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基質(zhì)衍生因子 1 同基因多態(tài)性在人群中的分布

基質(zhì)衍生因子 1 同基因多態(tài)性在人群中的分布

一、基質(zhì)衍生因子1等基因多態(tài)性在人群中的分布(論文文獻(xiàn)綜述)

吳曉醒[1](2021)在《MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與NAFLD及H.pylori感染在CEA、CA19-9、CA72-4水平中的交互作用和利用ciMICs衍生的類器官模擬消化道腫瘤的發(fā)生》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理消化道惡性腫瘤的全球發(fā)病率占成人惡性腫瘤發(fā)病率的50%以上。消化道惡性腫瘤因早期無(wú)特異性臨床表現(xiàn),導(dǎo)致患者因消化道癥狀就診時(shí)多處于進(jìn)展期或晚期,不但影響患者治療后的生存率,并對(duì)患者生活質(zhì)量造成巨大影響。因此,有必要對(duì)消化道惡性腫瘤進(jìn)行早期篩查,以達(dá)到早診斷、早治療的目的。消化道惡性腫瘤為遺傳-環(huán)境因素相互作用,多種因素共同調(diào)控的生活方式疾病,與幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染關(guān)系密切。非酒精性脂肪肝?。∟on-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)作為代謝綜合征的肝臟表現(xiàn),可以通過(guò)影響腸道菌群、加重胰島素抵抗和脂代謝紊亂等途徑增加消化道腫瘤的患病風(fēng)險(xiǎn)。亞甲基四氫葉酸還原酶(Methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)作為葉酸代謝中的關(guān)鍵酶,對(duì)于維持氧核糖核酸DNA結(jié)構(gòu)和功能發(fā)揮著重要作用。當(dāng)MTHFR rs1801133位點(diǎn)的胞嘧啶(Cytosine,C)被胸腺嘧啶(Thymine,T)替代后會(huì)導(dǎo)致MTHFR酶活性降低從而對(duì)DNA單鏈、雙鏈穩(wěn)定性及DNA的甲基化造成影響,誘導(dǎo)消化道惡性腫瘤的發(fā)生。目前,關(guān)于MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與NAFLD和H.pylori感染的易感性及相關(guān)性研究結(jié)果并不一致,同時(shí)鮮見(jiàn)關(guān)于H.pylori感染合并NAFLD與MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與消化道腫瘤標(biāo)志物(Gastrointestinal tumor markers,GTM)關(guān)系的研究。為進(jìn)一步探索MTHFR與消化道腫瘤發(fā)生的關(guān)系,選擇符合實(shí)驗(yàn)條件的細(xì)胞系是實(shí)驗(yàn)工作的基礎(chǔ)。選擇能夠在體外實(shí)驗(yàn)中模擬疾病特征并能夠在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行驗(yàn)證的細(xì)胞系就顯得尤為重要。腸道惡性腫瘤是腸上皮干細(xì)胞(intestinal stem cells,ISCs)通過(guò)致癌基因和抑癌基因多步驟的基因突變導(dǎo)致的。2009年,Sato等通過(guò)三維(Three-dimensional,3D)培養(yǎng),利用niche因子模擬出niche微環(huán)境,成功的在體外將隱窩ISCs培養(yǎng)成腸道類器官,又被稱為迷你腸道(Mini-guts)。此后,腸道類器官技術(shù)被廣泛用于描述ISCs生物學(xué)細(xì)胞信號(hào)。然而,體外培養(yǎng)的類器官由異質(zhì)細(xì)胞群組成,而要在3D培養(yǎng)的條件下把目的基因組導(dǎo)入類器官對(duì)實(shí)驗(yàn)技術(shù)是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。因此,有必要建立一個(gè)二維(Two-dimensional,2D)的ISCs培養(yǎng)系統(tǒng)來(lái)進(jìn)行有效的基因組操作。第一部分MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和非酒精性脂肪肝與消化道腫瘤標(biāo)志物的關(guān)系及交互作用目的:(1)分析NAFLD的臨床特征;(2)了解NAFLD和MTHFR rs1801133基因多態(tài)性的關(guān)系;(3)統(tǒng)計(jì)分析MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和NAFLD與GTM:癌胚抗原(Carcinoma embryonic antigen,CEA)、糖類抗原19-9(Carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)、糖類抗原72-4(Carbohydrate antigen 72-4,CA72-4)之間的關(guān)系和交互作用。方法:1023例研究對(duì)象為2016年1月至2020年10月重慶市主城區(qū)體檢者,其中NAFLD組425例,對(duì)照組598例。采用Sanger測(cè)序法篩查MTHFR rs1801133基因多態(tài)性,電化學(xué)發(fā)光法檢查受試者的GTM:CEA、CA19-9、CA72-4。通過(guò)Logistic回歸分析NAFLD的危險(xiǎn)因素;采用卡方擬合優(yōu)度檢驗(yàn)計(jì)算MTHFR rs1801133基因多態(tài)性Hardy-Weinberg均衡;向前Logistic回歸計(jì)算優(yōu)勢(shì)比(Odds ratio,OR)和95%置信區(qū)間(Confidence interval,CI)來(lái)評(píng)估NAFLD與危險(xiǎn)因素的關(guān)系;多因子降維法(Multifactor dimensionality reduction,MDR)分析基因-環(huán)境交互作用;一般線性模型檢驗(yàn)NAFLD和MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與GTM(CEA、CA19-9和CA72-4)之間交互作用。P值<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:(1)男性的NAFLD患病率(50.7%)顯著高于女性(23.5%,P<0.001)。NAFLD組的身體質(zhì)量指數(shù)(Body mass index,BMI)26.42±2.88明顯高于對(duì)照組23.05±2.730(P<0.001),且隨著B(niǎo)MI增加,NAFLD的患病率增加(BMI<18.5體重過(guò)輕(Underweight,UW):5%;BMI18.523.9體重正常(Normal weright,NW):17.4%;BMI24.027.9體重超重(Overweight,OW):54.8%;BMI>28.0肥胖(Obesity,OB):82.4%,P<0.001)。在NAFLD組中,高血壓:舒張壓(Diastolic blood pressure,DBP)和收縮壓(Systolic Blood Pressure,SBP)升高;肝功能損害:谷酰轉(zhuǎn)移酶(Gamma-glutamyltransferase,γ-GT)、谷丙轉(zhuǎn)氨酶(Alanine aminotransferase,ALT)和天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(Aspartate aminotransferase,AST)升高;脂代謝障礙:血清總膽固醇(Serum Total cholesterol,s TC)、血清三酰甘油(Serum Triglyceride,s TG)、低密度脂蛋白膽固醇(Low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)升高,高密度脂蛋白膽固醇(High density lipoprotein cholesterol,HDL-C)降低和高嗜酸性細(xì)胞(Eosinophils,EO)血癥的患病率高于對(duì)照組(P<0.05)。NAFLD組白細(xì)胞總數(shù)(White blood cell,WBC)、紅細(xì)胞計(jì)數(shù)(Red blood cell,RBC)、血紅蛋白(Hemoglobin,Hb)和紅細(xì)胞比容(Hematocrit value,HCT)水平高于對(duì)照組(P<0.05)。NAFLD組CEA水平的中位數(shù)(P25,P75)1.90(1.20,2.90)ng/ml高于對(duì)照組的1.70(1.20,2.50)ng/ml(P=0.005);但兩組間CA19-9和CA72-4水平無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(2)NAFLD組中的T等位基因頻率(47.9%)高于C等位基因(37.5%);對(duì)照組中的C等位基因頻率(62.5%)高于T等位(52.1%,P<0.001)。NAFLD組MTHFR rs1801133基因多態(tài)性的OR值及95%CI按照TT基因型>CT基因型>CC基因型的順序依次遞減;MTHFR rs1801133基因隱性模型(TT vs.CC+CT基因型)的OR值及95%CI較MTHFR rs1801133基因顯性模型(CC vs.CT+TT基因型)更大,提示不同基因型對(duì)NAFLD的易感危險(xiǎn)度不同(P<0.05)。(3)Logistic多因素回歸分析結(jié)果為BMI、高SBP、高γ-GT、高ALT、高s TG、低HDL-C、高LDL-C、WBC、高EO及MTHFR rs1801133基因多態(tài)性是NAFLD的危險(xiǎn)因素(P<0.05)。(4)通過(guò)MDR建模分析發(fā)現(xiàn)BMI和HDL-C與NAFLD患病可能存在環(huán)境-環(huán)境交互作用;MTHFR rs1801133多態(tài)性、BMI和HDL-C與NAFLD患病可能存在基因-環(huán)境交互作用。樹(shù)狀圖提示BMI和γ-GT,MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和HDL-C均對(duì)NAFLD的發(fā)病具有協(xié)同作用,其中BMI和γ-GT的協(xié)同作用更強(qiáng)。(5)MTHFR rs1801133 TT基因型的CEA水平高于MTHFR rs1801133 CT和CC基因型,TT基因型、CT基因型和CC基因型的CEA水平呈遞減趨勢(shì);NAFLD和對(duì)照組的三種基因型CEA均值水平連線不平行,提示NAFLD和MTHFR rs1801133多態(tài)性對(duì)CEA水平升高可能具有交互作用(P=0.010)。結(jié)論:(1)NAFLD的臨床特征中肥胖、高血壓、高血脂和肝功能異常為常見(jiàn)的危險(xiǎn)因素,提示慢性代謝性疾病是NAFLD的危險(xiǎn)因素。(2)在校正相關(guān)因素后,MTHFR rs1801133基因多態(tài)性為NAFLD的易感因素,T等位基因突變會(huì)增加NAFLD患病風(fēng)險(xiǎn)。OW/OB、高γ-GT、MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和低HDL-C均對(duì)NAFLD患病具有協(xié)同作用。(3)MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與NAFLD對(duì)CEA值的升高可能具有交互作用,MTHFR rs1801133 T等位基因突變與NAFLD的共同作用可能造成CEA水平的升高。第二部分MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和幽門螺桿菌感染與消化道腫瘤標(biāo)志物之間的關(guān)系及交互作用目的:(1)了解重慶地區(qū)漢族人群中H.pylori感染的臨床特征;(2)分析重慶地區(qū)漢族人群中H.pylori感染和MTHFR rs1801133基因多態(tài)性的關(guān)系;(3)統(tǒng)計(jì)分析H.pylori感染和MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與GTM(CEA、CA19-9和CA72-4)之間的關(guān)系和交互作用。方法:研究對(duì)象共152例,其中13C-UBT陽(yáng)性組58例,13C-UBT陰性組94例,均為重慶市主城區(qū)于2016年1月至2020年10月的漢族體檢者,所有研究對(duì)象均完成碳13尿素呼氣試驗(yàn)(Carbon 13 urea breath test,13C-UBT)、MTHFR rs1801133基因多態(tài)性篩查和GTM(CEA、CA19-9、CA72-4)檢測(cè)。按照13C-UBT結(jié)果對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行分組,DOB值≥4定義為13C-UBT陽(yáng)性,既H.pylori感染;DOB值<4定義為13C-UBT陰性,既非H.pylori感染。通過(guò)卡方檢驗(yàn)分析計(jì)數(shù)資料的差異,用c2檢驗(yàn)或Fisher精確檢驗(yàn)分析計(jì)量資料的差異,分類變量的組間比較采用c2檢驗(yàn)。logistic回歸分析MTHFR rs1801133基因多態(tài)性的基因頻率。LR logistic回歸計(jì)算OR和95%CI來(lái)評(píng)估13C-UBT陽(yáng)性與危險(xiǎn)因素之間的關(guān)系。多因素方差分析方法分析MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與GTM、13C-UBT結(jié)果的交互作用。使用Bootstrap方法計(jì)算95%CI,同時(shí)采用Logistic回歸計(jì)算MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與13C-UBT陽(yáng)性危險(xiǎn)因素中的分類變量和連續(xù)變量之間的統(tǒng)計(jì)學(xué)交互作用。結(jié)果:(1)在重慶漢族人群中,男性13C-UBT陽(yáng)性率(43.4%)高于女性(26.1%,P=0.044);年齡>60歲組13C-UBT陽(yáng)性率(71.4%)顯著高于其他年齡組(年齡<40:36.4%;年齡4060:34.5%,P=0.027);13C-UBT陽(yáng)性組的CEA 2.08±1.04ng/ml、CA72-4 3.70(1.60,5.93)U/ml和WBC6.00±1.34 10^9/L水平高于13C-UBT陰性組(CEA:1.69±0.74ng/ml,P=0.008;CA72-4:2.10(1.08,4.23)U/ml,P=0.004;WBC:5.54±1.42 10^9/L,P=0.045);MTHFR rs1801133基因隱性模型(TT vs.CC+CT)中TT基因型(57.7%)的13C-UBT陽(yáng)性率高于CC+CT基因型(34.1%,P=0.028)。(2)Logistic回歸分析為CEA、CA72-4和MTHFR rs1801133隱性模型(TT vs.CC+CT基因型)是重慶漢族人群13C-UBT陽(yáng)性的危險(xiǎn)因素(P<0.05)。(3)通過(guò)分析MTHFR rs1801133多態(tài)性與CEA對(duì)13C-UBT結(jié)果的相加交互作用,發(fā)現(xiàn)MTHFR rs1801133多態(tài)性與CEA水平存在負(fù)相相加交互作用(P=0.026)。交互作用相對(duì)超額危險(xiǎn)度(Relative excess risk of interaction,RERI)為-1.407(95%CI=-3.737-0.277),協(xié)同指數(shù)(Synergy index,S)為0.468(95%CI=0.0720.910),歸因比(Attributable proportion,AP)為63.1%(95%CI=-1.941-0.079)。(4)校正其他影響因素后,男性CEA水平(2.13±0.11 ng/ml)顯著高于女性(1.66±0.14 ng/ml,P=0.002);年齡>60歲組CEA水平(2.41±0.22 ng/ml)顯著高于其他各組(年齡<40:1.51±0.18 ng/ml;年齡4060:1.78±0.09,P=0.009)。13C-UBT陽(yáng)性時(shí),T等位基因出現(xiàn)CEA水平下降;13C-UBT陰性時(shí),T等位基因出現(xiàn)CEA水平上升,MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與13C-UBT結(jié)果在CEA水平上存在交互作用(P=0.004)。女性CA19-9水平(15.63±2.30 U/ml)顯著高于男性(9.25±1.84U/ml,P=0.010)。13C-UBT陽(yáng)性組CA72-4水平(5.85±0.93U/ml)顯著高于陰性組(3.18±0.92 U/ml,P=0.020)。結(jié)論:(1)重慶地區(qū)漢族人群中H.pylori感染與性別和年齡有關(guān),男性比女性感染H.pylori的機(jī)會(huì)更大;隨著年齡的增加,H.pylori感染率增加。同時(shí),H.pylori感染會(huì)導(dǎo)致CEA、CA72-4和WBC水平升高。(2)MTHFR rs1801133基因多態(tài)性可能是重慶地區(qū)漢族人群H.pylori感染的易感因素。MTHFR rs1801133 TT基因型會(huì)增加重慶地區(qū)漢族人群的H.pylori感染風(fēng)險(xiǎn)。(3)MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與CEA水平在H.pylori感染時(shí)呈負(fù)相相加交互作用,提示不同基因型感染H.pylori會(huì)導(dǎo)致不同程度的CEA升高。MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與13C-UBT結(jié)果在CEA水平上存在統(tǒng)計(jì)學(xué)交互作用。第三部分MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和幽門螺桿菌感染合并非酒精性脂肪肝與消化道腫瘤標(biāo)志物之間的關(guān)系及交互作用目的:(1)了解H.pylori感染和H.pylori感染合并NAFLD的臨床特征;(2)分析H.pylori感染和H.pylori感染合并NAFLD與MTHFR rs1801133基因多態(tài)性之間的關(guān)系;(3)統(tǒng)計(jì)分析H.pylori感染和H.pylori感染合并NAFLD及MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與GTM(CEA、CA19-9和CA72-4)之間的關(guān)系和交互作用。MDR建模分析H.pylori感染人群中MTHFR rs1801133基因隱性模型(TT vs.CC+CT基因型)與NAFLD對(duì)于GTM水平異常的交互作用。方法:研究對(duì)象共130例,其中對(duì)照組(無(wú)H.pylori感染和NAFLD)72例、疾病1組(H.pylori感染組)30例和疾病2組(H.pylori感染+NAFLD組)28例。所有研究對(duì)象均完成13C-UBT、腹部彩超、CEA、CA19-9和CA72-4等檢查。計(jì)量資料采用t檢驗(yàn)或秩和檢驗(yàn)進(jìn)行分析;計(jì)數(shù)資料采用c2檢驗(yàn)或Fisher精確檢驗(yàn)進(jìn)行分析;采用方差分析對(duì)計(jì)量和計(jì)數(shù)資料的趨勢(shì)進(jìn)行分析。有序Loistic回歸分析三組間的MTHFR rs1801133基因多態(tài)性分布情況。單因素和多因素Logistic回歸分析人體學(xué)指標(biāo)、血生化檢查及MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與疾病相關(guān)性,其中多變量Logistic回歸采用逐步法篩選變量。三組間的差異和交互作用采用方差分析。MDR建模分析基因-環(huán)境交互作用。結(jié)果:(1)疾病1組和疾病2組與對(duì)照組相比BMI值、血壓(DBP和SBP)、CEA、CA72-4、γ-GT、ALT、s TG和WBC水平升高,HDL-C水平下降(P<0.05)。疾病2組中的BMI值、血壓(DBP和SBP)、CA72-4、γ-GT、ALT、s TG和WBC升高水平及HDL-C降低水平要顯著大于疾病1組(P<0.05)。(2)不同MTHFR rs1801133基因型對(duì)于H.pylori感染和NAFLD的易感危險(xiǎn)度不同,呈現(xiàn)TT基因型>CT基因型>CC基因型的趨勢(shì)。(3)通過(guò)Logistic單因素和多因素回歸分析發(fā)現(xiàn)SBP、CEA、CA72-4、WBC水平和MTHFR rs1801133基因隱性模型(TT vs.CC+CT基因型)是H.pylori感染和H.pylori感染合并NAFLD的危險(xiǎn)因素(P<0.05)。(4)校正其他因素影響后,三組間的CEA、CA72-4水平具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);不同基因型的CA72-4水平也具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),隨著MTHFR rs1801133 T等位基因的突變,CA72-4水平也相應(yīng)升高(P=0.003)。對(duì)照組、疾病1組和疾病2組與MTHFR rs1801133基因多態(tài)性在CEA(P=0.028)及CA72-4(P<0.001)水平上存在交互作用。疾病2組中MTHFR rs1801133 TT基因型的CEA和CA72-4水平顯著高于對(duì)照組和疾病1組的其他基因型組合。WBC水平隨著CA19-9、CA72-4水平的升高而呈現(xiàn)上升趨勢(shì)(P<0.05)。(5)MDR分析顯示三維模型(MTHFR rs1801133基因隱性模型,NAFLD,WBC)為最佳模型。MTHFR rs1801133基因隱性模型(TT vs.CC+CT基因型)和二維模型(MTHFR rs1801133基因隱性模型,NAFLD)為高效模型。提示MTHFR rs1801133 TT基因型與MTHFR rs1801133CC+CT基因型對(duì)CA72-4水平升高具有基因交互作用;二維和三維模型中MTHFR rs1801133基因隱性模型與NAFLD、WBC具有基因-環(huán)境交互作用。樹(shù)狀圖提示MTHFR rs1801133基因隱性模型和NAFLD對(duì)CA72-4水平升高的協(xié)同作用更強(qiáng)。結(jié)論:(1)H.pylori感染可能會(huì)影響肝臟脂代謝能力;炎癥反應(yīng)與H.pylori感染關(guān)系密切,并可能對(duì)NAFLD的發(fā)生發(fā)展產(chǎn)生影響。(2)MTHFR rs1801133 T等位基因突變是H.pylori感染和H.pylori感染合并NAFLD的易感因素,MTHFR rs1801133 TT基因型罹患兩種疾病的風(fēng)險(xiǎn)更高。(3)不同疾病組與MTHFR rs1801133基因多態(tài)性在CEA及CA72-4水平上存在交互作用。MTHFR rs1801133 T等位基因的突變不但會(huì)增加H.pylori感染和NAFLD患病風(fēng)險(xiǎn),還可能在患病后對(duì)CEA和CA72-4水平的升高造成影響。(4)H.pylori感染人群中由于MTHFR rs1801133基因型的不同、是否合并NAFLD和炎癥反應(yīng)情況會(huì)對(duì)CA72-4水平升高造成不同的影響。其中,MTHFR rs1801133 TT基因型和合并NAFLD對(duì)于H.pylori感染人群CA72-4水平升高的協(xié)同作用最為明顯。第四部分利用條件永生化小鼠腸隱窩細(xì)胞(ci MICs)衍生的類器官模擬消化道腫瘤的發(fā)生目的:(1)建立條件永生化小鼠腸隱窩細(xì)胞(Conditionally immortalized mouse intestinal crypt cells,ci MICs)系;(2)驗(yàn)證ci MICs的生物學(xué)特征,及3D培養(yǎng)條件下能否繼續(xù)保持形成腸道類器官的能力;(3)將活化的致癌基因?qū)隿i MICs,完成消化道腫瘤建模,并在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中驗(yàn)證其致瘤性,病理學(xué)和組織學(xué)特征。方法:利用piggy Bac轉(zhuǎn)座子為基礎(chǔ)的SV40 T抗原表達(dá)系統(tǒng),建立ci MICs系。驗(yàn)證ci MICs生物學(xué)特征及增殖能力。將2D條件培養(yǎng)的ci MICs繼續(xù)在3D條件下進(jìn)行培養(yǎng),驗(yàn)證是否能形成腸上皮結(jié)構(gòu)的Mini-guts或隱窩類器官。通過(guò)在piggy Bac載體中構(gòu)建了一個(gè)缺失N端破壞結(jié)構(gòu)域的組成型激活突變?chǔ)?catenin和KRASG12D共同點(diǎn)突變。利用這些載體,我們構(gòu)建5個(gè)穩(wěn)定的ci MICs系。結(jié)果:(1)原代小鼠小腸隱窩(mouse intestinal crypts,MICs)經(jīng)過(guò)p MPH86載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞,并在Ad PBase高效感染細(xì)胞后用潮霉素(Hygromycin,Hyg)進(jìn)行篩選,獲得穩(wěn)定的轉(zhuǎn)座子和可以傳代的永生化細(xì)胞。(2)ciMICs缺乏間質(zhì)來(lái)源的細(xì)胞,可以在2D培養(yǎng)條件下保持長(zhǎng)期的增殖活性,并保留了腸上皮干細(xì)胞的生物學(xué)特性。(3)3D培養(yǎng)條件下ci MICs可以高效的衍生出腸道類器官,并且與APCmin+/-小鼠衍生的類器官有許多相似之處。(4)通過(guò)載體構(gòu)建了穩(wěn)定的細(xì)胞株,分別為:ci MIC-FGL(表達(dá)螢火蟲(chóng)熒光素酶、GFP和Lac Z)、ci MIC-紅色熒光蛋白(Red Fluorescent Proteins,RFP)(表達(dá)RFP)、ci MIC-mut BC(表達(dá)活性突變?chǔ)?catenin)、ci MIC-mut KRAS(表達(dá)突變KRAS)和ci MIC-mut BC/KRAS(同時(shí)表達(dá)突變?chǔ)?catenin和突變KRAS)。在3D培養(yǎng)條件下,ci MICs、ci MIC-mut BC、ci MIC-mut KRAS、ci MIC-mut BC/KRAS均形成了相似效率的腸道類器官結(jié)構(gòu)。(5)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中,和PBS混合的ci MIC-FGL和ci MIC-mut BC注射部位均未形成質(zhì)量塊;ci MIC-FGL/PBS注射部位的生物發(fā)光信號(hào)持續(xù)2周,7周后未能檢測(cè)到生物發(fā)光信號(hào)。ci MIC-mut BC和ci MIC-mut KRAS與ENR培養(yǎng)基或者M(jìn)atrigel混合后在裸鼠皮下均可成瘤。從ci MIC-mut BC/ENR注射部位很容易獲得瘤體,而與Matrigel混合的ci MIC-FGL/Matrigel注射部位只能獲得小質(zhì)量瘤體。ci MIC-FGL/ENR培養(yǎng)基注射部位未檢測(cè)到瘤體。(6)模擬腸道腫瘤發(fā)生模型實(shí)驗(yàn)中,ci MIC-mut BC和ci MIC-mut KRAS注射組的瘤體表現(xiàn)出高增殖、腸腺瘤樣的病理和組織學(xué)特征。結(jié)論:(1)利用piggyBac轉(zhuǎn)座子為基礎(chǔ)的SV40 T抗原表達(dá)系統(tǒng),可以有效地建立ci MIC細(xì)胞系。但SV40 T抗原介導(dǎo)的原代MICs的永生化是有條件的,這些細(xì)胞的長(zhǎng)期維持仍然需要ENR培養(yǎng)基中存在小腸干細(xì)胞niche因子。(2)ciMICs保留腸上皮干細(xì)胞的生物學(xué)特性,并能在3D培養(yǎng)條件下形成腸道類器官(Mini-guts)。(3)ciMIC細(xì)胞系不具有致瘤性,但在導(dǎo)入過(guò)表達(dá)致癌基因后會(huì)表現(xiàn)出高增殖活性,并在體內(nèi)發(fā)展出腸腺瘤樣病理和組織學(xué)特征。

