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雙實(shí)時(shí)熒光定量PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血性弧菌

雙實(shí)時(shí)熒光定量PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血性弧菌

一、雙重實(shí)時(shí)PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血弧菌(論文文獻(xiàn)綜述)

鐘宜科[1](2020)在《基于HAND系統(tǒng)15種食源性致病菌多重實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理近年來,食源性疾病的發(fā)病率居高不下,在全世界范圍內(nèi)都是一個(gè)日益嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題。世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)統(tǒng)計(jì)顯示由病原微生物引起的食源性疾病比例達(dá)50%以上,因此急需建立一種有效的食源性致病菌檢測方法。傳統(tǒng)的食源性病原體檢測和鑒定方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力,不足以滿足食品快速檢測的要求。為阻止疾病的傳播、監(jiān)控食品的衛(wèi)生安全,保障人民的安全,急需建立一種快速、簡單和有效的檢測技術(shù)。本文將腸粘附性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌、假結(jié)核耶爾森菌、結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、副溶血性弧菌、霍亂弧菌、腸炎沙門氏菌、類志賀鄰單胞菌、嗜水氣單胞菌和福氏志賀氏菌為模式菌株,建立一種快速檢測15種食源性致病菌的多重實(shí)時(shí)PCR技術(shù)。主要研究結(jié)果如下:(1)通過HAND系統(tǒng)建立了一種能夠同時(shí)檢測15種食源性致病菌多重實(shí)時(shí)PCR方法,具有特異性高、靈敏度好、重復(fù)性和穩(wěn)定性高等特點(diǎn),并且適用于復(fù)雜樣本的檢測;(2)通過玻璃化技術(shù),將多重實(shí)時(shí)PCR中熱不穩(wěn)定成分(Taq酶、dNTP、染料和引物)玻璃化到PCR管蓋上。實(shí)驗(yàn)表明,試劑的活性不受玻璃化的影響實(shí)驗(yàn),并且被玻璃化成分高度穩(wěn)定,能夠在室溫(25℃)下保存12年,從而克服了冷鏈運(yùn)輸和低溫儲存的局限性;(3)針對復(fù)雜樣本的快速提取,研制了一種以Chelex-100和TritonX-100為主要裂解成分的核酸提取液,評價(jià)其對15種食源性致病菌核酸提取的效果,結(jié)果顯示只需要在90℃裂解10 min,即可適用于熒光定量PCR檢測技術(shù),具有操作簡便、裂解效果好、不影響后續(xù)反應(yīng)的特點(diǎn),且不受糞便和食品等復(fù)雜樣本的影響。綜上所述,本研究通過HAND系統(tǒng)與玻璃化技術(shù)相結(jié)合建立了一種能夠同時(shí)檢測15種食源性致病菌快速檢測方法,具有良好的特異性與敏感性,解決了樣本核酸提取和加樣繁瑣、復(fù)雜以及試劑在非低溫環(huán)境下易失活的問題。

凌嬌[2](2018)在《副溶血弧菌qPCR檢測及T6SS-1效應(yīng)因子的篩選和功能研究》文中研究指明副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus,Vp)和霍亂弧菌(Vibrio cholerae,Vc)均屬于革蘭氏陰性菌,是引起食源性胃腸炎或敗血癥的重要病原體。它們廣泛分布于河口、沿海水域及沉積物,隨著海產(chǎn)品消售量日益增加,建立一種能同時(shí)檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌的快速準(zhǔn)確的檢測方法至關(guān)重要。致病性副溶血弧菌公認(rèn)的毒力因子為耐熱穩(wěn)定性直接溶血素(TDH)與TDH相關(guān)溶血素(TRH)。近幾年發(fā)現(xiàn)的VⅥ型分泌系統(tǒng)(T6SS)廣泛存在于革蘭氏陰性細(xì)菌中,在細(xì)菌的生存及致病性上起著非常重要的作用。由T6SS遞送的多種蛋白質(zhì),被稱為“效應(yīng)因子”,現(xiàn)在已被鑒定并在靶細(xì)胞中呈現(xiàn)各種毒性活性。本研究首次建立一種基于TaqMan探針法同步定量檢測副溶血弧菌(toxR)和霍亂弧菌(ompW)的雙重?zé)晒舛縋CR方法,是同時(shí)快速檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌的有效手段。采用超濾管濃縮法、Label-free蛋白組學(xué)分析及Western-blot技術(shù),從野生株SH112和雙缺失株△vipA1-hcp1中成功篩選并鑒定分泌蛋白VP0837和VP0285均屬于副溶血弧菌T6SS-1的效應(yīng)因子。此外,通過對效應(yīng)蛋白VP0837基因缺失株生物學(xué)特性和致病性分析,表明T6SS-1在副溶血弧菌的致病過程中扮演著重要的角色。試驗(yàn)Ⅰ 副溶血弧菌與霍亂弧菌雙重?zé)晒舛縋CR快速檢測方法的建立及應(yīng)用建立一種基于TaqMan探針法同步定量檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌的雙重?zé)晒舛縋CR方法。根據(jù)副溶血弧菌toxR基因和霍亂弧菌ompW基因設(shè)計(jì)特異性引物與探針。結(jié)果表明:此方法對這兩種菌的最低檢測限均達(dá)到10CFU/mL,靈敏度高;特異性試驗(yàn)表明這兩種細(xì)菌與其他病原菌(如:大腸桿菌0157、沙門氏菌、擬態(tài)弧菌、創(chuàng)傷弧菌)均無交叉反應(yīng);重復(fù)性實(shí)驗(yàn)表明變異系數(shù)均小于1.5%,說明重復(fù)性好。采用人工染菌蝦肉樣品并及時(shí)檢測,副溶血弧菌和霍亂弧菌的最低檢測限分別為100 CFU/mL和50 CFU/mL,人工染菌貝類樣品的最低檢測限分別為50 CFU/mL和50 CFU/mL。兩種細(xì)菌在蝦肉中富集2h后的最低檢出限均為1 CFU/mL。結(jié)論:本研究所建立的雙重?zé)晒釶CR檢測方法具有特異性強(qiáng)、靈敏度高和重復(fù)性好的優(yōu)點(diǎn),包括DNA提取的整個(gè)檢測過程可在1~3 h內(nèi)完成,是同時(shí)快速檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌的有效方法。試驗(yàn)Ⅱ 副溶血弧菌T6SS-1效應(yīng)蛋白的篩選與鑒定為初步篩選、鑒定副溶血弧菌T6SS-1效應(yīng)蛋白。基于本實(shí)驗(yàn)室前期研究成果,采用超濾管濃縮法分別提取副溶血弧菌野生株SH112和△vipA1-hcp1雙缺失株的分泌蛋白。蛋白酶解后用于LC-MS/MS檢測,將所篩選的蛋白進(jìn)行基因本體注釋(GO)分析和LFQ(Label Free Quantitation)分析。另外,選取兩種分泌蛋白VP0837和VP0285進(jìn)行原核表達(dá),制備多克隆抗體,并采用Western-blot方法對提取的分泌蛋白進(jìn)行鑒定。結(jié)果顯示:利用LC-MS/MS方法成功鑒定了 52個(gè)差異蛋白質(zhì),其中在△vipA1-hcp1中下調(diào)的蛋白有36個(gè),上調(diào)的有16個(gè);GO結(jié)果表明所鑒定的蛋白主要參與代謝作用、生物學(xué)定位、信號分子、氧化還原、生物學(xué)結(jié)合等過程。Western-blot表明,鼠抗VP0837和VP0285的血清均能特異性識別副溶血弧菌野生株SH112的上清蛋白,而未能識別雙缺失株△vipA1-hcp1的上清蛋白;表明分泌蛋白VP0837和VP0285均屬于副溶血弧菌T6SS-1的效應(yīng)蛋白,并且對T6SS-1的分泌功能起著重要作用。本試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究VP0837和VP0285蛋白功能及副溶血弧菌快速檢測方法奠定了基礎(chǔ)。試驗(yàn)Ⅲ 副溶血弧菌T6SS-1效應(yīng)蛋白VP0837基因缺失株的構(gòu)建及致病性分析本試驗(yàn)旨在研究T6SS-1在副溶血孤菌生物學(xué)特性和致病性中發(fā)揮的作用,以T6SS-1分泌蛋白VP0837為研究對象,構(gòu)建副溶血弧菌SH112株vp0837基因缺失株和互補(bǔ)株。通過分析各菌株的生長特性、運(yùn)動性、生物被膜形成能力的差異;比較缺失株對細(xì)胞黏附入侵與毒性、細(xì)胞炎性因子轉(zhuǎn)錄水平的差異以及對小鼠致死率的影響。試驗(yàn)結(jié)果顯示:與野生株相比,缺失株△vp0837與互補(bǔ)株C△vp0837的生長速度和生物被膜形成能力均差異不顯著;△vp0837對Caco-2細(xì)胞的毒性、黏附與入侵作用明顯降低,而使Caco-2細(xì)胞炎性因子IL-1β和IL-6表達(dá)顯著上調(diào);對ICR小鼠的致死率顯著下降。上述結(jié)果提示副溶血弧菌T6SS-1中分泌蛋白vp0837基因不僅參與了對宿主的細(xì)胞毒力和致炎性等致病過程,而且對鼠死亡率也發(fā)揮著明顯的作用,充分說明vp0837基因在副溶血弧菌的感染致病過程中扮演重要的角色。

