3.3 結(jié)核分枝桿菌各藥物耐藥情況 |
3.4 抗結(jié)核藥物耐藥表型與MDR-TB之間關(guān)聯(lián)性分析 |
3.5 pre-XDR、XDR菌株耐藥性分析 |
3.6 MDR-TB菌株中抗結(jié)核藥物交叉耐藥情況 |
3.7 MDR-TB菌株基因型與藥物敏感性分析 |
第4章 討論 |
4.1 結(jié)核分枝桿菌耐藥特征分析 |
4.2 MDR-TB菌株中抗結(jié)核藥物交叉耐藥特征分析 |
4.3 MDR-TB菌株基因型與藥物敏感性分析 |
第5章 結(jié)論 |
參考文獻 |
文獻綜述 |
參考文獻 |
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文 |
致謝 |
(8)耐藥結(jié)核分枝桿菌的篩查及其血清結(jié)核抗體價值研究(論文提綱范文)
縮略詞 |
摘要 |
ABSTRACT |
前言 |
1.材料與方法 |
1.1 研究對象 |
1.2 主要試劑以及儀器 |
1.3 實驗方法 |
1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析 |
2.結(jié)果 |
2.1 結(jié)核耐藥組與結(jié)核敏感組的基本情況比較 |
2.2 結(jié)核耐藥組總體抗結(jié)核藥物耐藥情況 |
2.3 結(jié)核耐藥組耐藥類型分布 |
2.4 血清結(jié)核抗體檢測的結(jié)果 |
2.5 多種藥物耐藥結(jié)核與結(jié)核敏感組血清抗體結(jié)核檢測結(jié)果的比較 |
3.討論 |
4.結(jié)論 |
參考文獻 |
綜述 耐藥結(jié)核分枝桿菌檢測技術(shù)進展 |
綜述參考文獻 |
個人簡歷 |
致謝 |
(9)樂山市應(yīng)用線性探針法快速檢測耐藥結(jié)核病研究(論文提綱范文)
1 材料與方法 |
1.1 標(biāo)本來源 |
1.2 儀器 |
1.3 試劑 |
1.4 檢測方法 |
1.5 統(tǒng)計分析 |
2 結(jié)果 |
2.1 線性探針法與比例法藥物敏感性試驗對比 |
2.2 線性探針法與比例法檢測耐多藥結(jié)核的結(jié)果 |
2.3 線性探針法與比例法菌群鑒定試驗結(jié)果 |
2.4 不同病例類型中兩種方法的結(jié)果分析 |
2.5 線性探針法中耐藥突變位點結(jié)果分析 |
3 討論 |
(10)大理地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定及耐藥性分析(論文提綱范文)
縮略詞表 |
中文摘要 |
ABSTRACT |
前言 |
第一部分 大理地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定 |
材料與方法 |
1 實驗材料 |
2 方法 |
結(jié)果 |
1 抗酸染色鏡檢 |
2 部分分枝桿菌菌落生長情況 |
3 鑒別培養(yǎng)基初步菌種鑒定結(jié)果 |
4 16S rRNA、hsp65和rpoB基因的PCR擴增及測序后比對結(jié)果分析 |
5 菌種分布情況 |
6 膿腫分枝桿菌亞種的菌種鑒定 |
7 系統(tǒng)進化樹的分析 |
討論 |
小結(jié) |
第二部分 非結(jié)核分枝桿菌的耐藥性研究 |
(一)非結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性測定 |
材料 |
1 菌株來源 |
方法 |
1 NTM的傳代培養(yǎng) |
2 NTM的藥物敏感性測定 |
3 質(zhì)量控制 |
結(jié)果 |
1 NTM在藥敏培養(yǎng)基上生長情況 |
2 鳥分枝桿菌和膿腫分枝桿菌藥敏培養(yǎng)結(jié)果 |
3 鳥分枝桿菌和膿腫分枝桿菌對抗結(jié)核藥物的耐藥情況 |
討論 |
小結(jié) |
(二)非結(jié)核分枝桿菌耐藥相關(guān)基因分析 |
材料 |
1 菌株來源 |
2 主要儀器和試劑 |
方法 |
1 引物的設(shè)計與合成 |
2 鳥分枝桿菌和膿腫分枝桿菌基因組DNA的提取 |
3 PCR擴增 |
4 PCR產(chǎn)物電泳 |
5 PCR產(chǎn)物回收、純化和測序 |
結(jié)果 |
1 膿腫分枝桿菌inhA基因的擴增、測序和比對結(jié)果 |
2 膿腫分枝桿菌rpoB2基因的擴增、測序和比對結(jié)果 |
3 鳥分枝桿菌rpoB1基因的擴增、測序和比對結(jié)果 |
討論 |
小結(jié) |
全文總結(jié) |
參考文獻 |
攻讀學(xué)位期間發(fā)表論文的情況 |
綜述 |
參考文獻 |
致謝 |
四、比例法檢測1875株結(jié)核分枝桿菌的藥物敏感性(論文參考文獻)
- [1]云南省部分地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的病原學(xué)及其生物特性研究[D]. 陳越. 大理大學(xué), 2021(09)
- [2]微量液體培養(yǎng)基最低抑菌濃度法與羅氏比例法在結(jié)核分枝桿菌藥敏試驗中的價值比較[J]. 劉金娜. 實用臨床醫(yī)藥雜志, 2020(17)
- [3]結(jié)核分枝桿菌抗性藥物體外評價菌株體系的構(gòu)建及新藥篩選[D]. 周蕾. 貴州大學(xué), 2020(02)
- [4]抗結(jié)核菌藥物耐藥數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建及其體外活性評價[D]. 馬翠蝶. 北京化工大學(xué), 2020(02)
- [5]大理地區(qū)HIV相關(guān)NTM病的菌種分布及優(yōu)勢菌群的生物學(xué)性狀研究[D]. 翟凱新. 大理大學(xué), 2020(05)
- [6]DNA微陣列芯片法檢測結(jié)核分枝桿菌利福平耐藥基因的價值研究[D]. 竇敏. 青島大學(xué), 2020(01)
- [7]耐多藥結(jié)核分枝桿菌藥物敏感譜及其與基因型相關(guān)性研究[D]. 陳蓉. 南華大學(xué), 2020(01)
- [8]耐藥結(jié)核分枝桿菌的篩查及其血清結(jié)核抗體價值研究[D]. 劉佳. 海南醫(yī)學(xué)院, 2020(01)
- [9]樂山市應(yīng)用線性探針法快速檢測耐藥結(jié)核病研究[J]. 劉昕亮,曹鑄,牟懷德,李娜,吳薇,張濤. 預(yù)防醫(yī)學(xué)情報雜志, 2019(09)
- [10]大理地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌臨床分離株的菌種鑒定及耐藥性分析[D]. 程睿儇. 大理大學(xué), 2019(01)
標(biāo)簽:分枝桿菌論文; 利福平論文; 藥敏試驗論文; 耐藥結(jié)核病論文; 敏感性分析論文;