肖琪,普彥淞,都慶國(guó),段降龍,李曉帆,楊妮,薛飛[2](2021)在《SDF-1α基因多態(tài)性與西北地區(qū)漢族人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究》文中研究說(shuō)明目的探討SDF-1α基因3’非翻譯區(qū)801位點(diǎn)A等位基因(rs1801157,SDF-1α G801A)多態(tài)性與西北地區(qū)漢族人群胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是否存在顯著相關(guān)性。方法收集2016年6月至2018年7月陜西省人民醫(yī)院收治的胃癌患者131例和健康對(duì)照者76名,均為漢族。分析研究對(duì)象的臨床病理資料,通過(guò)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性檢測(cè)技術(shù),利用MspⅠ限制酶酶切PCR擴(kuò)增SDF-1基因801位點(diǎn)附近DNA片段,分析檢測(cè)外周血SDF-1α G801A位點(diǎn)的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。結(jié)果 SDF-1α G801A與胃癌的發(fā)病有明顯相關(guān)性,G/G基因型(P=0.002,OR=0.40,95% CI:0.22~0.71)與G/A(P=0.002,OR=2.52,95% CI:1.41~4.52)與胃癌的易感性顯著相關(guān)。進(jìn)一步分層分析發(fā)現(xiàn),SDF-1α G/A突變?nèi)巳涸诟腥居拈T螺桿菌情況下其胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著增加(P<0.05)。結(jié)論 SDF-1α G801A基因多態(tài)性與西北地區(qū)漢族人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)明顯相關(guān),特別是感染幽門螺桿菌的G/A基因型人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著增加。

陳銀娟[3](2021)在《基質(zhì)金屬蛋白酶-1、2水平及基因多態(tài)性在急性腦梗死表達(dá)及對(duì)預(yù)后的影響》文中指出[目的]探討基質(zhì)金屬蛋白酶-1、2(MMPs-1、2)水平及基因多態(tài)性及基因交互作用對(duì)急性腦梗死及預(yù)后的影響。[方法]連續(xù)收集了急性期腦梗死患者332例,同期體檢中心263例體檢者作為健康對(duì)照組;根據(jù)改良Rankin量表(m RS)評(píng)分,將腦梗死組患者分為90天預(yù)后良好組(m RS≤2分)和預(yù)后不良組(m RS>2分)兩組。采用酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測(cè)入組病例的血漿MMPs-1、2水平,使用飛行質(zhì)譜法檢測(cè)入組病例的MMP-1:rs1799750、MMP-2:rs243865、rs2285053、rs2241145的4個(gè)單核苷酸基因位點(diǎn)。使用廣義多因子降維(GMDR)Beta V0.7軟件分析基因交互作用在腦梗死患者中作用。Logistic回歸分析腦梗死發(fā)生的危險(xiǎn)因素。[結(jié)果]1、吸煙、飲酒在腦梗死組和健康對(duì)照組間沒(méi)有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。但腦梗死組中男性發(fā)病率更高。腦梗死組的年齡、高血壓、糖尿病、總膽固醇、低密度脂蛋白、同型半胱氨酸、MMP-1、MMP-2表達(dá)水平均高于對(duì)照組,差異顯著,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);腦梗死組的高密度脂蛋白低于對(duì)照組,差異顯著,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。甘油三酯和尿酸在兩組人群之間沒(méi)有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。2、MMP-2:rs243865基因多態(tài)性在腦梗死組及對(duì)照組之間差異顯著,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),而MMP-1:rs1799750、MMP-2:rs2285053、rs2241145三個(gè)基因位點(diǎn)多態(tài)性在兩組間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。3、經(jīng)Logistic回歸分析表明,年齡、高血壓、糖尿病和總膽固醇、低密度脂蛋白、MMP-1水平、MMP-2水平為腦梗死發(fā)生的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(P<0.05)。MMP-2 rs243865 T位點(diǎn)的突變與疾病正相關(guān),與無(wú)突變的CC型相比,CT型腦梗死發(fā)生的增加,其OR(95%CI)為1.328(0.086-1.347),但是沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);與無(wú)突變的CC型相比,TT型腦梗死發(fā)生的增加,OR(95%CI)為5.162(1.113-23.951),有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。4、經(jīng)GMDR分析表明,腦梗死中rs243865與rs1799750基因交互模型為腦梗死易感性最佳組合,其交叉檢驗(yàn)一致性為10/10,樣本檢驗(yàn)精確度為54.34%,符合檢驗(yàn)值P=0.0107,且增加腦梗死的發(fā)生(OR:1.591,95%CI:1.351-1.994)。5、腦梗死90天隨訪預(yù)后不良組患者入院時(shí)血清MMP-1水平和血清MMP-2水平明顯高于預(yù)后良好組患者,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);經(jīng)Logistic回歸分析表明,腦梗死急性期MMP-1水平(OR:7.198,95%CI:2.541-20.391)、MMP-2水平(OR:13.335,95%CI:5.353-33.219)是腦梗死患者90天不良預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。[結(jié)論]腦梗死急性期血漿MMP-1、MMP-2表達(dá)水平升高,且與腦梗死90天預(yù)后相關(guān);MMP-2 rs243865 C→T位點(diǎn)的突變致腦梗死易感性增強(qiáng),與MMP-1rs1799750交互作用顯著增加腦梗死發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。