王義濤[3](2018)在《威海地區(qū)食源性細(xì)菌的分布及病原性海洋弧菌多重降落PCR方法的建立》文中研究指明背景與目的:海洋性弧菌廣泛分布于內(nèi)灣、沿岸、外洋水域、海洋生物體和沉積物中,能夠感染魚類或哺乳動物,并可在人群中引起食物中毒。不少弧菌會導(dǎo)致人或其他動物發(fā)病,以霍亂弧菌、創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌致病力最強(qiáng)。隨著海產(chǎn)品消費(fèi)的不斷增多,因海產(chǎn)品傳播的細(xì)菌性疾病發(fā)生范圍和頻率也逐漸增大。常規(guī)的海洋弧菌檢測方法即培養(yǎng)法不能滿足快速診斷的需要,且某些海洋性弧菌培養(yǎng)困難,因此建立病原性海洋弧菌的快速檢測技術(shù),對病原性海洋性弧菌感染的診斷、治療和維護(hù)公共健康具有重要意義。本研究旨在了解威海地區(qū)食源性疾病中致病菌的分布情況,建立一種可以同時(shí)檢測臨床標(biāo)本中創(chuàng)傷弧菌及副溶血性弧菌的多重降落PCR方法,為臨床快速診斷創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌感染提供一種有效手段。方法:收集2017年3月10月威海市立醫(yī)院食源性疾病就診患者的糞便標(biāo)本357例,采用常規(guī)培養(yǎng)法結(jié)合質(zhì)譜分析對標(biāo)本中病原菌進(jìn)行鑒定。設(shè)計(jì)針對創(chuàng)傷弧菌(Vibrio vulnificus)細(xì)胞溶解素編碼基因vvh A和副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus)膠原蛋白酶編碼基因col的特異性引物,建立單一降落PCR和多重降落PCR反應(yīng)體系并進(jìn)行優(yōu)化,檢測各種標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株評價(jià)單一降落和多重降落PCR的特異性和敏感性。應(yīng)用多重降落PCR檢測103例糞便標(biāo)本中創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌,并與細(xì)菌培養(yǎng)法結(jié)果進(jìn)行比較,評價(jià)多重降落PCR在臨床標(biāo)本檢測中的可行性。結(jié)果:(1)共檢出致病微生物98株,5種疾控要求監(jiān)測病原微生物致瀉大腸埃希菌、副溶血性弧菌、沙門氏菌、諾如病毒和志賀氏菌的比率依次為26.53%、21.43%、20.41%、10.20%和7.14%;另外還檢出其它致病性海洋弧菌14株(14.28%),包括創(chuàng)傷弧菌6株(6.12%)、哈氏弧菌3株(3.06%)、溶藻弧菌3株(3.06)和燦爛弧菌2株(2.04%),海洋性弧菌的總檢出比率為35.71%。(2)單一降落PCR只分別對創(chuàng)傷弧菌或副溶血弧菌檢測到特異擴(kuò)增條帶,對其它種類弧菌和非弧菌未出現(xiàn)特異擴(kuò)增條帶;對創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌的最低檢測限分別為104 CFU/ml和103CFU/ml。(3)多重降落PCR可在目標(biāo)測試菌中同時(shí)檢測到創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌的特異性擴(kuò)增條帶,對其它種類弧菌和非弧菌未出現(xiàn)特異擴(kuò)增條帶;對創(chuàng)傷弧菌和副溶血弧菌的最低檢測限亦分別為104 CFU/ml和103 CFU/ml。(4)與細(xì)菌培養(yǎng)法比較,多重降落PCR檢測103份糞便標(biāo)本中創(chuàng)傷弧菌的靈敏度和特異性分別為l00%和97.94%,副溶血性弧菌的靈敏度與特異性分別為100%和95.12%。結(jié)論:(1)威海地區(qū)食源性疾病中海洋性弧菌檢出率高,需要對其進(jìn)行監(jiān)測。(2)成功建立快速檢測創(chuàng)傷弧菌和副溶血性弧菌的多重降落PCR方法,靈敏度高,特異性強(qiáng),可直接用于臨床標(biāo)本中創(chuàng)傷弧菌和副溶血性弧菌的快速檢測。