傅伯論[4](2021)在《DPP4基因多態(tài)性與血脂及2型糖尿病合并冠心病的相關(guān)性研究》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理背景:近年來(lái),隨著全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的開(kāi)展,人們發(fā)現(xiàn)了一些基因單核苷酸多態(tài)性(SNPs)與人群中動(dòng)脈粥樣硬化發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。動(dòng)脈粥樣硬化疾病的發(fā)生由環(huán)境因素和遺傳因素共同決定,且多呈復(fù)雜性遺傳模式。二肽基肽酶-4(DPP4)在動(dòng)脈粥樣硬化疾病中扮演著重要參與者,目前研究表明冠心病的主要病理機(jī)制就是動(dòng)脈粥樣硬化,2型糖尿?。═2DM)是冠心?。–AD)的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,T2DM遠(yuǎn)期并發(fā)癥及死亡風(fēng)險(xiǎn)主要為心血管疾病,因此開(kāi)展DPP4基因多態(tài)性研究有助于進(jìn)一步了解DPP4在動(dòng)脈粥樣硬化中的作用,對(duì)開(kāi)發(fā)DPP4抑制劑及其他相關(guān)藥物有重要指導(dǎo)意義。目的:探究DPP4基因中的3個(gè)位點(diǎn)的(rs3788979、rs4664443、rs13015258)S NPs對(duì)血脂水平的影響,以及DPP4基因多態(tài)性與T2DM合并CAD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。方法:收集2019年1月~2019年12月在湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬東風(fēng)總醫(yī)院心內(nèi)科274例患者,分為對(duì)照組(無(wú)T2DM和CAD)152例和病例組(T2DM合并CAD)122例。研究DPP4基因中的3個(gè)位點(diǎn)(rs3788979、rs4664443、rs13015258)的SNPs在兩組中的基因型及等位基因分布差異,通過(guò)校正年齡、性別、吸煙、體質(zhì)量指數(shù)(BMI)等混雜因素采用logistic回歸分析DPP4基因多態(tài)性與T2DM合并CAD患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。結(jié)果:1.病例組與對(duì)照組的血脂水平比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,病例組載脂蛋白B/載脂蛋白A1(ApoB/Apo A1)水平明顯高于對(duì)照組(P<0.001),病例組載脂蛋白A1(Apo A1)、總膽固醇(TC)、低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)比對(duì)照組有更低水平(P<0.001)。2.病例組與對(duì)照組DPP4基因中三個(gè)位點(diǎn)SNP分布均符合哈迪-溫伯格平衡平衡(rs3788989χ2=0.026,P=0.871;rs4664443χ2=0.026,P=0.871;rs13015258χ2=0.596,P=0.742)。病例組與對(duì)照組DPP4基因型以及等位基因頻率分布無(wú)差異(P>0.05)。在對(duì)照組中DPP4基因rs3788979位點(diǎn)A等位基因突變者的血清ApoB(P=0.038)和ApoB/A1(P=0.040)水平低于非A等位基因攜帶者,在男性中這種差異更加明顯。DPP4基因rs13015258位點(diǎn)基因型TT比基因型GT有更高ApoB(P=0.006)、ApoB/A1(P=0.023)水平,基因型GG比基因型GT有更高ApoB/A1(P=0.039)水平。3.DPP4基因三個(gè)位點(diǎn)SNP基因型未發(fā)現(xiàn)與T2DM合并CAD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(P>0.05)。結(jié)論:DPP4基因rs3788979位點(diǎn)A等位基因突變降低了ApoB、ApoB/A1水平,但在納入年齡、性別、吸煙、BMI等混雜因素采用logistic回歸對(duì)加性、顯性、隱性、過(guò)顯性遺傳模型分析時(shí),T2DM合并CAD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)并未降低。

王立立[5](2021)在《中國(guó)高血壓患者醛固酮合成酶基因多態(tài)性與心血管疾病的相關(guān)性研究》文中認(rèn)為全球每年因身患或由其他疾病而引發(fā)的由心血管疾病導(dǎo)致的死亡人數(shù)大約1800萬(wàn)人,占全球死亡人數(shù)死亡率的31%,這種現(xiàn)象在我國(guó)尤為突出,心血管疾病死亡可高達(dá)中國(guó)居民因所有疾病死亡率的40%以上,并且其患病率和病死率仍趨于逐年增加的趨勢(shì)。全世界每年約有940萬(wàn)人死于原發(fā)性高血壓(Essential Hypertension,EH),這是造成全球疾病負(fù)擔(dān)的三大風(fēng)險(xiǎn)因素之一,EH顯然已成為我國(guó)心血管疾病發(fā)生及發(fā)展的重要危險(xiǎn)因素之一,包括缺血性心臟疾病和中風(fēng),更為嚴(yán)重的是其患病率正逐年呈顯出快速增長(zhǎng)的趨勢(shì),且患病人群逐漸趨于向年輕化發(fā)展。據(jù)《中國(guó)心血管病報(bào)告2017》統(tǒng)計(jì),我國(guó)已知的EH患者人數(shù)已達(dá)到2.7億人,全球EH患者人數(shù)超過(guò)11億,EH患病率約為20%,而且EH患者人數(shù)還有加快上升的趨勢(shì),并且高EH也越來(lái)越成為促使心血管疾病發(fā)生的重要危險(xiǎn)因素之一。血壓受個(gè)體活動(dòng)、姿勢(shì)、精神壓力及藥物等因素的影響,且是動(dòng)態(tài)變化的;因EH患者的基因特征呈現(xiàn)出相對(duì)穩(wěn)定性;因此人們推測(cè)可通過(guò)監(jiān)測(cè)EH患者基因型,探討其與心血管事件發(fā)生的相關(guān)性顯得更加重要。醛固酮作為人體內(nèi)一種重要的鹽皮質(zhì)激素,由腎上腺皮質(zhì)球狀帶細(xì)胞分泌,作用于鹽皮質(zhì)激素受體(MR),其水平升高后將致使EH發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及EH相關(guān)的靶器官損害明顯增加。醛固酮合成酶(CYP11B2)是由醛固酮合成酶基因-細(xì)胞色素P(CYP)(CYP11B2)編碼,是體內(nèi)調(diào)節(jié)腎上腺皮質(zhì)球狀帶細(xì)胞合成醛固酮最后一步生化反應(yīng)的催化酶,在醛固酮生物合成中起著舉足輕重的作用。CYP11B2基因3個(gè)多態(tài)性變異與EH和心血管疾病密切相關(guān)。而備受關(guān)注的CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性位于啟動(dòng)子區(qū)域(rs1799998),類固醇合成轉(zhuǎn)錄因子1(SF-1)結(jié)合位點(diǎn)胞嘧啶與胸腺嘧啶發(fā)生互換,影響該基因的轉(zhuǎn)錄活性,從而調(diào)節(jié)酶的生成。有關(guān)研究證實(shí)在普通人群中CYP11B2基因多態(tài)性能夠促使心血管疾病的發(fā)生,然而并不能夠解釋該多態(tài)性與心血管疾病的相關(guān)性是否在EH患者中也存在;此外,在不同種族人群中,CYP11B2等位基因頻率分布和心血管疾病的發(fā)生存在差異,然而研究結(jié)果可能并不能直接應(yīng)用于中國(guó)人群。本研究以中國(guó)EH患者為研究對(duì)象,研究中國(guó)EH患者中CYP11B2基因各基因型以及等位基因的出現(xiàn)頻率,并比較與其他國(guó)家人群基因型及等位基因頻率的差異,同時(shí)探究CYP11B2基因多態(tài)性與中國(guó)EH患者發(fā)生心血管事件之間的關(guān)系,此外進(jìn)一步探討了CYP11B2基因多態(tài)性與老年EH患者左心室肥厚(Left Ventricular Hypertrophy,LVF)、心房纖顫(Atrial Fibrillation,AF)等相關(guān)常見(jiàn)心血管疾病發(fā)生的相關(guān)性,以及其對(duì)降EH藥物使用療效的影響,為中國(guó)EH患者臨床治療中減少心血管事件的發(fā)生提供理論依據(jù)及指導(dǎo)意義。第一部分醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與中國(guó)高血壓患者心腦血管事件的關(guān)系研究目的:CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性與EH患者心腦血管事件發(fā)生的相關(guān)性研究所得結(jié)論不一致。在健康個(gè)體中-344C/T等位基因頻率和心腦血管疾病發(fā)病率在不同種族間存在差異,因此這些研究結(jié)果可能不適用于中國(guó)人群。此外,研究大多數(shù)都是在健康人群中進(jìn)行的,至少在一定程度上無(wú)法證明EH患者的基因相關(guān)性。因此,對(duì)于-344C/T的等位基因是否影響EH患者心腦血管疾病的發(fā)病率,需要在基于EH患者的隊(duì)列研究中得到證實(shí)。因此-344C等位基因是否影響中國(guó)EH患者心腦血管疾病的發(fā)病率尚不清楚,需要進(jìn)行探究。方法:本研究通過(guò)對(duì)2004年6月至2006年5月在河北省人民醫(yī)院和首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院連續(xù)招募的820例在門診確診為EH的患者作為研究對(duì)象,進(jìn)行臨床調(diào)查:(1)應(yīng)用Taq Man real-time PCR的方法檢測(cè)所有患者CYP11B2基因分型;(2)對(duì)所有研究對(duì)象進(jìn)行11年隨訪,記錄主要不良心血管事件(MACEs),包括卒中、冠狀動(dòng)脈疾?。–oronary Artery Disease,CAD)和冠狀動(dòng)脈疾病死亡以及心血管事件發(fā)生情況;(3)采用已建立的心血管危險(xiǎn)因素調(diào)整多變量進(jìn)行Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型分析,數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果:1.研究對(duì)象的一般臨床資料:本項(xiàng)研究共納入820例EH患者,其中65例EH患者因失訪而被排除。其余755例EH患者中,男性399例,女性356例,年齡60.52±12.61歲。2.研究對(duì)象CYP11B2基因型分型結(jié)果:T等位基因純合型(TT基因型)282例(37.4%);雜合型(CT基因型)361例(47.8%),C等位基因純合型(CC基因型)112例(14.8%)。各組間年齡和性別比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。與CYP11B2基因型沒(méi)有進(jìn)一步的顯著相關(guān)性。3.心血管事件發(fā)生情況:在平均7.60±1.12年的隨訪期后,CYP11B2基因CC基因型患者的MACEs事件發(fā)生率明顯高于CT和TT基因型患者。4.危險(xiǎn)因素風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估:CYP11B2基因CC變異是MACEs事件、CAD、卒中疾病發(fā)生的顯著且獨(dú)立的預(yù)測(cè)因子。小結(jié):CYP11B2-344 CC基因型是EH患者發(fā)生CAD和腦卒中的危險(xiǎn)因素,獨(dú)立于中國(guó)EH患者已有的其他心血管危險(xiǎn)因素,可作為EH患者心血管事件的危險(xiǎn)預(yù)測(cè)因子,但對(duì)該基因型變異的機(jī)制需進(jìn)一步研究。第二部分醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與老年原發(fā)性高血壓患者左心室肥厚的相關(guān)性研究目的:本部分研究通過(guò)對(duì)CYP11B2基因-344C/T位點(diǎn)與老年EH并發(fā)LVH患者進(jìn)行相關(guān)性分析,探討此位點(diǎn)變異基因型與LVH的關(guān)系,為中國(guó)EH并發(fā)LVH患者的診治提供理論依據(jù)。方法:選取2015年4月~2016年10月在河北省人民醫(yī)院心內(nèi)科及首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院心內(nèi)科門診確診的老年EH患者434例,所有入選患者詳細(xì)詢問(wèn)病史、體檢并完成各項(xiàng)相關(guān)檢查:血壓、身高和體質(zhì)量檢測(cè),計(jì)算體體重指數(shù)(BMI)、心電圖檢查、超聲心動(dòng)圖檢查、血常規(guī)、尿常規(guī)及生化檢查、CYP11B2基因多態(tài)性檢測(cè),采用多元逐步回歸分析基因與LVH的相關(guān)性。使用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。結(jié)果:1.研究對(duì)象的一般臨床資料:本研究共納入研究者434例,其中男性171例,女性263例,平均年齡65.32±4.32歲。2.研究對(duì)象CYP11B2基因型分型結(jié)果:進(jìn)行基因分型后,3種基因型患者的基因位點(diǎn)分布:TT、CT、CC 3種基因型分別為149例(34.3%)、232例(53.5%)、53例(12.2%)。T等位基因60.9%,C等位基因39.1%。3種基因型患者一般資料比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。3.多元逐步回歸分析:-344C/T位點(diǎn)CC基因型患者的LVPWT、LVM及LVMI顯著高于CT和TT基因型患者[(11.46±0.97)mm vs.(10.01±0.95)mm、(10.18±0.89)mm,P=0.000,(95.39±20.76)g/m2 vs.(84.73±12.68)g/m2、(79.81±14.53)g/m2,P=0.000,(174.69±31.27)g vs.(151.85±16.24)g、(146.08±19.08)g,P=0.007]。多元逐步回歸分析顯示,校正年齡、性別、服用降壓藥物種類、BMI、吸煙史、飲酒史、TG、TC、LDL-C、HDL-C、心率、血壓及空腹血糖后,-344C/T型與LVMI密切相關(guān)(P<0.001)。4.心血管事件發(fā)生及死亡隨訪情況比較:在3.60±1.12年的隨訪期后,CYP11B2基因CC基因型患者的MACEs發(fā)生率明顯高于CT和TT基因型患者。小結(jié):CYP11B2基因-344C/T存在基因多態(tài)性,C等位基因可能是EH患者LVH發(fā)生的獨(dú)立危險(xiǎn)因素;中國(guó)老年EH攜帶CC基因型患者發(fā)生MACEs及死亡的風(fēng)險(xiǎn)較高,可能與EH患者CC基因型患者發(fā)生LVH有關(guān)聯(lián)性。第三部分醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與中國(guó)高血壓患者房顫關(guān)系研究目的:目前CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性與AF的相關(guān)性報(bào)道尤其是其在EH患者中的相關(guān)性研究報(bào)道較少,且研究結(jié)果不一致,并且這些基因型頻率也明顯受到種族、性別、環(huán)境等外界因素的影響而導(dǎo)致其出現(xiàn)差異性,在本部分研究中,我們將探索評(píng)估中國(guó)人群EH患者中AF與CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性是否存在相關(guān)性,從而為AF及EH個(gè)體的遺傳易感性和藥物反應(yīng)性差異提供分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)。方法:連續(xù)招募河北省人民醫(yī)院及首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院2017年5月至2020年11月心內(nèi)科門診和病房收治的310例有AF記錄的EH和相匹配的無(wú)AF病史的EH患者310例(對(duì)于每個(gè)病例患者,在同一時(shí)期內(nèi)選擇一個(gè)匹配的沒(méi)有AF的EH患者作為對(duì)照)。兩組患者是獨(dú)立的,性別和年齡相匹配,年齡差異均不超過(guò)5歲。本研究對(duì)所有受試者詳細(xì)詢問(wèn)病史、進(jìn)行體格檢查并完成各項(xiàng)相關(guān)檢查:血壓、身高和體體重指數(shù)檢測(cè),計(jì)算體重指數(shù)(BMI);行M型超聲心動(dòng)圖和二維經(jīng)胸超聲心動(dòng)圖測(cè)量左房和左室尺寸,采用Simpson法評(píng)定左心室射血分?jǐn)?shù)(Left Ventricular Ejection Fraction,LVEF),并根據(jù)超聲心動(dòng)圖參數(shù)和Devereux公式計(jì)算LVMI;采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)CYP11B2基因多態(tài)性確定基因分型,采用多元逐步回歸分析基因型與LVH的相關(guān)性;Logistic回歸分析AF危險(xiǎn)因素;使用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。結(jié)果:1.研究對(duì)象的一般臨床資料:本研究實(shí)驗(yàn)組(EH合并AF)患者310例,其中男性158例,女性152例,平均年齡61.9±9.8歲;對(duì)照組(EH非AF)患者310例,其中男性158例,女性152例,平均年齡61.5±9.6歲。兩組患者在年齡、血壓、性別分布、糖尿病發(fā)生率、吸煙飲酒生活習(xí)慣等方面差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。AF患者的LAD明顯大于對(duì)照組(P<0.001)。同樣,AF患者IVS、LVEDD大小和LVMI也顯著高于對(duì)照組(P<0.001)。兩組LVPW、LVEF差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。2.研究對(duì)象CYP11B2基因型分型結(jié)果:進(jìn)行基因分型后3種基因型(TT、TC和CC)在實(shí)驗(yàn)組患者中的分布分別為:41.9%、50.6%和7.4%;在對(duì)照組患者中的分布分別為48.4%、44.5%和7.1%(χ2=2.675,P=0.263)。CYP11B2基因的C等位基因頻率在實(shí)驗(yàn)組患者(32.3%)與對(duì)照組患者(29.4%)之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.661,P=0.197)。3.多元逐步回歸分析:Logistic回歸分析顯示LAD和LVEDD是中國(guó)EH患者AF的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子(均P<0.001)。C等位基因攜帶者AF的RR=1.30,95%CI:0.95~1.78,P=0.107;調(diào)整LAD和LVEDD后為RR=1.13,95%CI:0.72~1.78,P=0.601。這些結(jié)果表明,在該人群中,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)AF和CYP11B2基因的-344C/T多態(tài)性之間的關(guān)聯(lián)性。4.不同基因型的超聲心動(dòng)圖參數(shù):針對(duì)少數(shù)CC基因型,我們將TC和CC基因型作為一組C等位基因攜帶者。C等位基因攜帶者的LAD顯著大于非C等位基因攜帶者(P=0.009),而兩組患者的LVPW、IVS、LVEDD、LVM無(wú)顯著性差異(P>0.05)。小結(jié):CYP11B2基因的-344C/T多態(tài)性與中國(guó)EH人群非家族性AF之間缺乏關(guān)聯(lián),但這種多態(tài)性可能與中國(guó)EH人群的心房重構(gòu)有關(guān)。為了證實(shí)醛固酮合成酶在非家族性AF中的作用,以及醛固酮合成酶基因的遺傳變異在AF中的作用,可能需要進(jìn)行更大規(guī)模的臨床研究或?qū)嶒?yàn)研究。第四部分醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與血管緊張素受體拮抗劑對(duì)中國(guó)高血壓患者的治療影響研究目的:研究中國(guó)EH患者CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性對(duì)血管緊張素II型受體拮抗劑替米沙坦對(duì)EH患者治療的療效影響評(píng)價(jià),旨在獲得中國(guó)EH患者人群CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性對(duì)降EH藥物治療有效性的影響,為臨床進(jìn)行以基因?yàn)閷?dǎo)向性的個(gè)體化治療提供依據(jù)。方法:本研究以2016年6月至2019年5月在河北省人民醫(yī)院及首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院心內(nèi)科門診和病房連續(xù)招募的164例被確診為EH的患者為研究對(duì)象,進(jìn)行臨床調(diào)查、基因分型和對(duì)使用替米沙坦藥物治療EH的臨床療效進(jìn)行評(píng)價(jià)。收集研究對(duì)象的一般臨床資料包括:年齡、性別、體重、身高、血壓、心率(HR)、研究變量包括血清ALT、肌酐、葡萄糖、尿酸、總膽固醇、甘油三酯、高密度脂蛋白膽固醇和低密度脂蛋白膽固醇、鈉、鉀和血管緊張素II等基線資料。所有患者在停止所有降壓藥物治療后均給予安慰劑。在安慰劑期結(jié)束時(shí),給予每天口服一次替米沙坦,80mg/每次,為期8周。臨床試驗(yàn)中,在給予替米沙坦藥物治療前后進(jìn)行兩次抽血和血壓測(cè)量。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)檢測(cè)技術(shù)檢測(cè)CYP11B2基因多態(tài)性確定基因分型。采用線性回歸模型確定BP反應(yīng)與基因型的相關(guān)性,并對(duì)BP、年齡、性別、BMI、血糖、TC、TG、HDL-C和LDL-C進(jìn)行預(yù)處理歸一化。應(yīng)用SPSS 22.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果:1.研究對(duì)象的一般臨床資料:本研究共納入148例患者的資料,所有患者均被確診患有輕度至中度EH。替米沙坦治療8周后,SBP和DBP均出現(xiàn)顯著性降低(P<0.001)。治療8周結(jié)束時(shí)血清血管緊張素II水平明顯升高(P<0.001)。其他參數(shù)無(wú)顯著性差異。2.CYP11B2-344C/T基因多態(tài)性分型對(duì)替米沙坦的降EH反應(yīng):本研究人群中各多態(tài)性的基因型和等位基因頻率均處于Hardy-Weinberg狀態(tài)(P>0.005)。3.CYP11B2-344C/T基因多態(tài)性與降EH治療療效:對(duì)攜帶有純合子CYP11B2-344C等位基因的受試者,進(jìn)行線性回歸分析表明,CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性與DBP對(duì)替米沙坦的反應(yīng)有關(guān)。經(jīng)協(xié)變量校正后,包括預(yù)處理DBP、年齡、性別、BMI、血糖、TC、TG、HDL和LDL(P=0.005),CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性在替米沙坦的DBP反應(yīng)中占個(gè)體間變異的18.1%。攜帶CYP11B2-344C等位基因(CC+CT)的患者顯示DBP比攜帶TT基因型的患者降低更多。小結(jié):CYP11B2基因-344C/T多態(tài)性可能是影響中國(guó)EH患者對(duì)降血壓治療藥物替米沙坦治療療效的一種基因因素,通過(guò)檢測(cè)特定基因型可能預(yù)測(cè)對(duì)特定降壓藥物治療的療效,為臨床制定用藥方案、提高治療療效、減少M(fèi)ACEs的發(fā)生提供重要的臨床指導(dǎo)意義。

李偉[6](2021)在《整合素α2基因多態(tài)性及微小RNA作用于川崎病冠狀動(dòng)脈病變機(jī)制研究》文中提出研究背景川崎?。↘awasaki Disease,KD)是一種原因未明的全身性中、小血管炎反應(yīng)綜合征,其主要臨床特點(diǎn)包括發(fā)熱、皮膚粘膜損害、頸部淋巴結(jié)腫大等,本病是日本的兒科醫(yī)生川崎富作在1967年首次報(bào)道,其主要損害是冠狀動(dòng)脈病變,早期表現(xiàn)為冠狀動(dòng)脈擴(kuò)張、冠狀動(dòng)脈動(dòng)脈瘤,恢復(fù)期可形成冠狀動(dòng)脈狹窄、血栓形成以及心肌梗死等,嚴(yán)重可導(dǎo)致死亡。未經(jīng)治療的患兒約20%~25%可導(dǎo)致冠狀動(dòng)脈病變。此病多發(fā)于5歲以下兒童,發(fā)病人群主要為亞裔人群。2012年日本流行病學(xué)報(bào)告小于5歲的兒童KD發(fā)病率為264.8/10萬(wàn),國(guó)內(nèi)流行病學(xué)資料表明,北京市2000年至2004年5歲以下兒童發(fā)病率為(40.9~55.1)/10萬(wàn),上海市2013至2017年5歲以下兒童發(fā)病率68.8~107.3/10萬(wàn),呈逐年升高趨勢(shì),而且近些年來(lái)發(fā)病率越來(lái)越高,當(dāng)前KD已是兒童最常見(jiàn)后天性心臟病主要病因之一。KD的發(fā)病病因及機(jī)制尚不明確。當(dāng)前的研究認(rèn)為KD在遺傳易感性基礎(chǔ)上,由外源性抗原觸發(fā),引起機(jī)體免疫機(jī)制紊亂所致全身中小血管炎。流行病學(xué)研究顯示KD的發(fā)病率存在明顯的種族之間差異,以亞裔的人群發(fā)病率較高以及同胞之間發(fā)病率高,提示KD的發(fā)病機(jī)制有一定的遺傳易感性因素參與。整合素α2(Integrinα2,ITGA2)是重要的膠原蛋白受體,在上皮細(xì)胞和血小板中表達(dá)較高,在血小板以及纖維膠原的粘附過(guò)程中具有非常重要的作用,粘附過(guò)程會(huì)導(dǎo)致血小板的激活和血栓的形成,在冠心病、動(dòng)脈粥樣硬化、腦卒中、腫瘤及免疫性炎癥反應(yīng)等中發(fā)病中發(fā)揮著重要作用。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)指基因組內(nèi)DNA中某一特定核苷酸位置上存在轉(zhuǎn)換、顛換、插入、缺失等不同類型且其中發(fā)生率大于1%的變異。然而ITGA2基因SNP與KD冠狀動(dòng)脈病變相關(guān)的關(guān)系,查閱國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn),我國(guó)漢族人群中尚無(wú)該基因多態(tài)性與KD相關(guān)報(bào)道,本研究探討ITGA2在我國(guó)漢族人群中的KD分布情況以及研究ITGA2的基因單核苷酸多態(tài)性與KD冠狀動(dòng)脈病變相關(guān)性,為進(jìn)一步改善KD患兒預(yù)后提供理論依據(jù)。微小RNA(microRNAs,miRNA)是一組約20個(gè)左右核苷酸高度保守的非編碼RNA,廣泛存在于自然界中。研究發(fā)現(xiàn)miRNA在心血管疾病、免疫性疾病及腫瘤等多種疾病的發(fā)生發(fā)展中,通過(guò)與靶基因的3’端(非翻譯區(qū))區(qū)域部分序列相結(jié)合,互補(bǔ)后降解已轉(zhuǎn)錄的靶基因mRNA,或者抑制靶基因編碼蛋白進(jìn)而對(duì)疾病發(fā)生發(fā)展起到作用。血漿miRNA作為生物標(biāo)志物以及用于診治疾病是目前研究的熱點(diǎn)。因miRNA在組織和血液的表達(dá)相對(duì)穩(wěn)定,不容易被核酸酶消化,且miRNA的表達(dá)在不同種類疾病、組織和細(xì)胞中具有特異性。所以導(dǎo)致血漿miRNA在各種疾病早期診斷以及藥物開(kāi)發(fā)等臨床基礎(chǔ)方面的研究全面開(kāi)展。對(duì)于血漿miRNA在KD作用機(jī)制尚未完全清楚,因此,本研究以篩選出KD的明顯差異表達(dá)血漿miRNA的差異表達(dá)為切入點(diǎn),通過(guò)莖-環(huán)的RT-PCR方法檢測(cè)和驗(yàn)證明顯差異表達(dá)miRNA,分析其生物學(xué)功能,為進(jìn)一步研究發(fā)病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)新的生物學(xué)標(biāo)志物是KD早期診斷、治療重要內(nèi)容,最終為KD合并冠狀動(dòng)脈損傷的患兒早期診斷和基因靶向的治療并改善預(yù)后提供理論依據(jù)。KD的診斷主要是依靠臨床的表現(xiàn),尚未特異性診斷指標(biāo),能否早期診斷及治療KD是影響KD冠狀動(dòng)脈病變預(yù)后的關(guān)鍵。KD治療方案主要為靜脈輸注丙種球蛋白(Intravenous Immune Globulin,IVIG)及口服阿司匹林治療,經(jīng)規(guī)范治療后KD冠狀動(dòng)脈病變發(fā)生率可下降至5%左右。阿司匹林具有抗炎作用,可縮短發(fā)熱時(shí)間和抗血小板作用,因此是最初治療KD的療法之一。meta分析表明,阿司匹林治療不影響冠狀動(dòng)脈瘤形成。自從KD患兒應(yīng)用IVIG治療在1983年首次報(bào)道,之后的研究證實(shí)IVIG能夠降低KD合并冠狀動(dòng)脈病變發(fā)生風(fēng)險(xiǎn),在KD病程第7~10天內(nèi)治療可得到最好效果。但第10天后仍存在持續(xù)發(fā)熱、炎癥指標(biāo)升高和/或冠狀動(dòng)脈病變的患兒也應(yīng)給予大劑量IVIG治療。也有日本研究顯示病程4天內(nèi)時(shí)早期開(kāi)始治療者更容易出現(xiàn)IVIG無(wú)反應(yīng)。2017年AHA發(fā)布的《川崎病診斷、治療與長(zhǎng)期管理的新科學(xué)聲明》建議診斷者明確盡早使用IVIG,診斷時(shí)間最早可提前到發(fā)病第3天。雖然IVIG作用的機(jī)制仍不明確,但I(xiàn)VIG具有全身性抗炎作用,能夠減輕發(fā)熱并減少急性反應(yīng)物,其可能機(jī)制包括:調(diào)節(jié)細(xì)胞因子的水平和生成、增加T細(xì)胞抑制因子活性、下調(diào)抗體合成、對(duì)補(bǔ)體系統(tǒng)的作用、以及提供抗獨(dú)特型抗體。雖然使用大劑量IVIG可預(yù)防KD冠狀動(dòng)脈病變,但I(xiàn)VIG的時(shí)機(jī)和有效性對(duì)中期KD冠狀動(dòng)脈結(jié)局影響仍需進(jìn)一步確定。目的1.探討我國(guó)漢族兒童整合素α2的基因單核苷酸多態(tài)性與KD冠狀動(dòng)脈病變相關(guān)關(guān)系。2.探討miRNAs與KD冠狀動(dòng)脈病變發(fā)病機(jī)制相關(guān)關(guān)系。3.分析大劑量IVIG治療時(shí)機(jī)對(duì)KD冠狀動(dòng)脈病變結(jié)局的影響及影響KD冠狀動(dòng)脈病變的高危因素。方法1.應(yīng)用病例-對(duì)照研究的方法,我們選擇對(duì)ITGA2基因位點(diǎn),利用NCBI dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)和SNP info信息,篩選符合以下標(biāo)準(zhǔn)的研究SNPs:(1)在HapMap數(shù)據(jù)中報(bào)道的中國(guó)漢族后代中等位基因頻率≥5%并且不包含于已有的KD全基因組范圍關(guān)聯(lián)研究中;(2)位于基因調(diào)控區(qū)或影響轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)活性或啟動(dòng)子中的微小RNA結(jié)合位點(diǎn)活性或改變外顯子中的氨基酸。采用卡方檢驗(yàn)比較一般資料以及SNP基因型在KD研究組及對(duì)照組中的分布差異。采用單因素及多因素logistic回歸分析來(lái)計(jì)算比值比(OR)、校正OR及95%置信區(qū)間(CI)用來(lái)評(píng)估關(guān)聯(lián)的程度。2.通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測(cè)KD患兒在IVIG治療前、后及正常健康兒童血漿中的miRNA差異表達(dá)的建立。篩選出選擇明顯差異表達(dá)的miRNA在更大的樣本臨床資料中進(jìn)一步驗(yàn)證。關(guān)鍵miRNA在KD冠狀動(dòng)脈病變的作用機(jī)制研究。3.本研究回顧性分析在2015年1月至2017年12月期間診斷為KD患兒,隨訪終點(diǎn)2018年12月。該項(xiàng)研究已在中國(guó)臨床試驗(yàn)注冊(cè)中心登記。本研究主要指標(biāo)是入院時(shí)超聲診斷冠狀動(dòng)脈病變及12月內(nèi)隨訪心臟超聲結(jié)果。次要指標(biāo)是IVIG治療前后炎癥指標(biāo)。以ROC曲線下面積、敏感性和特異性為指標(biāo)篩選出評(píng)價(jià)IVIG治療KD的預(yù)防冠狀動(dòng)脈病變(coronary artery lesions,CALs)最佳時(shí)機(jī),采用t檢驗(yàn)和卡方檢驗(yàn)比較各組別人口學(xué)特征、炎癥指標(biāo)以及冠狀動(dòng)脈病變構(gòu)成比,應(yīng)用單因素及多因素logistic回歸分析KD冠狀動(dòng)脈病變因素。結(jié)果1.ITGA2基因SNP與KD冠狀動(dòng)脈病變的相關(guān)性。本研究隨機(jī)選擇KD組818例,選擇同時(shí)期的年齡、性別想匹配1401例健康兒童作為對(duì)照組,符合標(biāo)準(zhǔn)所選擇血小板活化通路核心基因ITGA2基因C807T(rs1126643)。該基因型在KD組及對(duì)照組中性別、年齡存在著差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。818例KD根據(jù)有無(wú)并發(fā)冠狀動(dòng)脈瘤(coronary artery aneurysms,CAAs),分為兩個(gè)亞組,其中CAAs組116例(14.18%),702例(85.82%)患兒為無(wú)CAAs組。研究人群中ITGA2基因型的HWE=0.9626>0.05,說(shuō)明本次研究對(duì)整個(gè)群體具有一定的代表性。多因素logistic回歸分析ITGA2基因C807T(rs1126643)在KD組及對(duì)照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。與健康對(duì)照組相比,相對(duì)于我們發(fā)現(xiàn)ITGA2基因C807T(rs1126643)T等位基因低于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05)。OR值<1為保護(hù)因子。相對(duì)于rs1126643野生型CC基因型,經(jīng)過(guò)年齡、性別校正后,TT基因型攜帶者患兒患病的風(fēng)險(xiǎn)降低了 38%(校正 OR=0.62,95%CI=0.43-0.88,p=0.0078),TTvsCT+CC(校正 OR=0.63,95%CI=0.44-0.889,p=0.0093)。我們發(fā)現(xiàn) ITGA2 基因C807T(rs1126643)TT基因型對(duì)KD具有保護(hù)作用。進(jìn)一步分層分析表明,當(dāng)ITGA2基因C807T(rs1126643)CC/CT作為對(duì)照基因型,TT基因型者在年齡≤60月齡,女性患兒及KD無(wú)CAAs更具顯著保護(hù)作用。2.miRNA與KD冠狀動(dòng)脈病變的相關(guān)性研究,選擇5例KD合并冠狀動(dòng)脈病變?cè)贗VIG治療前、后患兒血漿的具有明顯的差異miRNA,芯片結(jié)果顯示miR-126在KD患兒治療前明顯降低,IVIG治療升高(大于2倍以上)。選擇進(jìn)一步擴(kuò)大樣本到10例KD合并冠狀動(dòng)脈病變接受大劑量IVIG治療治療前、后患兒及5例健康兒童作為對(duì)照組采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR研究方法進(jìn)行檢測(cè)驗(yàn)證差異表達(dá)miR-126。定量PCR顯示差異表達(dá)miRNAs在KD治療前患兒中明顯低表達(dá)但在健康兒童、接受IVIG治療的KD合并冠狀動(dòng)脈病變患兒檢測(cè)到表達(dá)的候選miRNAs,統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,在所驗(yàn)證的差異miRNA分子中,miR-126在KD IVIG治療中明顯差異表達(dá),具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p<0.05),說(shuō)明篩選結(jié)果可靠。前期研究結(jié)果顯示治療過(guò)后的KD患兒血漿miR-126表達(dá)量增高,上述資料表明miR-126是對(duì)于血管內(nèi)皮有積極作用的。使用較為權(quán)威的數(shù)據(jù)庫(kù)Target Scan在線軟件對(duì)的miRNA-126的靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè)miR-126,雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)明確miR-126與靶基因SPRED1相結(jié)合(p<0.05),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。說(shuō)明miR-126能通過(guò)結(jié)合SPRED1基因3’UTR影響其熒光活性改變。用Western-Blot實(shí)驗(yàn)方法,驗(yàn)證與SPRED1因子相關(guān)的細(xì)胞信號(hào)通路蛋白,miR-126 mimics 其靶基因 SPRED1 表達(dá)量下調(diào),增強(qiáng)了 VEGF,FGF-1,Ras-p21,MAPK-p38蛋白水平依次增加為1.67倍,1.93倍,1.76倍和1.86倍,加入miR-126 Inhibitor后,miR-126 inhibitor組的SPRED1蛋白水平是Cell組的1.51倍,同時(shí)受到負(fù)調(diào)控因子的SPRED1的調(diào)控,VEGF,FGF-1,Ras-p21及MAPK-p38的蛋白水平依次減少為0.54,0.64,0.59和0.63,實(shí)驗(yàn)證實(shí)miR-126有利于促進(jìn)血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)。將miR-126 mimic及inhibitor的小分子轉(zhuǎn)染HCAEC,結(jié)果表明,miR-126 mimic導(dǎo)致HCAEC細(xì)胞活力上調(diào),細(xì)胞周期發(fā)生變化,處在G2期的細(xì)胞比例顯著增高,而處在S期的細(xì)胞比例顯著降低(p<0.05)。而轉(zhuǎn)染miR-126 inhibitor后HCAEC的反應(yīng)則相反。其細(xì)胞活力顯著下降,G2期細(xì)胞比例顯著降低,而S期細(xì)胞比例無(wú)變化(p<0.05)。表明KD患兒miR-126的確能夠?qū)CAEC起積極作用,通過(guò)治療后KD患兒血液內(nèi)miR-126表達(dá)量上升,病情好轉(zhuǎn)。本研究結(jié)果證實(shí)miR-126在KD合并冠狀動(dòng)脈病變的通過(guò)關(guān)鍵靶基因SPRED1的調(diào)控血管生成因子VEGF,FGF-1作用的分子機(jī)制。3.IVIG治療時(shí)間對(duì)KD冠狀動(dòng)脈病變結(jié)局的影響。研究3年時(shí)間符合入選標(biāo)準(zhǔn)并隨訪12月1281例KD患兒。ROC曲線顯示IVIG治療時(shí)間預(yù)測(cè)KD冠狀動(dòng)脈病變的最佳天數(shù)為7.5天,ROC曲線下面積為0.80(95%CI=0.76-0.84,p<0.001)。本研究中816例(56.9%)為男性,465例為女性患兒(43.1%)?;純褐形荒挲g為12個(gè)月(11-36個(gè)月),141例(11%)為IVIG無(wú)反應(yīng)KD患者?;純航邮躀VIG治療的中位數(shù)時(shí)間為6天,診斷時(shí)339例(26.5%)有CALs,94 例(7.3%)有 CAAs。隨訪 12 個(gè)月,39 例(3.0%)仍存在 CALs,23 例(1.8%)持續(xù)存在CAAs。根據(jù)IVIG治療時(shí)間將所有病人分為4組:第1組為發(fā)病第4天內(nèi)接受IVIG治療,第2組為發(fā)病第5-7天內(nèi)接受IVIG治療,第3組為發(fā)病第8-10天內(nèi)接受IVIG治療,第4組為發(fā)病后10天以后接受IVIG治療。第1組77例、第2組817例、第3組249例和第4組138例。第4組IVIG無(wú)反應(yīng)率高于其他3組,差異有顯著性(p=0.001)。入院診斷KD時(shí),心臟彩超CALs在第1至4組分別 14.1%,19.5%,35.3%和 58.7%;CAAs 在第 1 至 4 組分別 2.6%,3.5%,8.4%和30.4%。隨訪12個(gè)月,第3、4組CALs和CAAs發(fā)生率均高于第1、2組,差異有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.001)。CALs和CAAs在第1、2組構(gòu)成比不同,但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。第2組與第3組相比,兩組之間比較存在差異并統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05),1 月時(shí) KD 患 CALs 及 CAAs 相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)分別為 OR 2.1(95%CI 1.4-3.0),OR 3.9(95%CI 1.9-8.2),12個(gè)月時(shí)KD患CALs及CAAs相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)分別為OR 5.3(95%CI 2.0-13.9),OR 13.5(95%CI 2.9-14.1)。根據(jù)12月隨訪結(jié)果影響KD合并CALs多因素logistic回歸分析,將患兒的年齡、性別、發(fā)熱持續(xù)天數(shù)、IVIG使用病程天數(shù)、IVIG無(wú)反應(yīng)、白細(xì)胞、中性粒細(xì)胞百分比以及C-反應(yīng)蛋白8個(gè)因素做單因素分析,篩選有意義自變量進(jìn)行多因素logistic回歸分析,結(jié)果顯示IVIG使用病程天數(shù)、丙球無(wú)反應(yīng)與是KD合并CALs獨(dú)立危險(xiǎn)因素(p<0.001)。結(jié)論1.血小板活化通路核心基因位點(diǎn)ITGA2 C807T(rs1126643)基因多態(tài)性改變可能與中國(guó)人群的KD發(fā)病以及KD合并冠狀動(dòng)脈病變遺傳易感性有關(guān),此結(jié)果尚需要更大規(guī)模前瞻性研究進(jìn)一步驗(yàn)證。2.差異表達(dá)的miR-126在KD治療前表達(dá)明顯下降,IVIG治療后明顯升高,通過(guò)直接下調(diào)控靶基因SPRED1,導(dǎo)致VEGF,FGF-1,Ras-p21及MAPK-p38的表達(dá)量增加,從而促進(jìn)血管生成的活化。提示miR-126及其靶基因SPRED1可能與KD冠狀動(dòng)脈病變的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程有關(guān),可能成為KD合并冠狀動(dòng)脈病變潛在的早期診斷標(biāo)志物和治療新靶點(diǎn)。3.本研究表明IVIG治療在KD病程7天內(nèi)可更好有效預(yù)防冠狀動(dòng)脈病變。IVIG治療在病程4天內(nèi)并不會(huì)增加冠狀動(dòng)脈病變發(fā)生率和IVIG無(wú)反應(yīng)的發(fā)生率。IVIG使用天數(shù)、IVIG無(wú)反應(yīng)是KD合并CALs高危因素,因此建議大劑量IVIG對(duì)急性期KD治療越早越好。