魏霜,馬新華,汪天杰,龍陽,紀(jì)強(qiáng),任嬌,吳希陽[4](2016)在《雙重DPO-PCR檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌》文中指出根據(jù)副溶血弧菌collagenase基因和霍亂弧菌omp W基因,分別設(shè)計(jì)特異性DPO(dual priming oligonucleotide)引物,建立一種快速檢測這兩種弧菌的多重DPO-PCR方法,并對其特異性和靈敏度進(jìn)行了評價(jià)。結(jié)果顯示,設(shè)計(jì)的DPO引物特異性較強(qiáng),副溶血弧菌和霍亂弧菌DNA可分別擴(kuò)增出307 bp與463 bp的特異性條帶,檢測靈敏度均達(dá)0.1 ng/μL。該檢測方法對退火溫度不敏感。利用該方法對69株疑似弧菌菌株進(jìn)行鑒定,結(jié)果與生理生化鑒定結(jié)果一致。該方法特異性強(qiáng)、靈敏度高,適合于對食品、水產(chǎn)品等中副溶血弧菌和霍亂弧菌的進(jìn)行快速篩檢。

韓輝,畢玉國,祁軍,胡群,譚緒良,吳海磊,王靜,徐寶梁[5](2015)在《霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重?zé)晒釶CR檢測方法的建立》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理目的建立霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌的實(shí)時(shí)熒光PCR快速檢測方法。方法根據(jù)霍亂弧菌外膜蛋白W基因(out membrane protein W,omp W)和擬態(tài)弧菌溶血素基因(Vibrio mimicus hemolysin gene,vmh)的保守序列設(shè)計(jì)引物和Taq Man探針,建立快速檢測并區(qū)分霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌的雙重?zé)晒釶CR方法,并對所建立的方法進(jìn)行靈敏度和特異度評價(jià)。結(jié)果建立了霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重?zé)晒釶CR快速檢測方法。優(yōu)化的反應(yīng)體系中,omp W引物和探針的濃度分別為100 nmol/L和200 nmol/L;vmh引物和探針的濃度均為100 nmol/L。對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為100.9%和99.7%。靈敏度和特異度均為100.0%。結(jié)論基于Taq Man探針的omp W和vmh雙重?zé)晒釶CR檢測方法,具有好的靈敏度和特異度。并且能夠在一個(gè)反應(yīng)體系中同時(shí)檢測兩種毒力基因,為繁瑣費(fèi)時(shí)的傳統(tǒng)檢測方法提供了一種快速可靠的替代選擇。

周冬根,孫大為,倪敏君,王燕,張升,翟敏[6](2012)在《多重實(shí)時(shí)熒光PCR法快速檢測水體中致病性弧菌的研究》文中指出致病性弧菌檢測方法主要是生化鑒定法,費(fèi)時(shí)費(fèi)力,而且對于生化反應(yīng)不典型或生化反應(yīng)極為相似的弧菌屬無法準(zhǔn)確鑒別,傳統(tǒng)的生化鑒定法在大規(guī)模的病害調(diào)查過程和生產(chǎn)實(shí)踐中無法做到快速準(zhǔn)確方便。多重?zé)晒釶CR方法是在DNA分子水平進(jìn)行微生物檢測的一種新方法,根據(jù)樣本中各種微生物的特異性基因?qū)δ繕?biāo)菌進(jìn)行鑒定,可以穩(wěn)定準(zhǔn)確地在種屬和菌株水平上鑒別微生物,彌補(bǔ)傳統(tǒng)生化鑒定方法的缺陷。本研究通過優(yōu)化多重?zé)晒釶CR方法體系,建立了水體中致病性弧菌的兩個(gè)多重?zé)晒釶CR檢測方法,該方法通過富集水體細(xì)菌,

韓輝,李海山,胡群,姚李四,譚緒良,賈琳[7](2011)在《霍亂毒素基因(ctx)和耐熱直接溶血素基因(tdh)雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立》文中認(rèn)為[目的]建立霍亂毒素和耐熱直接溶血素基因雙重TaqMan實(shí)時(shí)-PCR實(shí)驗(yàn)室檢測方法。[方法]根據(jù)霍亂毒素基因(Cholera toxin gene,ctx)和耐熱直接溶血素基因(thermostable direct hemolysin,tdh)的保守序列設(shè)計(jì)引物和TaqMan探針,建立檢測霍亂毒素和耐熱直接溶血素兩種毒力基因的雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR方法。對所建立的霍亂毒素基因和耐熱直接溶血素基因雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法進(jìn)行靈敏度和特異度評價(jià)。[結(jié)果]建立了霍亂毒素基因和耐熱直接溶血素基因雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR的實(shí)驗(yàn)室檢測方法。優(yōu)化的tdh和ct雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系中,ct引物和探針的濃度分別為200nmol/L和100nmol/L;tdh引物和探針的濃度分別為200nmol/L和100nmol/L。反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為94%和97.7%。[結(jié)論]本研究建立了基于TaqMan探針的tdh和ct雙重實(shí)時(shí)PCR檢測方法,具有令人滿意的靈敏度和特異度。檢測下限能達(dá)到1.0×102拷貝/μl,高于普通PCR100倍。并且雙重實(shí)時(shí)PCR能夠在一個(gè)反應(yīng)體系中同時(shí)檢測兩種毒力基因,這為費(fèi)時(shí)又繁瑣的傳統(tǒng)檢測方法提供了一種可靠又快速的替代選擇。