賈林·阿布扎力汗[7](2021)在《APLP2基因變異體參與膽固醇代謝的分子機(jī)制及功能研究》文中指出目的:本研究旨在尋找淀粉樣肽前體樣蛋白2(APLP2)調(diào)控相關(guān)基因及新的變異位點(diǎn),從基因/蛋白/環(huán)境多層次水平上研究其參與調(diào)控膽固醇代謝的機(jī)制與功能,為以他汀類藥物為基礎(chǔ)的高脂血癥的治療、降低心腦血管疾病的患病率和死亡率提供理論依據(jù)及新的治療策略。1)采用極端表型策略結(jié)合二代測(cè)序技術(shù)在新疆地區(qū)人群中檢測(cè)APLP2基因非同義突變位點(diǎn),使用Methyltarget高通量測(cè)序法檢測(cè)APLP2基因甲基化水平。2)探討淀粉樣肽前體樣蛋白2(APLP2)新的變異體參與膽固醇代謝過(guò)程中的分子機(jī)制。3)探討APLP2基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與新疆人群中血脂異常發(fā)生率間的關(guān)聯(lián)性。方法:1)采用極端表型策略,選取新疆地區(qū)維吾爾族和哈薩克族共60例研究對(duì)象,分析APLP2基因與血脂譜的關(guān)聯(lián)性。采用病例對(duì)照的研究方法,分析APLP2基因在冠心病組和對(duì)照組中的甲基化水平。2)在細(xì)胞水平上,構(gòu)建APLP2基因新變異體的真核過(guò)表達(dá)質(zhì)粒,采用蛋白質(zhì)免疫印跡、實(shí)時(shí)定量PCR、免疫沉淀、免疫共沉淀等實(shí)驗(yàn)手段研究APLP2蛋白表達(dá)、穩(wěn)定性、降解等本身特點(diǎn)及對(duì)靶蛋白Apo E/LRP1、PCSK9/LDLR的影響,探究APLP2參與調(diào)控膽固醇代謝的機(jī)制和功能。3)選擇新疆地區(qū)漢族、維吾爾族及哈薩克族年齡≥35歲的人群1738例,利用Taqman技術(shù)對(duì)APLP2基因標(biāo)簽SNPs進(jìn)行擴(kuò)大樣本量驗(yàn)證,闡述與血脂代謝的相關(guān)性。結(jié)果:1)本研究中入選的60例血脂極高和極低人群進(jìn)行APLP2基因全外顯子組測(cè)序,共發(fā)現(xiàn)11個(gè)新的未曾報(bào)道的非同義變異體(Q194E、G42E、G295S、M323I、D329N、S447N、R468C、H534Q、V535M、D573Y及P601A),其中Q194E、G42E、M323I、S447N、R468C、及P601A非同義變異體出現(xiàn)在LDL-C極高組人群中,其余的均出現(xiàn)在LDL-C極低組人群中。冠心病患者中APLP2基因甲基化水平明顯高于健康對(duì)照組研究對(duì)象。2)在細(xì)胞水平上進(jìn)行機(jī)制研究結(jié)果顯示:與野生型APLP2相比,APLP2 G42E變異體的蛋白表達(dá)水平明顯減少,APLP2 Q194E變異體的蛋白表達(dá)水平明顯增加,然而在mRNA水平上的表達(dá)與野生型無(wú)明顯差異。APLP2 G42E突變體的半衰期相對(duì)較短,降解速度較快,APLP2 Q194E突變體的半衰期相對(duì)較長(zhǎng),降解相對(duì)緩慢。野生型APLP2能夠與ApoE相互作用,與野生型相比,APLP2 G42E和APLP2 Q194E與ApoE的結(jié)合沒(méi)有顯著區(qū)別。APLP2野生型與LDLR有相互作用,并且是劑量依賴性增加。與野生型相比,APLP2 G42E和APLP2Q194E與PCSK9介導(dǎo)LDLR的降解實(shí)驗(yàn)無(wú)明顯結(jié)果差異。3)APLP2基因rs2054247多態(tài)性位點(diǎn)與血清總膽固醇(TC)和低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)水平相關(guān)(P<0.05)。APLP2基因rs2054247位點(diǎn)多態(tài)性與血清高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)相關(guān)(P<0.05)。然而,rs2054247位多態(tài)性與血清甘油三酯(TG)水平無(wú)關(guān)(P>0.05)。APLP2基因rs3740881多態(tài)性位點(diǎn)與血清TC、LDL-C、HDL-C和TG水平均無(wú)關(guān)(P>0.05)。APLP2 rs747180多態(tài)性位點(diǎn)只與TC、LDL-C水平相關(guān)(P<0.05)。結(jié)論:1)本研中在新疆地區(qū)哈薩克族和維吾爾族人群中共篩選出APLP2基因11個(gè)非同義突變位點(diǎn),新疆地區(qū)人群冠心病患者中APLP2基因甲基化水平較健康對(duì)照組高。2)對(duì)APLP2基因新變異體G42E和Q194E在細(xì)胞水平上進(jìn)行機(jī)制研究后發(fā)現(xiàn)G42E和Q194E變異體不影響膽固醇水平。同時(shí),該兩個(gè)變異體不影響與ApoE/LRP1結(jié)合,也不影響PCSK9介導(dǎo)LDLR的降解。3)APLP2基因rs2054247和rs747180位點(diǎn)多態(tài)性在新疆人群中可能與高TC和高LDL-C水平相關(guān)。ApoE基因rs429358多態(tài)性位點(diǎn)在新疆維吾爾族人群中可能與冠心病的發(fā)病相關(guān)。