覃倚瑩[8](2010)在《沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌同時(shí)檢測方法的研究》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理本文建立了沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌的同時(shí)檢測方法,包括共增培養(yǎng)基及其三重?zé)晒釶CR檢測方法,使水產(chǎn)品中主要致病菌的檢測能夠通過一步增殖培養(yǎng)和一步檢測完成,大大縮短檢測時(shí)間,簡化檢測步驟,提高檢測效率。以BPW作為基礎(chǔ)培養(yǎng)基,選擇對目標(biāo)菌具有促進(jìn)作用或者對非目標(biāo)菌具有抑制作用的添加劑進(jìn)行單因素實(shí)驗(yàn)和響應(yīng)面分析實(shí)驗(yàn),研制了共增培養(yǎng)基SVV,其最佳配為:緩沖蛋白胨水20.1g/L、NaCl20g/L、亞碲酸鉀1mg/L、3號膽鹽2.5g/L、檸檬酸鈉5g/L葡萄糖1.25g/L、甘露醇1.25g/L、亞硫酸鈉1.25g/L以及丙酮酸納0.05g/L。結(jié)果顯示,SVV培養(yǎng)基能有效抑制競爭菌群,經(jīng)過一步增殖即可有效富集單個(gè)目標(biāo)菌或者混合目標(biāo)菌生長至105-108cfu/mL。同時(shí),SVV共增培養(yǎng)基具有良好的適用性,與PCR檢測技術(shù)聯(lián)用時(shí)與傳統(tǒng)檢測法的符合率達(dá)100%,能有效監(jiān)測目標(biāo)菌。以沙門氏菌的invA基因、副溶血弧菌的toxR基因和霍亂弧菌的hlyA基因?yàn)榘谢蛟O(shè)計(jì)引物探針,對設(shè)計(jì)的多對引物探針組合進(jìn)行實(shí)驗(yàn)篩選優(yōu)化,獲得最佳引物探針組合。向反應(yīng)體系中添加抗干擾物質(zhì)BSA 0.04%(w/v)和甲酰胺0.01%(w/v)提高PCR反應(yīng)體系的抗干擾能力。通過優(yōu)化反應(yīng)組分濃度和反應(yīng)條件,建立了抗干擾三重?zé)晒釶CR檢測方法。25μL反應(yīng)體系包含:1×Buffer, MgCl2 3.75mmol/L, dNTP mixture 1mmol/L,沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌的上下游引物濃度分別為0.5mmol/L、0.4 mmol/L、0.46mmol/L,探針濃度分別為0.18μmol/L、0.2μmol/L、0.22μmol/L, Taq DNA聚合酶2.5U,模板2μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃4min,94℃10s、60℃45s,40個(gè)循環(huán)。結(jié)果顯示,該法的檢測特異性達(dá)到100%,對目標(biāo)菌的檢測靈敏度分別為沙門氏菌1300cfu/mL、副溶血弧菌6400cfu/mL、霍亂弧菌2100cfu/mL。用本法與SVV共增培養(yǎng)基聯(lián)用檢測52份實(shí)際樣品,準(zhǔn)確率達(dá)100%,并能有效克服傳統(tǒng)方法對副溶血弧菌的漏檢。共增培養(yǎng)SVV突破了傳統(tǒng)培養(yǎng)法中需要針對單一細(xì)菌進(jìn)行兩步培養(yǎng),使三種目標(biāo)菌通過一步培養(yǎng)即達(dá)到檢測限以上。本文的三重?zé)晒釶CR能與簡單的DNA提取方法聯(lián)用,進(jìn)一步簡化了檢測過程,并能保證PCR反應(yīng)順利進(jìn)行。本文建立的SVV共增培養(yǎng)聯(lián)合三重?zé)晒釶CR檢測方法能快速、準(zhǔn)確地監(jiān)測沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌,可以應(yīng)用于進(jìn)出口水產(chǎn)品檢驗(yàn)檢疫和其它食品的日常監(jiān)測。

王海波[9](2009)在《重要致病性弧菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立》文中研究指明【目的】建立重要致病性弧菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法,具體包括:(1)霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(2)O1群和O139群霍亂弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(3)霍亂毒素基因(ctx)TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(4)副溶血弧菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(5)耐熱直接溶血素基因(tdh)和耐熱直接溶血素相關(guān)溶血素基因(trh)雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(6)創(chuàng)傷弧菌和溶藻弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(7)霍亂毒素基因和耐熱直接溶血素基因雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法(8)嗜水氣單胞菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法。[方法]對“目的”中涉及的前7個(gè)實(shí)時(shí)PCR檢測方法,本研究采取如下實(shí)驗(yàn)方案:(1)查閱文獻(xiàn)確定待檢測的目的基因,通過序列比對確定待檢基因的保守序列,然后借助引物探針設(shè)計(jì)軟件Beacon Designer 7.0設(shè)計(jì)單重和(或)雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR引物和探針。(2)引物擴(kuò)增待測基因,PCR產(chǎn)物經(jīng)膠回收后與T載體連接制備擴(kuò)增產(chǎn)物克隆子,挑選陽性克隆子提取質(zhì)粒,測序確認(rèn)。用EasyDilution將上述質(zhì)粒依次稀釋成1.0×1010拷貝/μl—1.0×100拷貝/μl。(3)分別在100—1000 nmol/L 10個(gè)濃度梯度和100—500 nmol/L 5個(gè)濃度梯度內(nèi),借助方差分析優(yōu)化引物和探針的濃度。(4)單重實(shí)時(shí)PCR靈敏度和特異度的評價(jià)。(5)以1.0×108拷貝/μl—1.0×100拷貝/μl 9個(gè)濃度梯度的質(zhì)粒為模板,每個(gè)濃度梯度做8個(gè)平行樣,在伯樂公司的CFX96熒光定量PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增,確定單重實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系的檢測下限以及擴(kuò)增效率。(6)將優(yōu)化了的單重實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系組合成雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系,并對雙重實(shí)時(shí)PCR的檢測下限進(jìn)行評價(jià)。對嗜水氣單胞菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法,檢測下限的評價(jià)包括菌液的檢測下限和DNA的檢測下限。將一系列稀釋度的嗜水氣單胞菌菌液人工污染健康人的糞便,評價(jià)該檢測方法從未經(jīng)增菌處理的糞便中以及增菌3小時(shí)、8小時(shí)和16小時(shí)的糞便中檢測出嗜水氣單胞菌的能力?!窘Y(jié)果】建立了重要致病性弧菌的TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法。具體結(jié)果為:(1)霍亂弧菌外膜蛋白W基因(out membrane protein w,ompW)和擬態(tài)弧菌的溶血素基因(Vibrio mimicus hemolysin,vmh)作為霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的待檢基因。優(yōu)化的反應(yīng)體系中,霍亂弧菌引物和探針的濃度分別為100 nmol/L和200 nmol/L;擬態(tài)弧菌引物和探針的濃度分別為100 nmol/L和100 nmol/L。該反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為:100.9%和99.7%。(2)O1和O139的O抗原合成基因rfb基因作為O1群和O139群霍亂弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的待檢基因。優(yōu)化的反應(yīng)體系中,O1的引物和探針的濃度均為200 nmol/L;O139的引物和探針的濃度均為200 nmol/L。該反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為:101.4%和99.9%。(3)優(yōu)化的霍亂毒素基因?qū)崟r(shí)PCR反應(yīng)體系中,ctx引物和探針的濃度均為200 nmol/L。反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對ctx質(zhì)粒模板的檢測下限為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率為99.8%。(4)副溶血弧菌的toxR基因被選作副溶血弧菌的特異性基因。優(yōu)化的toxR引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L;反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。該反應(yīng)體系對toxR質(zhì)粒模板的檢測下限為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率為100.1%。(5)優(yōu)化的tdh和trh雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系中,tdh引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L;trh引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L。該反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為:97.3%和100.1%。(6)創(chuàng)傷弧菌的溶血素基因(Vibrio vulnificus hemolysin,vvh)和溶藻弧菌的膠原酶基因(Vibrio alginolyticus collagenase,col)被選作為創(chuàng)傷弧菌和溶藻弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的待檢基因。優(yōu)化的反應(yīng)體系中,創(chuàng)傷弧菌引物和探針的濃度均為200 nmol/L;溶藻弧菌引物和探針的濃度均為200 nmol/L。反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為:100.5%和101.5%。(7)優(yōu)化的tdh和ct雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)體系中,ct引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L;tdh引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L。反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。優(yōu)化的反應(yīng)體系對兩種質(zhì)粒模板的檢測下限均為1.0×102拷貝/μl,擴(kuò)增效率分別為:94%和97.7%。(8)嗜水氣單胞菌的主要粘附素基因(Aeromonas hydrophila major adhesiongene,aha)被選為嗜水氣單胞菌的特異性基因。優(yōu)化的引物和探針的濃度分別為200 nmol/L和100 nmol/L。反應(yīng)體系的靈敏度和特異度均為100%。該反應(yīng)體系對純培養(yǎng)物DNA的檢測下限為1 pg/μl,對菌液的檢測下限為80 CFU/ml。對未經(jīng)增菌的人工污染糞便標(biāo)本的檢測下限為8×103 CFU/ml,增菌3小時(shí)對檢測下限沒有影響,增菌8小時(shí)和16小時(shí)后,檢測下限能達(dá)到8 CFU/ml。【結(jié)論】本研究建立了基于TaqMan探針的重要致病性弧菌的實(shí)時(shí)PCR檢測方法。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明它們具有令人滿意的靈敏度和特異度。檢測下限能達(dá)到1.0×102拷貝/μl,高于普通PCR 10-1000倍。并且雙重實(shí)時(shí)PCR能夠在一個(gè)反應(yīng)體系中同時(shí)檢測兩種菌或者兩個(gè)致病基因,大大減少了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和對試劑的消耗。因此,上述檢測方法可用于重要致病性弧菌的快速檢測及篩查,尤其是當(dāng)樣本量很大或者爆發(fā)疫情時(shí)。