胡乃文[8](2020)在《TNF,GRN和ERAP1基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)性研究》文中認(rèn)為第一部分中國(guó)漢族人群TNF和GRN基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)性研究研究背景脊柱關(guān)節(jié)炎(spondyloarthritis,SpA)是一組具有共同臨床特點(diǎn)和遺傳學(xué)特征的慢性炎癥性疾病。強(qiáng)直性脊柱炎(Ankylosingspondylitis,AS)是SpA最常見(jiàn)的表現(xiàn)形式。家族聚集性是AS的重要特征。人類白細(xì)胞抗原(humanleukocyte antigen,HLA)-B27是迄今為止所發(fā)現(xiàn)與AS關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的基因。但近年來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),非HLA-B27基因在AS發(fā)病中亦具有重要作用。因此,為進(jìn)一步明確AS的病因及發(fā)病機(jī)制,有必要探討非HLA-B27基因在AS發(fā)病中的作用。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymophisms,SNP),是指單個(gè)核苷酸在基因組水平上發(fā)生變異所導(dǎo)致的DNA序列多態(tài)性。由于SNP廣泛存在于各人群的基因組中,且易于分型,目前業(yè)已成為現(xiàn)代遺傳變異與復(fù)雜性狀研究中的最重要研究對(duì)象。腫瘤壞死因子(tumornecrosis factor,TNF)基因,位于6p21.33,是一種非HLA的MHC基因。該基因編碼一種屬于腫瘤壞死因子超家族的、主要由巨噬細(xì)胞分泌的促炎細(xì)胞因子。它可以與TNFRSF1A/TNFR1和TNFRSF1B/TNFBR受體結(jié)合,從而發(fā)揮作用。TNF與包括自身免疫病在內(nèi)的多種疾病有關(guān)。近來(lái)的研究表明TNF在AS發(fā)病機(jī)制中具有重要作用。關(guān)于TNF是脊柱關(guān)節(jié)炎的關(guān)鍵細(xì)胞因子的最有力證據(jù)是,在臨床中使用TNF抑制劑可以有效改善脊柱關(guān)節(jié)炎(包括強(qiáng)直性脊柱炎)患者的癥狀和體征。從組織水平上,TNF抑制劑可以引起一系列的組織學(xué)改善,包括減少中性粒細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的炎性浸潤(rùn)、減少新骨形成等。既往已有諸多關(guān)于TNF基因的SNP與AS相關(guān)性的研究,但是存在爭(zhēng)議。因此,有必要進(jìn)一步研究TNF的SNP與AS的關(guān)系。GRN基因即顆粒蛋白前體(granulin precursor,PGRN)基因,位于17q21.31,其功能為編碼顆粒蛋白(granulin,GRN)前體。這種信號(hào)肽切割后產(chǎn)生成熟的顆粒蛋白,可以進(jìn)一步裂解成6kDa的各種活性肽。這些肽和完整的顆粒蛋白調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)。然而,顆粒蛋白家族的不同成員可以作為抑制劑、激動(dòng)劑或?qū)?xì)胞生長(zhǎng)具有雙向調(diào)節(jié)作用。近年來(lái),顆粒蛋白被認(rèn)為與許多自身免疫性疾病有關(guān)。有研究提示顆粒蛋白前體是炎癥的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,其抗炎作用可能是通過(guò)阻斷TNF與其受體的結(jié)合來(lái)實(shí)現(xiàn)。還有研究發(fā)現(xiàn)PGRN抗體陽(yáng)性的銀屑病關(guān)節(jié)炎(PsA)患者,發(fā)生肌腱附著點(diǎn)炎和指(趾)炎的幾率較高。AS和PsA均屬于血清陰性脊柱炎(SpA),因此同時(shí)研究TNF和GRN基因多態(tài)性是否與AS相關(guān)具有重要意義?;谝陨嫌^點(diǎn),為探討TNF和GRN基因在AS發(fā)病機(jī)制中的潛在作用,我們選擇了 TNF和GRN基因的多個(gè)SNP位點(diǎn),為AS的易感基因評(píng)估提供依據(jù)。研究目的探討TNF、GRN基因單核苷酸多態(tài)性與我國(guó)山東地區(qū)漢族人群強(qiáng)直性脊柱炎(AS)的關(guān)聯(lián)性。研究方法1.研究對(duì)象病例組選取861例AS患者,均屬于中國(guó)山東地區(qū)漢族人群,為2014年1月至2015年12月在山東大學(xué)附屬山東省立醫(yī)院風(fēng)濕免疫科門診或病房的符合1984年修訂的紐約AS分類標(biāo)準(zhǔn)的患者。記錄患者的癥狀、體征、受累關(guān)節(jié)、家族史;采用流式細(xì)胞術(shù)測(cè)定HLA-B27;所有患者均完成骶髂關(guān)節(jié)X線檢查,由影像科專業(yè)醫(yī)師按骶髂關(guān)節(jié)的國(guó)際統(tǒng)一分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行結(jié)果判定。所有患者均需排除其他自身免疫性疾病。正常對(duì)照組864例均來(lái)自于本研究中心體檢中心健康中國(guó)山東漢族人群,已排除腫瘤、其他結(jié)締組織病、傳染病等疾病,年齡、性別均與AS組匹配。所有入選者均在知情同意后入組。2.實(shí)驗(yàn)方法2.1 標(biāo)本收集用EDTA抗凝管采集AS患者和對(duì)照組人群空腹外周靜脈血2ml,放置冰箱中在-80℃條件下保存,備檢。2.2 基因組DNA提取使用基因組DNA提取試劑盒,按照說(shuō)明書操作步驟提取病例組和對(duì)照組DNA。2.3 DNA濃度和純度測(cè)定向DNA樣本2ul中加入三蒸水48ul,將濃度稀釋至1/25,用紫外分光光度儀測(cè)量OD260/OD280比值以及DNA濃度,并分析DNA純度。2.4 多態(tài)性位點(diǎn)的選擇根據(jù)dbSNP數(shù)據(jù)庫(kù)獲取TNF、GRN基因的SNPs資料,各個(gè)SNP位點(diǎn)的分布頻率由HaploView軟件來(lái)確定,同時(shí)應(yīng)用Tagger功能篩選TagSNP。初步篩選需滿足次要等位基因頻率>5%及連鎖不平衡系數(shù)r2>0.8。根據(jù)篩選結(jié)果,最終確定 TNF 基因的 rs361525、rs1799964、rs1800629、rs1800630、rs769178和GRN基因的 rs850713、rs3785817、rs3760365、rs4792939、rs25646、rs5848作為研究位點(diǎn)。2.5 基因分型使用Taqman探針Real-time PCR方法按照步驟進(jìn)行基因分型。2.6 檢測(cè)結(jié)果分析應(yīng)用SDS軟件(Applied Biosystem,2.0 version)進(jìn)行數(shù)據(jù)收集和處理TaqMan-PCR擴(kuò)增后的FAM和VIC熒光信號(hào)。3.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析3.1 Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)使用 SHEsis 軟件進(jìn)行 Hardy-Weinberg 平衡檢驗(yàn)。3.2病例組與對(duì)照組基因型和等位基因頻率的統(tǒng)計(jì)分析 用SPSS24.0軟件通過(guò)卡方檢驗(yàn)對(duì)各個(gè)等位基因、基因型和單倍型進(jìn)行分析。使用SHEsis程序計(jì)算單倍型頻率、優(yōu)勢(shì)比及95%可信區(qū)間。3.3患者臨床表現(xiàn)/實(shí)驗(yàn)室結(jié)果與基因多態(tài)性關(guān)聯(lián)分析將收集的相關(guān)數(shù)據(jù)應(yīng)用SPSS24.0軟件完成統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。3.4連鎖不平衡及單倍體型分析各個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)之間的連鎖不平衡及單倍體型的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析分別由HaploView2.0及SHEsis軟件來(lái)完成。4.SNP位點(diǎn)的生物信息學(xué)功能分析使用GTEx,Haploreg和Regulome DB數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì) TNF 基因的 rs1799964,rs1800629,rs1800630,rs769178 功能進(jìn)行注釋。研究結(jié)果1.基本信息共對(duì)861例AS病人及864例正常健康對(duì)照進(jìn)行了基因分型。AS病人中,男性患者634例,女性患者227例,年齡15-71歲,平均年齡30.56±10.98歲。正常對(duì)照組,男性619例,女性245例,年齡14-73歲,平均年齡31.97±11.23歲。所有研究對(duì)象均屬山東漢族人群。病例組與對(duì)照組在年齡、性別上無(wú)顯著性差異(p>0.05)。2.Hardy-We i nberg 平衡檢驗(yàn)本實(shí)驗(yàn)所有SNPs的p值>0.05,均符合Hardy-Weinberg平衡定律,提示所有研究的SNP位點(diǎn)基因型和吻合基因的觀察值和期望值吻合良好。3.TNF基因型頻率和等位基因頻率在AS及正常人的分布3.1有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的位點(diǎn)對(duì)于rs1799964位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型分布的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001);兩組等位基因分布的差異也具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001;OR=0.60,95%CI=0.50-0.71),提示 C 等位基因是 AS 的保護(hù)性基因。對(duì)于rs1800629位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型分布的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.0004);兩組等位基因分布的差異也具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.0001;OR=0.60,95%CI=0.39-0.74),提示A等位基因是AS的保護(hù)性基因。對(duì)于rs1800630位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型分布的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001);兩組等位基因分布的差異也具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001,95%CI=0.48-0.72),提示A等位基因是AS的保護(hù)性基因。對(duì)于rs769178位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型分布的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001);兩組等位基因分布的差異也具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.0001,95%CI=2.18-3.09),提示T等位基因是AS的危險(xiǎn)性基因。3.2無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的位點(diǎn)對(duì)于rs361525位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型和等位基因頻率無(wú)顯著性差異。4.GRN基因型頻率和等位基因頻率在AS及正常人的分布對(duì)于 rs850713、rs3785817、rs3760365、rs4792939、rs25646、rs5848 位點(diǎn),AS組與對(duì)照組基因型和等位基因頻率均無(wú)顯著性差異。提示GRN基因多態(tài)性與AS易感性無(wú)關(guān)。5.對(duì)TNF等位基因頻率分布具有顯著性差異位點(diǎn)的基因型遺傳模式分析對(duì)于rs1799964位點(diǎn),在顯性遺傳模式下,CC基因型和CT基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn);在隱性遺傳模式下,CC基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于rs1800629位點(diǎn),在顯性遺傳模式,AA基因型和AG基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn);在隱性遺傳模式下,AA基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于rs1800630位點(diǎn),在顯性遺傳模式下,AA基因型和AC基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn);在隱性遺傳模式下,AA基因型可降低AS的風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于rs769178位點(diǎn),在顯性遺傳模式下,TT基因型和GT基因型可增加AS的風(fēng)險(xiǎn);在隱性遺傳模式下,TT基因型可增加AS的風(fēng)險(xiǎn)。6.TNF基因多態(tài)性與AS患者臨床/實(shí)驗(yàn)室指標(biāo)關(guān)聯(lián)分析rs1799964、rs1800629、rs1800630、rs769178 在顯性和隱性遺傳模式下的基因型與AS患者的性別、年齡、病程、家族史、HLA-B27陽(yáng)性、外周關(guān)節(jié)受累、葡萄膜炎均無(wú)明顯關(guān)聯(lián)性。7.連鎖不平衡及單倍型分析統(tǒng)計(jì)學(xué)結(jié)果顯示,TNF及GRN基因的各研究位點(diǎn)之間存在弱的連鎖不平衡。TNF基因5個(gè)研究位點(diǎn)的CGAGG、CGCAG、TACGG、TGCGG、TGCGT單倍型以及GRN基因6個(gè)研究位點(diǎn)的CTGACA單倍型在AS組與正常對(duì)照組之間比較,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。8.TNF基因生物信息學(xué)分析在 GTEx 數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì) TNF 基因的 rs1800629、rs1800630、rs769178 和rs1799964位點(diǎn)進(jìn)行eQTL分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)上述SNPs可影響多個(gè)基因的表達(dá)量,且在GSE25101數(shù)據(jù)集中顯示,上述部分基因在AS患者中亦具有差異表達(dá),提示rs1800629、rs1800630、rs769178 和 rs1799964 的 SNPs 可能通過(guò)調(diào)控其他基因的表達(dá)量從而在強(qiáng)直性脊柱炎發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮生物學(xué)功能。結(jié)論1.我們?cè)趪?guó)內(nèi)外首次確認(rèn)了 TNF基因位點(diǎn)rs769178多態(tài)性與AS易感性相關(guān);驗(yàn)證了 rs1800629、rs1800630、rs769178 和 rs1799964 在 AS 組與對(duì)照組等位基因頻率及基因型差異顯著,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。TNF基因多態(tài)性與山東地區(qū)漢族人群AS易感性相關(guān),eQTL分析顯示其可能通過(guò)影響某些基因的表達(dá)量影響AS的易感性。目前未發(fā)現(xiàn)其與AS的臨床表現(xiàn)具有顯著相關(guān)性。2.GRN基因多態(tài)性與山東地區(qū)漢族人群的AS易感性無(wú)關(guān),但是SNP基因型頻率在不同種族、不同地區(qū)的分布存在明顯差異,故需要更收集不同地區(qū)、不同人群的更多資料,來(lái)進(jìn)一步研究GRN基因與AS是否存在關(guān)聯(lián)性。第二部分ERAP1基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎易感性關(guān)系的Meta分析研究背景強(qiáng)直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)是一種以累及中軸和外周關(guān)節(jié)、韌帶和肌腱附著點(diǎn)為主要特征的慢性、全身性、炎癥性疾病。AS具有高度遺傳性,人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-B27基因是迄今為止發(fā)現(xiàn)的和AS關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的基因。但近年來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),非HLA-B27基因在AS發(fā)病中也具有重要作用,研究其在AS發(fā)病中所起作用對(duì)進(jìn)一步明晰AS的病因及發(fā)病機(jī)制具有重要意義。近年來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),非HLA-B27基因中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨基肽酶(endoplasmic reticulum aminopeptidase,ERAP)1基因在AS風(fēng)險(xiǎn)中也起重要作用。許多病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)ERAP1的基因多態(tài)性與AS相關(guān),但研究結(jié)果不盡一致。結(jié)果不一致的原因之一可能與人群差異有關(guān)。Meta分析是一種總結(jié)許多研究結(jié)果的有效的標(biāo)準(zhǔn)分析方法。既往已有多篇相關(guān)的Meta分析,但是既往研究所選擇的數(shù)據(jù)庫(kù)、研究人群不盡一致,且近2年多來(lái)又有多篇新的關(guān)于ERAP1基因多態(tài)性與AS關(guān)系的文章數(shù)據(jù)。故在本研究中,我們結(jié)合全基因組關(guān)聯(lián)研究(genomewide association studies,GWAS)和病例對(duì)照研究進(jìn)行 Meta 分析,以探討ERAP1是否與總體人群和不同種族亞群的AS易感性相關(guān)。研究目的通過(guò)Meta分析,確定ERAP1基因單核苷酸多態(tài)性是否與總體人群和不同種族亞群AS易感性之間的關(guān)系。研究方法1.一般資料主題詞采用“ankylosing spondylitis”、“ERAP1”和“polymorphism”,檢索Pubmed、Embase和Cochrane數(shù)據(jù)庫(kù),同時(shí)檢索相關(guān)自由詞。語(yǔ)種設(shè)置為英語(yǔ)。2.篩選方法按照提前制定好的文獻(xiàn)納入標(biāo)準(zhǔn)與剔除標(biāo)準(zhǔn)篩選文獻(xiàn)。每項(xiàng)研究均摘錄以下信息:第一作者,發(fā)表年份,研究人群的國(guó)家和種族,病例組和對(duì)照組的數(shù)量,ERAP1多態(tài)性的等位基因數(shù)量。采用Newcastle-Ottawascale(NOS)文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià)量表評(píng)價(jià)納入的研究的質(zhì)量。3.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析應(yīng)用Review Manager 5.3進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。使用OR值及其95%可信區(qū)間來(lái)作為效應(yīng)指標(biāo),進(jìn)行總體人群和按照種族劃分的人群亞組分析。使用I2來(lái)對(duì)異質(zhì)性進(jìn)行定量分析。對(duì)于存在明顯異質(zhì)性的數(shù)據(jù),再進(jìn)行敏感性分析。采用漏斗圖來(lái)分析發(fā)表偏倚。研究結(jié)果1.文獻(xiàn)檢索結(jié)果初步文獻(xiàn)檢索Pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)92篇,Embase數(shù)據(jù)庫(kù)21篇,Cochrane數(shù)據(jù)庫(kù)2篇,總計(jì)105篇。根據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn)和剔除標(biāo)準(zhǔn),經(jīng)過(guò)仔細(xì)閱讀文獻(xiàn)題目、摘要和全文,最終納入文獻(xiàn)31篇??偣舶?6291名AS患者和45779名健康人對(duì)照。2.Meta分析結(jié)果對(duì) rs27044,rs17482078,rs10050860,rs30187,rs2287987,rs27980,rs27037,rs27434,rs26653,rs1065407,rs27529,rs27582,rs469876,rs7711564,rs27038,rs3734016,rs11209032,rs26618,rs27895,rs17481856,rs13167972等共21個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行Meta分析,并按照地域和人種進(jìn)行亞組分析。結(jié)果顯示,rs27434的A等位基因在總體人群和高加索人群、中東人群、東亞人群中均為AS的危險(xiǎn)因素;rs27980、rs27582、rs469876、rs27038、rs11209032、rs26618、rs27895、rs17481856 SNP在總體人群中和各亞組人群中均與AS無(wú)明顯相關(guān)性;其余12個(gè)位點(diǎn)在總體人群和各亞組人群中與AS的相關(guān)性各有不同。在總體人群中,rs27434,rs17482078,rs10050860,rs30187,rs2287987,rs27037,rs26653,rs7711564和rs13167972 SNP與AS的易感性相關(guān)。在高加索人群中,rs27044,rs17482078,rs10050860,rs30187,rs2287987,rs27037,rs27434,rs26653,rs1065407,rs13167972 SNP與AS的易感性相關(guān)。在中東人群中,rs27044,rs27434,rs26653 SNP 與 AS 相關(guān)。在東亞人群中,rs30187,rs27037,rs27434,rs27529,rs7711564 SNP 與 AS 易感性相關(guān)。結(jié)論對(duì)目前已發(fā)表的有關(guān)ERAP1基因SNP與AS易感性關(guān)系的研究進(jìn)行Meta分析表明,ERAP1基因的單核苷酸多態(tài)性與總體人群、高加索人群、中東人群和東亞人群的AS易感性有關(guān),具體每個(gè)位點(diǎn)對(duì)AS易感性的影響大小在不同種族之間存在差異。對(duì)rs27434的功能注釋提示,其可能通過(guò)影響ERAP1的表達(dá)以及間接影響TNF的作用從而對(duì)AS易感性產(chǎn)生影響,但尚需進(jìn)一步研究以明確。下一步還需進(jìn)一步的種族特異性關(guān)聯(lián)研究來(lái)確定不同人群ERAP1的SNP與AS易感性的遺傳關(guān)系。