王海波,王多春,闞飆,畢振強(qiáng)[10](2009)在《副溶血弧菌TaqMan雙重實(shí)時(shí)-聚合酶鏈反應(yīng)檢測方法的建立》文中研究指明目的建立副溶血弧菌TaqMan實(shí)時(shí)-PCR和毒力基因TaqMan雙重實(shí)時(shí)-PCR篩檢的實(shí)驗(yàn)室檢測方法。方法根據(jù)副溶血弧菌toxR基因的保守序列設(shè)計(jì)引物和TaqMan探針,建立檢測副溶血弧菌的實(shí)時(shí)-PCR方法;根據(jù)副溶血弧菌耐熱直接溶血素(thermostable direct hemolysin,tdh)和耐熱相關(guān)溶血素(thermostable relatedhemolysin,trh)基因的保守序列設(shè)計(jì)引物和探針,建立檢測致病性副溶血弧菌毒力基因的雙重TaqMan實(shí)時(shí)-PCR方法。對所建立的副溶血弧菌實(shí)時(shí)-PCR檢測方法進(jìn)行靈敏度和特異度評價(jià)。結(jié)果副溶血弧菌的檢測下限為102拷貝/μl,tdh和trh雙重實(shí)時(shí)PCR的檢測下限為102拷貝/μl。針對toxR基因建立的副溶血弧菌實(shí)時(shí)-PCR方法對11種其他弧菌和腸道細(xì)菌的染色體無擴(kuò)增。結(jié)論建立的方法能夠特異和敏感地檢測副溶血弧菌,并能確定致病性副溶血弧菌的毒力基因,能作為副溶血弧菌的靈敏和快速檢測方法。

二、雙重實(shí)時(shí)PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血弧菌(論文開題報(bào)告)

(1)論文研究背景及目的

此處內(nèi)容要求:

首先簡單簡介論文所研究問題的基本概念和背景,再而簡單明了地指出論文所要研究解決的具體問題,并提出你的論文準(zhǔn)備的觀點(diǎn)或解決方法。

寫法范例:

本文主要提出一款精簡64位RISC處理器存儲管理單元結(jié)構(gòu)并詳細(xì)分析其設(shè)計(jì)過程。在該MMU結(jié)構(gòu)中,TLB采用叁個(gè)分離的TLB,TLB采用基于內(nèi)容查找的相聯(lián)存儲器并行查找,支持粗粒度為64KB和細(xì)粒度為4KB兩種頁面大小,采用多級分層頁表結(jié)構(gòu)映射地址空間,并詳細(xì)論述了四級頁表轉(zhuǎn)換過程,TLB結(jié)構(gòu)組織等。該MMU結(jié)構(gòu)將作為該處理器存儲系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)的一個(gè)重要組成部分。

(2)本文研究方法

調(diào)查法:該方法是有目的、有系統(tǒng)的搜集有關(guān)研究對象的具體信息。

觀察法:用自己的感官和輔助工具直接觀察研究對象從而得到有關(guān)信息。

實(shí)驗(yàn)法:通過主支變革、控制研究對象來發(fā)現(xiàn)與確認(rèn)事物間的因果關(guān)系。

文獻(xiàn)研究法:通過調(diào)查文獻(xiàn)來獲得資料,從而全面的、正確的了解掌握研究方法。

實(shí)證研究法:依據(jù)現(xiàn)有的科學(xué)理論和實(shí)踐的需要提出設(shè)計(jì)。

定性分析法:對研究對象進(jìn)行“質(zhì)”的方面的研究,這個(gè)方法需要計(jì)算的數(shù)據(jù)較少。

定量分析法:通過具體的數(shù)字,使人們對研究對象的認(rèn)識進(jìn)一步精確化。

跨學(xué)科研究法:運(yùn)用多學(xué)科的理論、方法和成果從整體上對某一課題進(jìn)行研究。

功能分析法:這是社會科學(xué)用來分析社會現(xiàn)象的一種方法,從某一功能出發(fā)研究多個(gè)方面的影響。

模擬法:通過創(chuàng)設(shè)一個(gè)與原型相似的模型來間接研究原型某種特性的一種形容方法。

三、雙重實(shí)時(shí)PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血弧菌(論文提綱范文)

(1)基于HAND系統(tǒng)15種食源性致病菌多重實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立(論文提綱范文)