涂國(guó)勝[9](2020)在《內(nèi)皮素-1基因Lys198Asn和+138/ex1 ins/delA位點(diǎn)的多態(tài)性與江西部分漢族人群早發(fā)冠心病患者相關(guān)性研究及機(jī)制探討》文中進(jìn)行了進(jìn)一步梳理第一部分內(nèi)皮素-1基因Lys198Asn和+138/ex1 ins/del A多態(tài)性與江西部分漢族人群早發(fā)冠心病的相關(guān)性研究研究背景:人類內(nèi)皮素-1(ET-1)基因多態(tài)性與冠心?。–AD)密切相關(guān)。本研究旨在探討江西漢族人群中ET-1基因的兩個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)(+138 I/D和Lys198Asn)與早發(fā)冠心病(EOCAD)的關(guān)系,為地區(qū)人群CAD的早期診斷和預(yù)防提供一些新的思路。方法:通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)及基因測(cè)序法對(duì)88例EOCAD患者(男性≤55歲;女性≤60歲)和52例對(duì)照組的兩個(gè)SNPs位點(diǎn)(+138 I/D和Lys198Asn)進(jìn)行基因分型。同時(shí)行空腹抽血后檢測(cè)血脂、血糖及肝腎功能,收集受試對(duì)象血壓、身高、體重、吸煙等資料。用SPSS 17.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:(1)兩組患者中,除性別及年齡無(wú)差別外,EOCAD組患者的血脂、空腹血糖、血壓、體重指數(shù)及吸煙人群等均明顯高于對(duì)照組,兩組有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05);(2)ET-1基因+138I/D和Lys198Asn的多態(tài)性檢測(cè)符合Hardy-Weinberg平衡(p>0.05),表明所選取的受試對(duì)象來(lái)自一個(gè)較大的、處于隨機(jī)分配平衡狀態(tài)的群體,具有一定代表性;(3)EOCAD患者中,Lys198Asn位點(diǎn)的純合子G/G、T/T及雜合子G/T的基因型頻率分別為76.1%、2.3%及21.6%,T等位基因頻率為12.1%,對(duì)照組分別為92.3%、0%、7.7%及3.9%;(4)Fisher精確檢驗(yàn)表明,ET-1基因Lys198Asn的T等位基因(OR=3.38,P=0.02)和GT/TT基因型(OR=3.76,P=0.02)與EOCAD風(fēng)險(xiǎn)增加有明確的相關(guān)性,而+138I/D位點(diǎn)無(wú)論在基因型頻率還是等位基因頻率在兩組之間均為無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;(5)在EOCAD組內(nèi),多數(shù)CAD的高危因素與ET-1基因+138I/D和Lys198Asn的多態(tài)性關(guān)系不明顯;但吸煙患者中,攜帶有T等位基因的基因型的比例明顯高于攜帶G/G純合子,多元logistic回歸分析表明,吸煙是與EOCAD相關(guān)的唯一獨(dú)立變量(P<0.05)結(jié)論:Lys198Asn位點(diǎn)中Asn等位基因頻率與江西漢族人群中EOCAD的發(fā)病顯著相關(guān);吸煙能顯著增加攜帶Asn等位基因的江西漢族人群發(fā)生EOCAD的風(fēng)險(xiǎn);+138 I/D位點(diǎn)中的不同等位基因頻率與江西漢族人群EOCAD的發(fā)病無(wú)顯著相關(guān)性。第二部分Lys198Asn位點(diǎn)的Asn等位基因顯著增加江西漢族人群早發(fā)冠心病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的機(jī)制探討研究背景:Lys198Asn位點(diǎn)中的Asn等位基因頻率與江西漢族人群EOCAD發(fā)病有關(guān);為探討其可能機(jī)制,我們通過(guò)構(gòu)建體外表達(dá)載體分別過(guò)表達(dá)不同等位基因,明確Lys198Asn多態(tài)性對(duì)ET-1蛋白表達(dá)的影響。方法:根據(jù)第一部分實(shí)驗(yàn)結(jié)果,分別提取含Lys和Asn等位基因的DNA片段,再通過(guò)分子克隆技術(shù)與含有Flag標(biāo)簽的p GL3.0-Basic質(zhì)粒載體構(gòu)建重組質(zhì)粒;以脂質(zhì)體法分別轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞24小時(shí),同時(shí)以空載質(zhì)粒作為對(duì)照;加用不同濃度的TNF-α、IL-6和LPS與轉(zhuǎn)染質(zhì)粒后的HEK293T細(xì)胞共同孵育24小時(shí);應(yīng)用Western blot方法檢測(cè)細(xì)胞中ET-1蛋白含量;用SPSS 17.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,P<0.05有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:空載質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞后無(wú)外源ET-1蛋白表達(dá),而重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染后則有較高的外源ET-1蛋白表達(dá);無(wú)外源刺激時(shí),Lys198和Asn198質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組中的ET-1蛋白含量無(wú)明顯差異;在兩種濃度(10ng/m L和20ng/m L)的TNF-α或IL-6刺激下,Asn198質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組中的蛋白含量明顯高于Lys198質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組,有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05);在兩種濃度的LPS刺激下,兩組蛋白含量均升高,但兩組相比無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)論:ET-1基因中的rs5370位點(diǎn)的Asn等位基因較Lys等位基因能顯著促進(jìn)TNF-α和IL-6刺激下的ET-1蛋白表達(dá);ET-1基因中的rs5370位點(diǎn)的多態(tài)性不會(huì)影響LPS刺激下的ET-1蛋白表達(dá)含量;ET-1基因中的rs5370位點(diǎn)不同等位基因可能通過(guò)影響特定炎癥因子刺激誘導(dǎo)下ET-1蛋白表達(dá)量的不同,從而導(dǎo)致江西漢族人群早發(fā)CAD的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在明顯差異。

梁立婷[10](2020)在《IL-22基因多態(tài)性及其血清水平與廣西黑衣壯兒童哮喘的相關(guān)性研究》文中認(rèn)為目的:探討廣西黑衣壯人群IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性分布情況,并與不同民族、種族人群比較基因型頻率和等位基因頻率分布差異。方法:臨床收集115例廣西黑衣壯健康兒童作為研究對(duì)象,運(yùn)用SNa Pshot法對(duì)IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513四個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,通過(guò)Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢驗(yàn)研究樣本的群體代表性,最后采用SPSS22.0統(tǒng)計(jì)軟件分析實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),計(jì)數(shù)資料用頻率和構(gòu)成比表示,采用卡方檢驗(yàn)或fisher確切概率法比較廣西黑衣壯健康兒童不同性別單核苷酸多態(tài)性分布差異及與其他民族、種族人群比較基因型和等位基因頻率分布差異。結(jié)果:(1)廣西黑衣壯健康兒童IL-22基因rs1179251位點(diǎn)檢測(cè)到CC、CG、GG基因型,分布頻率分別為:46.1%、46.1%、7.8%。rs1179251基因型和等位基因與千人基因組計(jì)劃(1000 Genomes)數(shù)據(jù)庫(kù)中公布的非洲尼日利亞人群和歐洲人群比較,差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);但與北京漢族人群、日本人群相比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(2)rs2227485位點(diǎn)檢測(cè)到AA、AG、GG基因型,分布頻率分別為:24.3%、57.4%、18.3%。rs2227485位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率與1000 Genomes數(shù)據(jù)庫(kù)中的日本人群比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);但與北京漢族人群、非洲尼日利亞人群及歐洲人群比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(3)rs2227484位點(diǎn)檢測(cè)到AA、AG、GG基因型,分布頻率分別為:0.9%、18.3%、80.8%。rs2227484位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率與非洲尼日利亞人群和歐洲人群比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);但與北京漢族人群、日本人群相比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(4)rs2227513位點(diǎn)檢測(cè)到CT和TT兩種基因型,分布頻率分別為:7.8%、92.2%。rs2227513位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率與非洲尼日利亞人群和歐洲人群比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);與北京漢族人群比較,基因型分布頻率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),但等位基因分布頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);與日本人群比較,基因型及等位基因分布頻率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(5)廣西黑衣壯兒童IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性在男女性別分布間比較,差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論:廣西黑衣壯兒童IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性與其他民族、種族人群比較存在不同程度的差異。目的:研究廣西黑衣壯兒童IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性與支氣管哮喘的相關(guān)性,探討IL-22血清水平與支氣管哮喘的關(guān)系。方法:臨床收集121例廣西黑衣壯兒童支氣管哮喘患者和115例對(duì)照者作為本次研究的對(duì)象,運(yùn)用單堿基延伸(SNa Pshot)法對(duì)IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性進(jìn)行基因分型,使用Hardy-Weinberg遺傳平衡定律測(cè)試群體代表性,利用SPSS22.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)數(shù)資料用頻率和構(gòu)成比表示,通過(guò)logistic回歸分析基因多態(tài)性與哮喘遺傳易感性關(guān)聯(lián)程度。血清IL-22的表達(dá)水平用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)的方法(enzyme-linked immunosorben assay,ELISA)檢測(cè),計(jì)量資料用均值和標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,均值間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。P<0.05則認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:(1)rs1179251位點(diǎn)基因型、等位基因、顯性模型(CG+GG vs CC)在哮喘組和健康組間比較差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR:0.493,95%CI:0.285-0.853,P=0.011;OR:0.659,95%CI:0.437-0.993,P=0.046,OR=0.524,95%CI:0.321-0.881,P=0.015),校正年齡和性別后,差異均仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(2)rs2227485位點(diǎn)基因型、顯性模型在哮喘組和健康對(duì)照組間比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR:0.451,95%CI:0.249-0.815,P=0.008;AG+GG vs AA:OR=0.489,95%CI:0.279-0.857,P=0.012),經(jīng)性別和年齡校正后,差異仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(3)rs2227513位點(diǎn)的基因型和等位基因分布頻率在哮喘組和健康對(duì)照組間比較差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=0.198,95%CI:0.042-0.937,P=0.041;OR=0.205,95%CI:0.044-0.957,P=0.044),經(jīng)年齡和性別校正后,差異仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。(4)IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513四個(gè)位點(diǎn)存在連鎖不平衡。(5)單倍型分析結(jié)果顯示:G-G-G-T單倍型在哮喘組和對(duì)照組間分布差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR:0.648,95%CI:0.426-0.985,P=0.041)。(6)哮喘組血清IL-22平均水平明顯高于健康組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。而哮喘組中rs1179251位點(diǎn)CC基因型患兒血清的IL-22平均水平與CG/GG基因型患兒比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.674)。結(jié)論:(1)IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227513位點(diǎn)多態(tài)性可能與廣西黑衣壯兒童哮喘易感性相關(guān),rs1179251位點(diǎn)(CG基因型、G等位基因和顯性模型)、rs2227485位點(diǎn)(AG基因型和顯性模型)和rs2227513位點(diǎn)(CT基因型和C等位基因)均可能具有降低哮喘的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。(2)IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513四個(gè)位點(diǎn)存在連鎖不平衡,G-G-G-T單倍型可能具有降低哮喘的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。(3)血清IL-22的表達(dá)水平升高可能與廣西黑衣壯兒童哮喘發(fā)病相關(guān)。

二、基質(zhì)衍生因子1等基因多態(tài)性在人群中的分布(論文開(kāi)題報(bào)告)

(1)論文研究背景及目的

此處內(nèi)容要求:

首先簡(jiǎn)單簡(jiǎn)介論文所研究問(wèn)題的基本概念和背景,再而簡(jiǎn)單明了地指出論文所要研究解決的具體問(wèn)題,并提出你的論文準(zhǔn)備的觀點(diǎn)或解決方法。

寫法范例:

本文主要提出一款精簡(jiǎn)64位RISC處理器存儲(chǔ)管理單元結(jié)構(gòu)并詳細(xì)分析其設(shè)計(jì)過(guò)程。在該MMU結(jié)構(gòu)中,TLB采用叁個(gè)分離的TLB,TLB采用基于內(nèi)容查找的相聯(lián)存儲(chǔ)器并行查找,支持粗粒度為64KB和細(xì)粒度為4KB兩種頁(yè)面大小,采用多級(jí)分層頁(yè)表結(jié)構(gòu)映射地址空間,并詳細(xì)論述了四級(jí)頁(yè)表轉(zhuǎn)換過(guò)程,TLB結(jié)構(gòu)組織等。該MMU結(jié)構(gòu)將作為該處理器存儲(chǔ)系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)的一個(gè)重要組成部分。

(2)本文研究方法

調(diào)查法:該方法是有目的、有系統(tǒng)的搜集有關(guān)研究對(duì)象的具體信息。

觀察法:用自己的感官和輔助工具直接觀察研究對(duì)象從而得到有關(guān)信息。

實(shí)驗(yàn)法:通過(guò)主支變革、控制研究對(duì)象來(lái)發(fā)現(xiàn)與確認(rèn)事物間的因果關(guān)系。

文獻(xiàn)研究法:通過(guò)調(diào)查文獻(xiàn)來(lái)獲得資料,從而全面的、正確的了解掌握研究方法。

實(shí)證研究法:依據(jù)現(xiàn)有的科學(xué)理論和實(shí)踐的需要提出設(shè)計(jì)。

定性分析法:對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行“質(zhì)”的方面的研究,這個(gè)方法需要計(jì)算的數(shù)據(jù)較少。

定量分析法:通過(guò)具體的數(shù)字,使人們對(duì)研究對(duì)象的認(rèn)識(shí)進(jìn)一步精確化。

跨學(xué)科研究法:運(yùn)用多學(xué)科的理論、方法和成果從整體上對(duì)某一課題進(jìn)行研究。

功能分析法:這是社會(huì)科學(xué)用來(lái)分析社會(huì)現(xiàn)象的一種方法,從某一功能出發(fā)研究多個(gè)方面的影響。

模擬法:通過(guò)創(chuàng)設(shè)一個(gè)與原型相似的模型來(lái)間接研究原型某種特性的一種形容方法。

三、基質(zhì)衍生因子1等基因多態(tài)性在人群中的分布(論文提綱范文)

(1)MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與NAFLD及H.pylori感染在CEA、CA19-9、CA72-4水平中的交互作用和利用ciMICs衍生的類器官模擬消化道腫瘤的發(fā)生(論文提綱范文)

英漢縮略詞語(yǔ)對(duì)照
摘要
abstract
前言
    參考文獻(xiàn)
第一部分 MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和非酒精性脂肪肝與消化道腫瘤標(biāo)志物的關(guān)系及交互作用
    1 研究對(duì)象與方法
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二部分 MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和幽門螺桿菌感染與消化道腫瘤標(biāo)志物之間的關(guān)系及交互作用
    1 研究對(duì)象與方法
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第三部分 MTHFR rs1801133基因多態(tài)性和幽門螺桿菌感染合并非酒精性脂肪肝與消化道腫瘤標(biāo)志物之間的關(guān)系及交互作用
    1 研究對(duì)象與方法
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第四部分 利用條件永生化小鼠腸隱窩細(xì)胞(ciMICs)衍生的類器官模擬消化道腫瘤的發(fā)生
    1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
展望
文獻(xiàn)綜述 MTHFR基因多態(tài)性與常見(jiàn)消化道惡性腫瘤的關(guān)系
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文

(2)SDF-1α基因多態(tài)性與西北地區(qū)漢族人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究(論文提綱范文)

資料與方法
    一、一般資料
    二、基因多態(tài)性檢測(cè)
    三、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
結(jié) 果
    一、一般資料分析
    二、SDF-1α G801A基因多態(tài)性與胃癌易感性
    三、SDF-1α G801A與Hp感染
討 論

(3)基質(zhì)金屬蛋白酶-1、2水平及基因多態(tài)性在急性腦梗死表達(dá)及對(duì)預(yù)后的影響(論文提綱范文)

附錄
中文摘要
英文摘要
前言
材料與方法
    1.1 研究對(duì)象
        1.1.1 TOAST分型
        1.1.2 急性腦梗死組
        1.1.3 對(duì)照組
        1.1.4 知情同意書
    1.2 研究方法
        1.2.1 一般資料的收集
        1.2.2 危險(xiǎn)因素的定義
        1.2.3 嚴(yán)重的心、腎、肺、肝臟定義
        1.2.4 頸椎動(dòng)脈彩超檢查
        1.2.5 頭頸部CTA檢查
        1.2.6 頭頸部血管斑塊性質(zhì)判定
        1.2.7 試驗(yàn)對(duì)象抽血
        1.2.8 隨訪方案
        1.2.9 儀器設(shè)備與試劑
        1.2.10 血清MMP-1、MMP-2 的測(cè)定
        1.2.11 基因多態(tài)性
    1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
結(jié)果
    2.1 哈迪-溫伯格平衡檢驗(yàn)
    2.2 腦梗死患者與對(duì)照組一般資料比較
    2.3 腦梗死組和對(duì)照組患者4 個(gè)SNP的分布
    2.4 腦梗死危險(xiǎn)因素logistic分析
    2.5 入組病例基因交互作用GMDR模型
    2.6、MMP-2 rs243865 與MMP-1 rs1799750 基因交互模型圖(圖 1)
    2.7、MMP-2 rs243865 與MMP-1 rs1799750 組合基因交互效應(yīng)Logistic回歸分析
    2.8、腦梗死預(yù)后良好組與預(yù)后不良組在入院時(shí) NIHSS 評(píng)分及 mRS 評(píng)分比較
    2.9 腦梗死90 天隨訪預(yù)后良好組和預(yù)后不良組患者入院時(shí)血清MMP-1和MMP-2 水平比較
    2.10、 急性腦梗死患者血清 MMP-1 和 MMP-2 水平與治療 90 天后 mRS 得分的關(guān)系
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 金屬基質(zhì)蛋白酶 1、2 血清水平及其基因多態(tài)性與腦梗死的相關(guān)性研究
    參考文獻(xiàn)
致謝

(4)DPP4基因多態(tài)性與血脂及2型糖尿病合并冠心病的相關(guān)性研究(論文提綱范文)

摘要
Abstract
主要英文縮略詞表
一、引言
二、材料與方法
    1.研究對(duì)象
        1.1 入選及排除標(biāo)準(zhǔn)
        1.2 實(shí)驗(yàn)分組
    2.實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
        2.1 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
    3.研究方法
        3.1 一般資料收集及生化指標(biāo)測(cè)定
        3.2 外周血DNA提取
        3.3 標(biāo)簽SNP選擇
        3.4 聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增目的片段
        3.5 PCR產(chǎn)物檢驗(yàn)
        3.6 PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
    4.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
三、結(jié)果
    1.兩組患者一般資料及生化指標(biāo)比較
    2.DPP4 基因SNPs不同基因型及等位基因頻率分布
    3.對(duì)照組DPP4 基因SNPS基因型與血脂水平關(guān)系
        3.1 rs3788979
        3.2 rs4664443
        3.3 rs13015258
    4.DPP4 基因SNPs與T2DM合并CAD易感性的關(guān)聯(lián)分析
四、討論
五、結(jié)論
六、參考文獻(xiàn)
七、文獻(xiàn)綜述 DPP4基因組學(xué)與動(dòng)脈粥樣硬化相關(guān)研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
八、致謝

(5)中國(guó)高血壓患者醛固酮合成酶基因多態(tài)性與心血管疾病的相關(guān)性研究(論文提綱范文)

摘要
ABSTRACT
英文縮寫
引言
第一部分 醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與中國(guó)高血壓患者心腦血管事件的關(guān)系研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第二部分 醛固酮合成酶基因多態(tài)性與中國(guó)老年原發(fā)性高血壓患者左心室肥厚的相關(guān)性及與心血管事件和死亡關(guān)系的研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第三部分 醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性與中國(guó)高血壓患者房顫關(guān)系研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第四部分 醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多態(tài)性對(duì)中國(guó)高血壓患者使用血管緊張素受體拮抗劑影響的研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
結(jié)論
綜述 醛固酮合成酶(CYP11B2)基因多態(tài)性與心血管疾病關(guān)系的研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷

(6)整合素α2基因多態(tài)性及微小RNA作用于川崎病冠狀動(dòng)脈病變機(jī)制研究(論文提綱范文)

摘要
ABSTRACT
前言
第一章 整合素α2基因多態(tài)性與川崎病的相關(guān)性
    一、引言
    二、實(shí)驗(yàn)材料與方法
        1. 實(shí)驗(yàn)對(duì)象
        2. 主要儀器
        3. 主要試劑
        4. 引物
        5. 基因分型
        6. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    三、結(jié)果
        1. 研究人群的一般資料
        2. ITGA2基因多態(tài)性與川崎病的相關(guān)關(guān)系
        3. ITGA2 C807T與川崎病冠狀動(dòng)脈病變的分層分析
    四、討論
    五、結(jié)論
第二章 Micro RNAs與川崎病冠狀動(dòng)脈病變相關(guān)性
    一、引言
    二、研究對(duì)象、材料與方法
        1. 研究對(duì)象
        2. 研究主要儀器
        3. 引物設(shè)計(jì)
        4. miRNAs檢測(cè)
        5. 細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)
        6. Western-Blot實(shí)驗(yàn)
        7. miRNA預(yù)測(cè)靶基因
        8. 構(gòu)建psi-CHECK2載體
        9. 熒光素酶活性檢測(cè)
        10. 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)結(jié)果統(tǒng)計(jì)分析
    三、結(jié)果
        1、篩選明顯差異表達(dá)的miRNA
        2、miR-126生物學(xué)功能
        3. 差異miRNA的體外實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證
        4、miR-126的靶向調(diào)節(jié)基因SPRED1功能鑒定
    四、討論
    五、結(jié)論
第三章 大劑量IVIG治療時(shí)機(jī)對(duì)川崎病預(yù)后的影響
    一、引言
    二、研究對(duì)象與方法
        1. 研究對(duì)象
        2. 研究方法
        3. 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    三、結(jié)果
        1. 一般資料
        2. IVIG治療時(shí)間對(duì)KD冠狀動(dòng)脈病變的影響
        3. 影響KD合并冠狀動(dòng)脈病變危險(xiǎn)因素的logistic回歸分析
    四、討論
    五、結(jié)論
全文總結(jié)及研究展望
參考文獻(xiàn)
綜述: 川崎病與整合素基因多態(tài)性研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
附錄 主要縮略詞簡(jiǎn)表
成果
致謝

(7)APLP2基因變異體參與膽固醇代謝的分子機(jī)制及功能研究(論文提綱范文)

中英文縮略詞對(duì)照表
摘要
ABSTRACT
前言
第一部分 新疆地區(qū)人群膽固醇代謝相關(guān)基因APLP2 新突變位點(diǎn)的篩查及甲基化水平檢測(cè)
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 試劑、耗材和儀器設(shè)備
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
        1.4 質(zhì)量控制
        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
        1.6 技術(shù)路線圖
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第二部分 APLP2 基因新變異體參與膽固醇代謝的分子機(jī)制及功能研究
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 試劑耗材及儀器設(shè)備
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
        1.4 技術(shù)路線圖
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
第三部分 膽固醇代謝相關(guān)基因APLP2 與血脂異常的關(guān)聯(lián)性研究
    1 研究?jī)?nèi)容與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.3 質(zhì)量控制
        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
        1.5 技術(shù)路線圖
    2 結(jié)果
    3 討論
    4 小結(jié)
結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
綜述 APLP2在膽固醇代謝中的研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間獲得的學(xué)術(shù)成果
個(gè)人簡(jiǎn)歷
新疆醫(yī)科大學(xué)博士研究生學(xué)位論文導(dǎo)師評(píng)閱表

(8)TNF,GRN和ERAP1基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)性研究(論文提綱范文)

中文摘要
English Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第一部分 中國(guó)漢族人群TNF和GRN基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)性研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二部分 ERAP1基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎易感性關(guān)系的Meta分析
    前言
    研究方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表
外文論文Ⅰ (已發(fā)表)
外文論文Ⅱ

(9)內(nèi)皮素-1基因Lys198Asn和+138/ex1 ins/delA位點(diǎn)的多態(tài)性與江西部分漢族人群早發(fā)冠心病患者相關(guān)性研究及機(jī)制探討(論文提綱范文)

摘要
abstract
第一部分:內(nèi)皮素-1 基因Lys198Asn和+138/ex1 ins/delA多態(tài)性與江西漢族人群早發(fā)冠心病的相關(guān)性研究
    前言
    第1章 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.3 統(tǒng)計(jì)方法
    第2章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    第3章 討論
    第4章 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二部分:Lys198Asn位點(diǎn)的Asn等位基因顯著增加江西漢族人群早發(fā)冠心病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的機(jī)制探討
    前言
    第1章 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.3 統(tǒng)計(jì)方法
    第2章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    第3章 討論
    第4章 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
    參考文獻(xiàn)

(10)IL-22基因多態(tài)性及其血清水平與廣西黑衣壯兒童哮喘的相關(guān)性研究(論文提綱范文)

第一部分 :IL-22單核苷酸多態(tài)性在廣西黑衣壯人群中的分布特點(diǎn)
    摘要
    ABSTRACT
    英漢縮略詞對(duì)照表
    前言
    1 材料與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 主要實(shí)驗(yàn)試劑
        1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        1.4 實(shí)驗(yàn)方法
        1.4.1 血液標(biāo)本的采集
        1.4.2 裂解紅細(xì)胞
        1.4.3 提取DNA
        1.4.4 基因分型
        1.5 基因位點(diǎn)的選擇
        1.6 統(tǒng)計(jì)分析
    2 結(jié)果
        2.1 Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn)
        2.2 IL-22基因位點(diǎn)SNP分型結(jié)果
        2.3 IL-22基因SNPs位點(diǎn)在廣西黑衣壯人群中的分布
        2.4 廣西黑衣壯與不同地區(qū)、民族人群的IL-22基因多態(tài)性比較
    3 討論
第二部分 :IL-22基因多態(tài)性及其血清水平與廣西黑衣壯兒童哮喘的相關(guān)性研究
    摘要
    ABSTRACT
    英漢縮略詞對(duì)照表
    前言
    1 材料與方法
        1.1 研究對(duì)象
        1.2 標(biāo)本的采集和處理
        1.3 實(shí)驗(yàn)試劑
        1.4 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        1.5 實(shí)驗(yàn)方法
        1.5.1 裂解紅細(xì)胞
        1.5.2 提取DNA
        1.5.3 基因分型
        1.6 ELISA檢測(cè)IL-22血清的表達(dá)水平
        1.6.1 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
        1.6.2 實(shí)驗(yàn)步驟
        1.6.3 IL-22的ELISA實(shí)驗(yàn)步驟
        1.7 統(tǒng)計(jì)分析
    2 結(jié)果
        2.1 兩組研究對(duì)象一般臨床資料特征分析
        2.2 IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)基因型及等位基因頻率在哮喘組和健康組中的分布情況
        2.3 基因位點(diǎn)連鎖情況
        2.4 IL-22基因rs1179251、rs2227485、rs2227484和rs2227513位點(diǎn)組成的單倍型頻率在哮喘組和健康組中的分布情況
        2.5 血清IL-22表達(dá)水平在哮喘組和健康對(duì)照組間的比較
        2.6 哮喘組中血清IL-22表達(dá)水平在rs1179251位點(diǎn)不同基因型間比較
    3 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 IL-22與呼吸系統(tǒng)疾病相關(guān)的研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文及獲得的科研成果

四、基質(zhì)衍生因子1等基因多態(tài)性在人群中的分布(論文參考文獻(xiàn))

  • [1]MTHFR rs1801133基因多態(tài)性與NAFLD及H.pylori感染在CEA、CA19-9、CA72-4水平中的交互作用和利用ciMICs衍生的類器官模擬消化道腫瘤的發(fā)生[D]. 吳曉醒. 重慶醫(yī)科大學(xué), 2021
  • [2]SDF-1α基因多態(tài)性與西北地區(qū)漢族人群胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性研究[J]. 肖琪,普彥淞,都慶國(guó),段降龍,李曉帆,楊妮,薛飛. 中華普通外科學(xué)文獻(xiàn)(電子版), 2021(04)
  • [3]基質(zhì)金屬蛋白酶-1、2水平及基因多態(tài)性在急性腦梗死表達(dá)及對(duì)預(yù)后的影響[D]. 陳銀娟. 福建醫(yī)科大學(xué), 2021(02)
  • [4]DPP4基因多態(tài)性與血脂及2型糖尿病合并冠心病的相關(guān)性研究[D]. 傅伯論. 湖北醫(yī)藥學(xué)院, 2021(02)
  • [5]中國(guó)高血壓患者醛固酮合成酶基因多態(tài)性與心血管疾病的相關(guān)性研究[D]. 王立立. 河北醫(yī)科大學(xué), 2021(02)
  • [6]整合素α2基因多態(tài)性及微小RNA作用于川崎病冠狀動(dòng)脈病變機(jī)制研究[D]. 李偉. 南方醫(yī)科大學(xué), 2021(02)
  • [7]APLP2基因變異體參與膽固醇代謝的分子機(jī)制及功能研究[D]. 賈林·阿布扎力汗. 新疆醫(yī)科大學(xué), 2021(08)
  • [8]TNF,GRN和ERAP1基因多態(tài)性與強(qiáng)直性脊柱炎的關(guān)聯(lián)性研究[D]. 胡乃文. 山東大學(xué), 2020(04)
  • [9]內(nèi)皮素-1基因Lys198Asn和+138/ex1 ins/delA位點(diǎn)的多態(tài)性與江西部分漢族人群早發(fā)冠心病患者相關(guān)性研究及機(jī)制探討[D]. 涂國(guó)勝. 南昌大學(xué), 2020(08)
  • [10]IL-22基因多態(tài)性及其血清水平與廣西黑衣壯兒童哮喘的相關(guān)性研究[D]. 梁立婷. 右江民族醫(yī)學(xué)院, 2020(04)

標(biāo)簽:;  ;  ;  ;  ;  

基質(zhì)衍生因子 1 同基因多態(tài)性在人群中的分布
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