摘要
Abstract
縮略詞表
第1章 緒論
    1.1 食源性致病菌
    1.2 病原微生物常用鑒別方法
        1.2.1 傳統(tǒng)培養(yǎng)法
        1.2.2 傳統(tǒng)培養(yǎng)法的優(yōu)化
        1.2.3 免疫學(xué)檢測
        1.2.4 核酸檢測
    1.3 研究目的及意義
    1.4 技術(shù)路線
第2章 基于HAND系統(tǒng)食源性致病菌實(shí)時(shí)PCR檢測技術(shù)的建立
    2.1 材料與設(shè)備
        2.1.1 菌株及來源
        2.1.2 培養(yǎng)基和試劑
        2.1.3 主要儀器
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 菌株的培養(yǎng)和模板DNA的制備
        2.2.2 靶序列與引物
        2.2.3 單重?zé)晒舛縋CR體系的建立
        2.2.4 單重實(shí)時(shí)PCR的特異性
        2.2.5 單重實(shí)時(shí)PCR的敏感性
        2.2.6 單重實(shí)時(shí)PCR的重復(fù)性和穩(wěn)定性
        2.2.7 多重實(shí)時(shí)PCR體系的建立
        2.2.8 多重時(shí)候PCR的特異性
        2.2.9 多重實(shí)時(shí)PCR的敏感性
        2.2.10 多重實(shí)時(shí)PCR的重復(fù)性和穩(wěn)定性
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 單重?zé)晒舛縋CR體系的建立
        2.3.2 單重?zé)晒舛縋CR特異性結(jié)果
        2.3.3 單重實(shí)時(shí)PCR敏感性結(jié)果
        2.3.4 單重實(shí)時(shí)PCR重復(fù)性和穩(wěn)定性結(jié)果
        2.3.5 多重實(shí)時(shí)PCR體系的建立
        2.3.6 多重?zé)晒舛縋CR特異性結(jié)果
        2.3.7 多重?zé)晒舛縋CR敏感性結(jié)果
        2.3.8 多重?zé)晒舛縋CR重復(fù)性和穩(wěn)定性結(jié)果
    2.4 本章小結(jié)
第3章 多重實(shí)時(shí)PCR體系的玻璃化
    3.1 材料與設(shè)備
        3.1.1 菌株及來源
        3.1.2 培養(yǎng)基和試劑
        3.1.3 主要儀器
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 菌株的培養(yǎng)和模板DNA的制備
        3.2.2 反應(yīng)體系的玻璃化
        3.2.3 玻璃化試劑穩(wěn)定性
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 反應(yīng)體系的玻璃化
        3.3.2 玻璃化試劑穩(wěn)定性
    3.4 本章小結(jié)
第4章 復(fù)雜樣本的快速提取
    4.1 材料與方法
        4.1.1 菌株及來源
        4.1.2 培養(yǎng)基與試劑
        4.1.3 主要儀器
    4.2 復(fù)雜樣本快速提取方法
        4.2.1 食品模擬樣本
        4.2.2 糞便模擬標(biāo)本
    4.3 結(jié)果
    4.4 本章小結(jié)
結(jié)論
展望
創(chuàng)新點(diǎn)
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡介
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文和科研成果

(2)副溶血弧菌qPCR檢測及T6SS-1效應(yīng)因子的篩選和功能研究(論文提綱范文)

摘要
ABSTRACT
符號與縮略語
前言
第一篇 文獻(xiàn)綜述
    第一章 副溶血弧菌相關(guān)毒力因子及其致病機(jī)理
        1 副溶血弧菌的致病力及流行
        2 副溶血弧菌的檢測方法
        2.1 常規(guī)分離鑒定
        2.2 免疫學(xué)檢測方法
        2.3 分子生物學(xué)檢測方法
        3 副溶血弧菌的主要毒力因子
        3.1 溶血素
        3.2 黏附相關(guān)因子
        3.3 Ⅲ型分泌系統(tǒng)
        3.4 Ⅵ型分泌系統(tǒng)
        參考文獻(xiàn)
第二篇 試驗(yàn)研究
    第二章 副溶血弧菌與霍亂弧菌雙重?zé)晒舛縋CR快速檢測方法的建立及應(yīng)用
        1 材料與方法
        1.1 菌株與引物設(shè)計(jì)
        1.2 試劑與儀器
        1.3 雙重?zé)晒舛縋CR方法的建立
        1.4 敏感性試驗(yàn)
        1.5 特異性試驗(yàn)
        1.6 重復(fù)性試驗(yàn)
        1.7 人工染菌蝦和貝類樣品的檢測
        2 結(jié)果
        2.1 雙重?zé)晒舛縋CR擴(kuò)增
        2.2 敏感性試驗(yàn)
        2.3 特異性試驗(yàn)
        2.4 重復(fù)性試驗(yàn)
        2.5 人工染菌樣品的檢測
        3 討論
        參考文獻(xiàn)
    第三章 副溶血弧菌T6SS-1效應(yīng)蛋白的篩選與鑒定
        1 材料與方法
        1.1 菌株、質(zhì)粒和感受態(tài)細(xì)胞
        1.2 試驗(yàn)動物
        1.3 試驗(yàn)試劑與儀器
        1.4 副溶血弧菌T6SS-1分泌蛋白的提取
        1.5 上清蛋白SDS-PAGE分析
        1.6 Label-free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析
        1.7 原核表達(dá)引物設(shè)計(jì)與合成
        1.8 vp0837和vp0285基因的PCR擴(kuò)增
        1.9 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定
        1.10 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達(dá)
        1.11 重組蛋白的純化
        1.12 重組蛋白VP0837和VP0285多克隆抗體的制備
        1.13 ELISA測定表達(dá)產(chǎn)物免疫效價(jià)
        1.14 Western-blot鑒定效應(yīng)蛋白VP0837和VP0285
        2 結(jié)果
        2.1 副溶血弧菌T6SS-1分泌蛋白的SDS-PAGE分析
        2.2 Label-free鑒定和定量結(jié)果評估
        2.3 vp0837和vp0285基因的PCR擴(kuò)增
        2.4 重組表達(dá)質(zhì)粒的鑒定
        2.5 原核表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE及可溶性分析
        2.6 重組蛋白的純化
        2.7 ELISA測定表達(dá)產(chǎn)物免疫效價(jià)
        2.8 Western-blot鑒定效應(yīng)蛋白VP0837和VP0285
        3 討論
        參考文獻(xiàn)
    第四章 副溶血弧菌T6SS-1效應(yīng)蛋白vp0837基因缺失株的構(gòu)建及致病性分析
        1 材料與方法
        1.1 菌株與引物設(shè)計(jì)
        1.2 細(xì)胞及試驗(yàn)動物
        1.3 試劑與儀器
        1.4 vp0837基因缺失株的構(gòu)建
        1.5 vp0837基因互補(bǔ)株的構(gòu)建
        1.6 熒光定量PCR檢測基因轉(zhuǎn)錄水平
        1.7 遺傳穩(wěn)定性分析
        1.8 生長曲線的測定
        1.9 細(xì)菌運(yùn)動性檢測
        1.10 透射電鏡下的鞭毛結(jié)構(gòu)觀察
        1.11 不同菌株生物被膜形成能力測定
        1.12 細(xì)胞黏附與入侵能力測定
        1.13 細(xì)胞毒性測定
        1.14 細(xì)胞因子測定
        1.15 半數(shù)致死量(LD_(50))的測定
        2 結(jié)果
        2.1 vp0837基因缺失株的構(gòu)建與鑒定結(jié)果
        2.2 C△vp0837互補(bǔ)株的構(gòu)建與鑒定結(jié)果
        2.3 熒光定量PCR檢測結(jié)果
        2.4 遺傳穩(wěn)定性分析結(jié)果
        2.5 生長曲線的測定結(jié)果
        2.6 細(xì)菌運(yùn)動性檢測結(jié)果
        2.7 透射電鏡下的鞭毛結(jié)構(gòu)觀察結(jié)果
        2.8 生物被膜形成能力測定結(jié)果
        2.9 細(xì)胞黏附與入侵能力測定結(jié)果
        2.10 細(xì)胞毒性測定結(jié)果
        2.11 細(xì)胞因子測定結(jié)果
        2.12 半數(shù)致死量(LD_(50))的測定結(jié)果
        3 討論
        參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
創(chuàng)新點(diǎn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文

(3)威海地區(qū)食源性細(xì)菌的分布及病原性海洋弧菌多重降落PCR方法的建立(論文提綱范文)

摘要 abstract 引言 材料與方法
1 材料
    1.1 標(biāo)準(zhǔn)菌株及臨床菌株
    1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑
    1.3 主要實(shí)驗(yàn)溶液配制
    1.4 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2 臨床標(biāo)本采集與處理
3 細(xì)菌的分離培養(yǎng)、鑒定和藥物敏感實(shí)驗(yàn)
    3.1 標(biāo)準(zhǔn)菌株和臨床菌株的培養(yǎng)和鑒定
    3.2 臨床標(biāo)本中細(xì)菌的分離培養(yǎng)和鑒定
    3.3 細(xì)菌質(zhì)譜鑒定
    3.4 藥物敏感試驗(yàn)
4 細(xì)菌基因組DNA的提取
5 PCR引物設(shè)計(jì)
6 單一降落PCR
    6.1 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
    6.2 單一降落PCR特異性檢測
    6.3 單一降落PCR敏感性檢測
7 多重降落PCR
    7.1 PCR反應(yīng)體系的優(yōu)化
    7.2 多重降落PCR特異性檢測
    7.3 多重降落PCR敏感性檢測
8 多重降落PCR檢測臨床標(biāo)本 結(jié)果
1 威海地區(qū)食源性疾病致病菌的鑒定及分布
    1.1 細(xì)菌分離培養(yǎng)及鑒定結(jié)果
    1.2 威海地區(qū)食源性疾病致病菌的分布
    1.3 抗生素藥敏試驗(yàn)結(jié)果
2 單一降落PCR檢測結(jié)果
    2.1 單一降落PCR特異性檢測結(jié)果
    2.2 單一降落PCR敏感性檢測結(jié)果
3 多重降落PCR檢測結(jié)果
    3.1 多重降落PCR特異性檢測結(jié)果
    3.2 多重降落PCR敏感性檢測結(jié)果
4 臨床標(biāo)本驗(yàn)證結(jié)果 討論 結(jié)論 參考文獻(xiàn) 綜述
綜述參考文獻(xiàn) 攻讀學(xué)位期間的研究成果 致謝

(4)雙重DPO-PCR檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌(論文提綱范文)

1 材料與方法
    1.1 材料與儀器
    1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.2.1 基因組DNA的提取
        1.2.2 引物設(shè)計(jì)
        1.2.3 雙重DPO-PCR體系
        1.2.4 雙重DPO-PCR體系退火溫度敏感性實(shí)驗(yàn)
        1.2.5 雙重DPO-PCR體系的特異性評價(jià)
        1.2.6 雙重DPO-PCR體系的靈敏度評價(jià)
        1.2.7 雙重DPO-PCR體系檢測實(shí)際樣品
2 結(jié)果與分析
    2.1 兩種弧菌的雙重DPO-PCR檢測方法建立
    2.2 雙重DPO-PCR退火溫度敏感性實(shí)驗(yàn)
    2.3 雙重DPO-PCR體系的特異性評價(jià)
    2.4 雙重DPO-PCR體系的靈敏度評價(jià)
    2.5 雙重DPO-PCR體系對實(shí)際樣品的檢測
3 結(jié)論

(5)霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重?zé)晒釶CR檢測方法的建立(論文提綱范文)

1材料與方法
    1.1材料
    1.2方法
2結(jié)果
3討論

(7)霍亂毒素基因(ctx)和耐熱直接溶血素基因(tdh)雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立(論文提綱范文)

1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株
        1.1.2 ctx和tdh雙重引物和探針的設(shè)計(jì)
    1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.2.1 細(xì)菌染色體DNA的提取
        1.2.2 質(zhì)粒的制備
        1.2.3 實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化
        1.2.3. 1 引物濃度的優(yōu)化
        1.2.3. 2 探針濃度的優(yōu)化
        1.2.4 實(shí)時(shí)PCR的反應(yīng)條件
        1.2.4. 1 ctx和tdh基因單重實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)條件
        1.2.4. 2 ctx和tdh基因雙重實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)條件
        1.2.5 靈敏度的檢測
        1.2.6 特異度檢測
2 結(jié)果
    2.1 實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化
        2.1.1 引物濃度的優(yōu)化
        2.1.2 探針濃度的優(yōu)化
    2.2 靈敏度的檢測
        2.2.1 ctx和tdh基因單重實(shí)時(shí)PCR靈敏度
        2.2.2 ctx和tdh雙重實(shí)時(shí)PCR靈敏度
    2.3 特異度檢測
    2.4 擴(kuò)增效率
3 討論

(8)沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌同時(shí)檢測方法的研究(論文提綱范文)

摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 立題依據(jù)
        1.1.1 沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌是水產(chǎn)品中的主要致病菌
        1.1.2 致病菌的檢測現(xiàn)狀
        1.1.3 沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌的共性
    1.2 課題的研究意義和研究內(nèi)容
        1.2.1 研究意義
        1.2.2 擬解決的關(guān)鍵問題
        1.2.3 主要研究內(nèi)容
第二章 沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌共增培養(yǎng)基SVV的研制
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 儀器與試劑
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2.2 結(jié)果與討論
        2.2.1 基礎(chǔ)培養(yǎng)基的選擇
        2.2.2 抑制劑的選擇
        2.2.3 促進(jìn)劑的選擇
        2.2.4 抑制劑單因素實(shí)驗(yàn)
        2.2.5 促進(jìn)劑單因素實(shí)驗(yàn)
        2.2.6 響應(yīng)面分析優(yōu)化
    2.3 本章小結(jié)
第三章 沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌共增培養(yǎng)基SVV增菌效果的研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 儀器與試劑
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 結(jié)果與討論
        3.2.1 SVV的單獨(dú)增菌效果研究
        3.2.2 SVV的復(fù)合增菌效果研究
        3.2.3 SVV的選擇性研究
        3.2.4 競爭菌群對SVV共增效果影響研究
        3.2.5 SVV應(yīng)用于人工接種樣品
        3.2.6 SVV應(yīng)用于實(shí)際樣品
    3.3 本章小結(jié)
第四章 沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌三重?zé)晒釶CR檢測方法的建立
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 主要儀器與試劑
        4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 結(jié)果與討論
        4.2.1 DNA模板的制備
        4.2.2 PCR反應(yīng)促進(jìn)物質(zhì)的選擇
        4.2.3 引物探針組合篩選
        4.2.4 反應(yīng)體系優(yōu)化
        4.2.5 目標(biāo)菌單重?zé)晒釶CR擴(kuò)增結(jié)果
        4.2.6 目標(biāo)菌雙重?zé)晒釶CR擴(kuò)增結(jié)果
        4.2.7 目標(biāo)菌三重?zé)晒釶CR擴(kuò)增結(jié)果
        4.2.8 三重?zé)晒釶CR檢測特異性
        4.2.9 三重?zé)晒釶CR靈敏度實(shí)驗(yàn)
        4.2.10 三重?zé)晒釶CR檢測技術(shù)適用性結(jié)果
    4.3 本章小結(jié)
結(jié)論與展望
    一、結(jié)論
    二、課題創(chuàng)新性闡述
    三、展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
評定意見

(9)重要致病性弧菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立(論文提綱范文)

中文摘要
Abstract
前言
第一部分 霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測體系的建立
    前言
    一、霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立
        1.材料
        2.方法和結(jié)果
        3.討論
        4.參考文獻(xiàn)
    二、O1和O139雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立
        1.材料
        2.方法和結(jié)果
        3.討論
        4.參考文獻(xiàn)
    三、霍亂毒素基因(ctx)TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立
        1.材料
        2.方法和結(jié)果
        3.討論
        4.參考文獻(xiàn)
    四、小結(jié)
第二部分 副溶血弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測體系的建立
    前言
    一、副溶血弧菌toxR基因?qū)崟r(shí)PCR檢測方法的建立
        1.材料
        2.方法和結(jié)果
        3.討論
    二、tdh和trh雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立
        1.材料
        2.方法和結(jié)果
        3.tdh和trh雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的應(yīng)用
        4.討論
    三、小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第三部分 創(chuàng)傷弧菌和溶藻弧菌雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測體系的建立
    前言
    1.材料
    2.方法和結(jié)果
    3.討論
    4.參考文獻(xiàn)
第四部分 ctx和tdh雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測體系的建立
    前言
    1.材料
    2.方法和結(jié)果
    3.討論
    4.參考文獻(xiàn)
第五部分 嗜水氣單胞菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測體系的建立
    前言
    1.材料
    2.方法和結(jié)果
    3.討論
    4.參考文獻(xiàn)
研究總結(jié)
附錄
致謝
碩士期間發(fā)表論文情況
學(xué)位論文評閱及答辯情況表

(10)副溶血弧菌TaqMan雙重實(shí)時(shí)-聚合酶鏈反應(yīng)檢測方法的建立(論文提綱范文)

1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)菌株
    1.2 引物和探針的設(shè)計(jì)
    1.3 細(xì)菌染色體DNA的提取
    1.4 質(zhì)粒的制備
    1.5 實(shí)驗(yàn)參數(shù)的優(yōu)化
        1.5.1 引物濃度的優(yōu)化
        1.5.2 探針濃度的優(yōu)化
    1.6 實(shí)時(shí)PCR的反應(yīng)條件
        1.6.1 toxR、tdh和trh
        1.6.2 檢測tdh和trh基因的雙重實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)條件
    1.7 靈敏度的檢測
        1.7.1 單重實(shí)時(shí)PCR靈敏度的檢測
        1.7.2 tdh和trh雙重實(shí)時(shí)PCR靈敏度的檢測
    1.8 toxR檢測副溶血弧菌特異度檢測
    1.9 tdh和trh雙重實(shí)時(shí)PCR的應(yīng)用
2 結(jié)果
    2.1 實(shí)驗(yàn)參數(shù)的優(yōu)化
        2.1.1 引物濃度的優(yōu)化
        2.1.2 探針濃度的優(yōu)化
    2.2 靈敏度的檢測
    2.3 toxR檢測副溶血弧菌特異度檢測
    2.4 tdh和trh雙重實(shí)時(shí)PCR的應(yīng)用
3 討論

四、雙重實(shí)時(shí)PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血弧菌(論文參考文獻(xiàn))

  • [1]基于HAND系統(tǒng)15種食源性致病菌多重實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立[D]. 鐘宜科. 河北工程大學(xué), 2020(02)
  • [2]副溶血弧菌qPCR檢測及T6SS-1效應(yīng)因子的篩選和功能研究[D]. 凌嬌. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué), 2018(07)
  • [3]威海地區(qū)食源性細(xì)菌的分布及病原性海洋弧菌多重降落PCR方法的建立[D]. 王義濤. 青島大學(xué), 2018(01)
  • [4]雙重DPO-PCR檢測副溶血弧菌和霍亂弧菌[J]. 魏霜,馬新華,汪天杰,龍陽,紀(jì)強(qiáng),任嬌,吳希陽. 食品工業(yè)科技, 2016(22)
  • [5]霍亂弧菌和擬態(tài)弧菌雙重?zé)晒釶CR檢測方法的建立[J]. 韓輝,畢玉國,祁軍,胡群,譚緒良,吳海磊,王靜,徐寶梁. 中國國境衛(wèi)生檢疫雜志, 2015(03)
  • [6]多重實(shí)時(shí)熒光PCR法快速檢測水體中致病性弧菌的研究[J]. 周冬根,孫大為,倪敏君,王燕,張升,翟敏. 中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志, 2012(04)
  • [7]霍亂毒素基因(ctx)和耐熱直接溶血素基因(tdh)雙重TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立[J]. 韓輝,李海山,胡群,姚李四,譚緒良,賈琳. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué), 2011(18)
  • [8]沙門氏菌、副溶血弧菌和霍亂弧菌同時(shí)檢測方法的研究[D]. 覃倚瑩. 華南理工大學(xué), 2010(04)
  • [9]重要致病性弧菌TaqMan實(shí)時(shí)PCR檢測方法的建立[D]. 王海波. 山東大學(xué), 2009(06)
  • [10]副溶血弧菌TaqMan雙重實(shí)時(shí)-聚合酶鏈反應(yīng)檢測方法的建立[J]. 王海波,王多春,闞飆,畢振強(qiáng). 疾病監(jiān)測, 2009(04)

標(biāo)簽:;  ;  ;  ;  ;  

雙實(shí)時(shí)熒光定量PCR快速同時(shí)檢測霍亂弧菌和副溶血性弧菌
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